供聚合酶连锁反应的引物的设计方法及引物组合

    公开(公告)号:CN107429298B

    公开(公告)日:2021-02-19

    申请号:CN201680018913.3

    申请日:2016-03-30

    Inventor: 辻本尧之

    Abstract: 本发明提供一种供聚合酶连锁反应的引物的设计方法及引物组合,所述设计方法具有:对引物候选的碱基序列,在所比较的一部分序列包含上述引物候选的碱基序列的3’末端这样的条件下,以双序列进行局部比对,从而求出局部比对评分的局部比对工序;及对包含上述引物候选的碱基序列的3’末端的预先设定的序列长度的碱基序列,以双序列进行全局比对,从而求出全局比对评分的全局比对工序。

    供聚合酶连锁反应的引物的设计方法及引物组合

    公开(公告)号:CN107429298A

    公开(公告)日:2017-12-01

    申请号:CN201680018913.3

    申请日:2016-03-30

    Inventor: 辻本尧之

    Abstract: 本发明提供一种供聚合酶连锁反应的引物的设计方法及引物组合,所述设计方法具有:对引物候选的碱基序列,在所比较的一部分序列包含上述引物候选的碱基序列的3’末端这样的条件下,以双序列进行局部比对,从而求出局部比对评分的局部比对工序;及对包含上述引物候选的碱基序列的3’末端的预先设定的序列长度的碱基序列,以双序列进行全局比对,从而求出全局比对评分的全局比对工序。

    供多重PCR的引物的设计方法

    公开(公告)号:CN109790569A

    公开(公告)日:2019-05-21

    申请号:CN201780060242.1

    申请日:2017-09-07

    Inventor: 辻本尧之

    Abstract: 本发明提供一种供多重PCR的引物的设计方法,其重复进行针对少数目标区域的多重PCR试验,并划分为序列读取数的变异系数为阈值以上的目标区域组和小于阈值的目标区域组,对于各个组,制作横轴取为了对目标区域进行PCR扩增所使用的1对引物的平均Tm值、纵轴取目标区域数的直方图,计算引物设计时的Tm值范围的下限值及上限值,并设定所得到的Tm值范围,从而设计引物,由此可抑制多个单一细胞间的每个目标区域的扩增偏差。

    判定胎儿的基因状态的方法

    公开(公告)号:CN107429299A

    公开(公告)日:2017-12-01

    申请号:CN201680018965.0

    申请日:2016-03-30

    Abstract: 本发明提供一种判定胎儿的基因状态的方法,其具备:目的区域选择工序,从人类基因组上的区域选择用于判定基因状态的目的区域;从母血试样分离单细胞的工序;从单细胞提取基因组DNA的工序;将从单细胞提取的基因组DNA作为模板,利用以对目的区域进行PCR扩增的方式设计的引物组合,对目的区域进行PCR扩增的工序;及DNA测序工序,解读目的区域的PCR扩增产物的DNA碱基序列,以对目的区域进行PCR扩增的方式设计的引物组合通过供聚合酶连锁反应的引物组合的设计方法设计,该设计方法具有基于局部比对评分的第1阶段选拔工序及基于全局比对评分的第2阶段选拔工序。

    供多重PCR的引物的设计方法

    公开(公告)号:CN109804079A

    公开(公告)日:2019-05-24

    申请号:CN201780060312.3

    申请日:2017-09-07

    Inventor: 辻本尧之

    Abstract: 本发明提供一种供多重PCR的引物的设计方法,在通过对扩增候选区域设定优先序位来设计引物的结果是能够设计引物的扩增候选区域数未达到所需数量的情况下,能够在维持先前设定的优先序位的全局特征的同时重新进行引物的设计。

    供多重PCR的引物的设计方法

    公开(公告)号:CN109790537A

    公开(公告)日:2019-05-21

    申请号:CN201780060228.1

    申请日:2017-09-07

    Inventor: 辻本尧之

    Abstract: 本发明提供一种供多重PCR的引物的设计方法,其对同一染色体DNA上的扩增候选区域附加优先序位,按照上述优先序位设计用于对上述扩增候选区域进行PCR扩增的引物,其特征在于附加上述优先序位的方法。

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