基于Logistic函数填充相似性矩阵的miRNA-疾病关联预测方法

    公开(公告)号:CN116189780A

    公开(公告)日:2023-05-30

    申请号:CN202310121993.7

    申请日:2023-02-14

    Abstract: 本发明提供基于Logistic函数填充相似性矩阵的miRNA‑疾病关联预测方法,包括以下步骤:S1:获取miRNA功能相似性MFS、疾病语义相似性DSS以及miRNA‑疾病邻接矩阵MD;S2:将MD矩阵每两行对应位相同且为1与不同的位个数作为Logistic函数的变量,计算出来的值用于填充MFS矩阵的0值处,填充后的矩阵为MS;S3:分别为MS和DS矩阵建立一个权重矩阵来进一步消除整体的噪声;S4:使用拉普拉斯正则化最小二乘法来挖掘潜在的miRNA‑疾病关联。本发明采用拉普拉斯正则化最小二乘法作为主方法,建立一个更好的度量标准来精确描述miRNA或疾病之间的相似关系,实现了更加准确的miRNA‑疾病的关联预测。

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