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公开(公告)号：CN113528619B
公开(公告)日：2023-03-17
申请号：CN202110918528.7
申请日：2021-08-11
Applicant: 复旦大学附属中山医院
IPC: C12Q1/6806
Abstract: 本发明涉及一种提取肺泡灌洗液全核酸的方法，包括以下步骤：1)肺泡灌洗液中加入Buffer CDL，以及蛋白酶K，消化处理；2)将消化处理后液体冷却至室温，加入Tracer，再加入预冷的异丙酮，混匀，离心处理，弃上清，留沉淀；3)往沉淀中加入Buffer CDB，在液面下加入BufferCDD，混匀；4)加入无水乙醇，涡旋振荡混匀；5)液体移入微量核酸吸附柱中，离心，倒掉收集管中的液体；6)往微量核酸吸附柱中加入Buffer CW1，离心，倒掉收集管中的液体；7)往微量核酸吸附柱中加入Buffer CW2，离心，倒掉收集管中的液体；8)换用新的收集管容纳微量核酸吸附柱，再离心；9)将微量核酸吸附柱套在离心管中，开盖孵育；10)往微量核酸吸附柱滴加Buffer CDE，闭盖孵育，离心，收集样品全核酸。
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公开(公告)号：CN118072821A
公开(公告)日：2024-05-24
申请号：CN202311824698.4
申请日：2023-12-28
Applicant: 复旦大学附属中山医院
Abstract: 本发明涉及一种用于神经内分泌肿瘤检测的基因组合及其获得方法与应用。本发明通过结合神经内分泌肿瘤分子分型的临床指南以及真实世界神经内分泌肿瘤分子特征的研究，聚焦神经内分泌肿瘤的遗传致病基因、驱动基因以及热点突变，针对不同原发部位的神经内分泌肿瘤的特征突变都有涵盖，提供了用于神经内分泌肿瘤检测的基因组合及其获得方法与应用。保证了检测结果的准确性和全面性；高深度测序，保证了低频基因突变的检出，提高突变检测的精准度。可以用于从神经内分泌肿瘤风险评估到辅助诊断、治疗、预后等肿瘤发生发展的各个阶段，基因检测和分析的成本更低。为神经内分泌肿瘤的全面、系统化的检测和研究奠定了基础。
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公开(公告)号：CN117512116A
公开(公告)日：2024-02-06
申请号：CN202311675544.3
申请日：2023-12-07
Applicant: 复旦大学附属中山医院 , 上海普恩海汇医学检验所有限公司
Abstract: 本发明公开了一种用于胆管癌检测的生物标志物及其应用。本发明用于胆管癌检测的生物标志物组合，包含了DNA+RNA双水平检测肿瘤组织样本，检测广泛的遗传变异，包括单核苷酸变异(SNVs)、插入缺失(indels)、拷贝数变异(CNV)、基因融合(Fusion)以及微卫星不稳定(MSI)，检测更全面；同时，生物标志物组合还包含了识别潜在样品混杂或污染的位点组合，可实现匹配和校对DNA+RNA样本，使得检测更准确；本发明的生物标志物组合可以用于胆管癌的诊断、治疗、预后等发生发展的各个阶段，为胆管癌的全面、系统化的检测和研究奠定了基础。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN116179711A
公开(公告)日：2023-05-30
申请号：CN202310252780.8
申请日：2023-03-16
Applicant: 复旦大学附属中山医院
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种用于检测NACC1‑NIPB融合基因的试剂盒和方法，该试剂盒包括用于检测NACC1‑NIPB融合基因的探针，选自序列分别如SEQ ID NO:5～35所示的NACC1‑NIPB‑Probe 1～31，其检测方法包括：提取待测样本RNA；从投入基因组DNA或gDNA片段化开始，扩增、加接头，得到具有片段DNA和带有UDI引物的通用接头；Illumina测序；荧光探针定量PCR反应；根据PCR反应的扩增结果判断检测结果。本发明为NACC1‑NIPB融合基因的筛查和定量检测提供新的方法，定量更准确，灵敏度更高，能够达到最低检测限0.01％，满足临床需要，大幅降低检测成本。
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公开(公告)号：CN114606302A
