公开(公告)号：CN101560480B

公开(公告)日：2012-10-24

申请号：CN200910006605.0

申请日：2009-01-24

Applicant: 复旦大学附属华山医院 ,  上海交通大学

Inventor： 吕元 ,  陈楠 ,  欧竑宇 ,  蒋晓飞 ,  李敏 ,  杨泽华 ,  魏取好 ,  李刚 ,  陈晓耘 ,  邓子新 ,  贺新义

IPC: C12N1/20 ,  C12R1/22

Abstract: 本发明属于微生物动物细胞系领域，涉及一株携带有与细菌生长有关的新基因组岛KpGI-2的肺炎克雷伯临床耐药菌株HS04160。已于2008年6月25日保藏，保藏单位：CGMCC，北京市朝阳区大屯路，中国科学院微生物研究所，保藏编号：CGMCC No.2558，分类命名：肺炎克雷伯菌Klebsiella pneumoniae。本发明通过对肺炎克雷伯临床耐药菌株的筛选，得到6.4kb的基因序列并证明其属新的基因组岛，细菌活细胞计数试验证明KpGI-2中携带的基因对细菌的生长分别具有促进/抑制作用，提示该基因组岛与细菌生长相关。本发明实验显示，KpGI-2参与了肺炎克雷伯临床菌株感染的致病过程。所述的的含有基因组岛KpGI-2的菌株对于肺炎克雷伯菌株的致病与耐药有着重要影响。

公开(公告)号：CN102517318A

公开(公告)日：2012-06-27

申请号：CN201110383168.1

申请日：2008-03-18

Applicant: 复旦大学附属华山医院

Inventor： 吕元 ,  杨泽华 ,  关明 ,  魏取好 ,  陈楠

IPC: C12N15/70 ,  C12R1/19

Abstract: 本发明属生物技术领域，涉及一种利用整合子系统定点、定向的基因重组方法，采用整合子系统作为工具，首先构建在多克隆位点两侧含有attC序列的工具载体，然后将目的基因克隆到该载体，目的基因在宿主菌表达整合酶的情况下，能够定点且定向地插入到大肠杆菌基因组DNA中的attI位点。本方法简便易行，不需要特殊的仪器和试剂，仅需要4天时间就可将目的基因插入到宿主菌的染色体DNA中。所述的整合子系统作为分子生物学工具具有良好的应用前景，可用于获取含有目的基因的大片段DNA；同时，目的基因插入到宿主染色体定点且定向的特性，有助于解决在基因治疗中目的基因插入基因组DNA的靶向性问题。

公开(公告)号：CN102453752A

公开(公告)日：2012-05-16

申请号：CN201010519944.1

申请日：2010-10-26

Applicant: 复旦大学附属华山医院 ,  复旦大学附属金山医院

Inventor： 蒋晓飞 ,  李刚 ,  王艳艳 ,  杜欣 ,  魏取好 ,  陈楠

IPC: C12Q1/68 ,  C12Q1/04

CPC classification number: Y02A50/451

Abstract: 本发明属于微生物检验领域，涉及运用高分辨率熔解曲线法对血流感染的细菌快速鉴定。本发明首先对血培养阳性的培养瓶进行涂片、革兰染色，区分阴性菌与阳性菌，然后针对阴性菌和阳性菌选择扩增16S不同片段，同时高分辨率熔解曲线方法分析。本发明针对血流感染常见的病原菌，包括金黄色葡萄球菌、表皮葡萄球菌、粪肠球菌、屎肠球菌、大肠埃希菌、肺炎克雷伯杆菌、鲍曼不动杆菌、铜绿假单胞菌、阴沟肠杆菌、粘质沙雷菌、产酸克雷伯杆菌，洛菲不动杆菌、产气肠杆菌、嗜麦芽窄食单胞菌、洋葱伯克霍尔德菌。本法能够快速、高效、准确的测定血流感染的常见病原菌，为后续的治疗提供有力的依据，争取宝贵的时间。

公开(公告)号：CN101560480A

公开(公告)日：2009-10-21

申请号：CN200910006605.0

申请日：2009-01-24

Applicant: 复旦大学附属华山医院 ,  上海交通大学

Inventor： 吕元 ,  陈楠 ,  欧竑宇 ,  蒋晓飞 ,  李敏 ,  杨泽华 ,  魏取好 ,  李刚 ,  陈晓耘 ,  邓子新 ,  贺新义

IPC: C12N1/20 ,  C12R1/22

Abstract: 本发明属于微生物动物细胞系领域，涉及一株携带有与细菌生长有关的新基因组岛KpGI－2的肺炎克雷伯临床耐药菌株HS04160。已于2008年6月25日保藏，保藏单位：CGMCC，北京市朝阳区大屯路，中国科学院微生物研究所，保藏编号：CGMCC No.2558，分类命名：肺炎克雷伯菌Klebsiella pneumoniae。本发明通过对肺炎克雷伯临床耐药菌株的筛选，得到6.4kb的基因序列并证明其属新的基因组岛，细菌活细胞计数试验证明KpGI－2中携带的基因对细菌的生长分别具有促进/抑制作用，提示该基因组岛与细菌生长相关。本发明实验显示，KpGI－2参与了肺炎克雷伯临床菌株感染的致病过程。所述的含有基因组岛KpGI－2的菌株对于肺炎克雷伯菌株的致病与耐药有着重要影响。

公开(公告)号：CN101280301A

公开(公告)日：2008-10-08

申请号：CN200810034791.4

申请日：2008-03-18

Applicant: 复旦大学附属华山医院

Inventor： 吕元 ,  杨泽华 ,  关明 ,  魏取好 ,  陈楠

IPC: C12N15/09 ,  C12N15/11 ,  C12N15/70 ,  C12Q1/68 ,  C12Q1/04

Abstract: 本发明属生物技术领域，涉及一种利用整合子系统定点、定向的基因重组方法，采用整合子系统作为工具，首先构建在多克隆位点两侧含有attC序列的工具载体，然后将目的基因克隆到该载体，目的基因在宿主菌表达整合酶的情况下，能够定点且定向地插入到大肠杆菌基因组DNA中的attI位点。本方法简便易行，不需要特殊的仪器和试剂，仅需要4天时间就可将目的基因插入到宿主菌的染色体DNA中。所述的整合子系统作为分子生物学工具具有良好的应用前景，可用于获取含有目的基因的大片段DNA；同时，目的基因插入到宿主染色体定点且定向的特性，有助于解决在基因治疗中目的基因插入基因组DNA的靶向性问题。