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公开(公告)号:CN117512116A
公开(公告)日:2024-02-06
申请号:CN202311675544.3
申请日:2023-12-07
Applicant: 复旦大学附属中山医院 , 上海普恩海汇医学检验所有限公司
Abstract: 本发明公开了一种用于胆管癌检测的生物标志物及其应用。本发明用于胆管癌检测的生物标志物组合,包含了DNA+RNA双水平检测肿瘤组织样本,检测广泛的遗传变异,包括单核苷酸变异(SNVs)、插入缺失(indels)、拷贝数变异(CNV)、基因融合(Fusion)以及微卫星不稳定(MSI),检测更全面;同时,生物标志物组合还包含了识别潜在样品混杂或污染的位点组合,可实现匹配和校对DNA+RNA样本,使得检测更准确;本发明的生物标志物组合可以用于胆管癌的诊断、治疗、预后等发生发展的各个阶段,为胆管癌的全面、系统化的检测和研究奠定了基础。
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公开(公告)号:CN117660655A
公开(公告)日:2024-03-08
申请号:CN202410064439.4
申请日:2024-01-16
Applicant: 复旦大学附属中山医院 , 上海普恩海汇医学检验所有限公司
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/686 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及一种一种检测微卫星不稳定性的生物标志物组合、试剂盒及应用,属于生物技术领域。通过本发明提供一种检测微卫星不稳定性的诊断试剂,所述的诊断试剂包括核苷酸序列如SEQ ID No.1至SEQ ID No.224所示的探针,通过本发明提供一种检测微卫星不稳定性的试剂盒,以及上述探针在在检测微卫星不稳定性的分析方法中的应用。本发明用于检测微卫星不稳定性的生物标志物组合覆盖位点广,检测更准确,检测方法灵敏度和特异性高。
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公开(公告)号:CN117844758A
公开(公告)日:2024-04-09
申请号:CN202410034019.1
申请日:2024-01-09
Applicant: 上海普恩海汇医学检验所有限公司
Abstract: 本申请公开了循环肿瘤细胞的分离和检测方法。其中,循环肿瘤细胞的分离方法包括:(i)向血液样品中加入红细胞特异性抗体和白细胞特异性抗体的组合,以使血液样品中红细胞和白细胞耦联在一起;(ii)去除步骤(i)得到的样品中耦联在一起的红细胞和白细胞;(iii)向步骤(ii)得到的样品中加入红细胞特异性抗体和血小板特异性抗体;和(iv)进一步去除步骤(iii)得到的样品中红细胞特异性抗体、血小板特异性抗体以及与其结合的红细胞和血小板。
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公开(公告)号:CN112662748B
公开(公告)日:2023-02-17
申请号:CN201910978670.3
申请日:2019-10-15
Applicant: 骏实生物科技(上海)有限公司 , 上海普恩海汇医学检验所有限公司
IPC: C12Q1/6869 , C12N15/11
Abstract: 本发明提供了用于评估单细胞DNA测序文库质量的24对引物,利用这24对引物对中的八对或更多对能够准确评估单细胞DNA测序文库的基因组完整性和均一性,进而指导单细胞DNA测序。本发明还提供了利用这24对引物对中的八对或更多对来评估单细胞DNA测序文库质量的方法和试剂盒。
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公开(公告)号:CN111793695A
公开(公告)日:2020-10-20
申请号:CN202010866899.0
申请日:2020-08-25
Applicant: 复旦大学附属肿瘤医院 , 上海普恩海汇医学检验所有限公司
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/6869 , G16B30/10
Abstract: 本申请公开了肠癌分子分型系统。该系统包括:(1)测序文库构建模块,用于从样品RNA构建测序文库;(2)定量测序模块,用于对所述测序文库进行定量和测序;(3)归一化模块,用于对定量和测序结果进行归一化;和(4)CMS分型模块,用于对归一化结果进行分子分型。
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公开(公告)号:CN117947166A
公开(公告)日:2024-04-30
申请号:CN202410127289.7
申请日:2024-01-30
Applicant: 复旦大学附属肿瘤医院 , 上海普恩海汇医学检验所有限公司
IPC: C12Q1/6886
Abstract: 本文提供了用于肠癌预后的标志物组、产品、系统及其用途。具体地,本文提供了一种用于评估对象的肠癌预后的产品或产品组,其包含用于检测来自对象的生物样品的标志物组的各标志物的试剂,所述标志物组具有以下14种基因标志物:IFIT3、CXCL13、STAT1、CXCL9、CA4、AQP8、SLC4A4、AREG、EREG、SPINK4、REG4、SFRP2、ZEB2和SFRP4。本文提供了低成本、高效率、高质量的肠癌预后评估手段。
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公开(公告)号:CN112662748A
公开(公告)日:2021-04-16
申请号:CN201910978670.3
申请日:2019-10-15
Applicant: 骏实生物科技(上海)有限公司 , 上海普恩海汇医学检验所有限公司
IPC: C12Q1/6869 , C12N15/11
Abstract: 本发明提供了用于评估单细胞DNA测序文库质量的24对引物,利用这24对引物对中的八对或更多对能够准确评估单细胞DNA测序文库的基因组完整性和均一性,进而指导单细胞DNA测序。本发明还提供了利用这24对引物对中的八对或更多对来评估单细胞DNA测序文库质量的方法和试剂盒。
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公开(公告)号:CN119361145A
公开(公告)日:2025-01-24
申请号:CN202411380252.1
申请日:2024-09-30
Applicant: 复旦大学附属中山医院
IPC: G16H50/30 , C12Q1/6886 , G16H50/70 , G06F18/27 , G06F18/2431 , G16B40/00 , G06N20/00
Abstract: 本申请涉及生物医学领域,公开了一种基于内镜下活检样本的分子特征预测结直肠肿瘤黏膜下深浸润可能性的模型的构建方法、系统、试剂盒以及应用该构建方法的电子设备和存储有计算机程序代码的计算机可读介质。该构建方法包括获取多个自变量,对多个自变量进行筛选和数据处理,并在回归模型训练过程中进一步筛选有效自变量,减少自变量的数量,同时通过相关性分析获得自变量之间的关系,采用具有替换关系的自变量进行替换和组合,得到多个预测模型。本申请的预测模型使用较少的有效自变量就可以获得较好的预测结果,预测效率高、适用范围广、成本低。
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公开(公告)号:CN111690733B
公开(公告)日:2022-08-26
申请号:CN202010573659.1
申请日:2020-06-22
Applicant: 复旦大学附属中山医院 , 骏实生物科技(上海)有限公司
Abstract: 本发明公开了一种激素性股骨头坏死易感基因panel,一种激素性股骨头坏死易感基因panel,其为包括下述587个人类基因组位点的基因集。本发明提供的基因检测panel可用于激素性股骨头坏死易感的诊断预后,具有基因覆盖度广,可移植性强,适用于新开发的检测平台。
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公开(公告)号:CN111690733A
公开(公告)日:2020-09-22
申请号:CN202010573659.1
申请日:2020-06-22
Applicant: 复旦大学附属中山医院 , 骏实生物科技(上海)有限公司
Abstract: 本发明公开了一种激素性股骨头坏死易感基因panel,一种激素性股骨头坏死易感基因panel,其为包括下述587个人类基因组位点的基因集。本发明提供的基因检测panel可用于激素性股骨头坏死易感的诊断预后,具有基因覆盖度广,可移植性强,适用于新开发的检测平台。
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