公开(公告)日：2022-06-10
申请号：CN202210363358.5
申请日：2022-04-08
Applicant: 复旦大学附属中山医院
IPC: C12Q1/6869 , C12Q1/6806
Abstract: 本发明公开了一种提取口腔黏膜核酸进行全基因组高通量测序的方法。本发明的方法包括：在采集的口腔黏膜样本中加入GT Buffer和蛋白酶K依次进行提取、裂解、离心后，采用仪器自动抽提口腔黏膜样本gDNA；将样本gDNA进行PCR片段化、末端修复加A，获得加A后的gDNA；将加A后的gDNA与接头连接，获得连接产物；将上述连接产物进行纯化后，上机测序。本发明还提供了一种提取口腔黏膜核酸进行全基因组高通量测序的试剂盒。本发明通过对口腔黏膜样本核酸抽提后进行全基因组高通量测序，具有采集方便、可以实现全自动化抽提核酸的优点，且无需抽取血液，属于无创检测，为临床病理研究提供了新的高效测序方法。
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公开(公告)号：CN113832146A
公开(公告)日：2021-12-24
申请号：CN202111347672.6
申请日：2021-11-15
Applicant: 复旦大学附属中山医院
IPC: C12N15/10 , C12Q1/6806
Abstract: 本发明提供了一种福尔马林固定石蜡包埋样本提取病原微生物核酸的方法，该方法包括如下步骤：向装有福尔马林固定石蜡包埋样本的离心管中加入二甲苯，离心；弃去离心管中的二甲苯，加入无水乙醇进行离心；弃去离心管中的无水乙醇，孵育直至无水乙醇全部蒸发；向离心管中加入超纯水，并吹打混匀至匀质；将匀质液澄清，再涡旋，加入洗脱缓冲液离心，纯化得到病原微生物核酸；本发明的病原微生物核酸宏基因的结果显示都在10％以下，经过宏基因高通量检测证实确实有效的方法，且去人源性的核酸能力极强，故本发明的福尔马林固定石蜡包埋样本提取病原微生物核酸的方法可以最大程度地去除人源背景，做到仅抽提病原微生物核酸的目的。
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公开(公告)号：CN113528619A
公开(公告)日：2021-10-22
申请号：CN202110918528.7
申请日：2021-08-11
Applicant: 复旦大学附属中山医院
IPC: C12Q1/6806
Abstract: 本发明涉及一种提取肺泡灌洗液全核酸的方法，包括以下步骤：1)肺泡灌洗液中加入Buffer CDL，以及蛋白酶K，消化处理；2)将消化处理后液体冷却至室温，加入Tracer，再加入预冷的异丙酮，混匀，离心处理，弃上清，留沉淀；3)往沉淀中加入Buffer CDB，在液面下加入BufferCDD，混匀；4)加入无水乙醇，涡旋振荡混匀；5)液体移入微量核酸吸附柱中，离心，倒掉收集管中的液体；6)往微量核酸吸附柱中加入Buffer CW1，离心，倒掉收集管中的液体；7)往微量核酸吸附柱中加入Buffer CW2，离心，倒掉收集管中的液体；8)换用新的收集管容纳微量核酸吸附柱，再离心；9)将微量核酸吸附柱套在离心管中，开盖孵育；10)往微量核酸吸附柱滴加Buffer CDE，闭盖孵育，离心，收集样品全核酸。
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公开(公告)号：CN219278164U
公开(公告)日：2023-06-30
申请号：CN202320006937.4
申请日：2023-01-03
Applicant: 复旦大学附属中山医院
Abstract: 本实用新型公开了一种方便移液的PCR八联管储存盒。本实用新型的PCR八联管储存盒包括通过铰链活动连接的盒盖和盒体，所述盒体包括并排设置的储存槽和加样槽，所述储存槽内设有储存架，所述储存架上设有8×12或8×24个PCR管插孔，所述储存槽的底部设有保温层。本实用新型将PCR八联管储存盒集方便移液和方便储存功能于一体，设置的加样槽可降低人工移液过程中的失误风险，便于实现不仅人工或全自动移液工作站分装等量试剂至PCR八连管内；整体结构的设计方便PCR八连管的冻存，此外，保温层的设计可以实现从冰箱取出后，常温下持续保温1～2h或更长时间，可以确保后续实验步骤的顺畅进行。
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