公开(公告)号：CN105238867A

公开(公告)日：2016-01-13

申请号：CN201510743453.8

申请日：2015-11-05

Applicant: 复旦大学

Inventor： 全哲学 ,  王建功 ,  杰马纳 ,  夏飞

IPC: C12Q1/68 ,  C12Q1/04

Abstract: 本发明属于生物分析技术领域，具体为一种同时分析氨氧化或甲烷氧化相关细菌群落结构的分析方法。本发明步骤为：设计能同时覆盖颗粒性甲烷氧化酶α亚基基因和氨氧化单加氧酶α亚基基因的高简并加tag引物；利用此引物对环境样品中提取的基因组DNA进PCR扩增；利用barcode标记的tag引物对纯化过的第一步PCR产物进行PCR扩增；对扩增序列进行测序，分析得到氨氧化或甲烷氧化相关细菌的群落结构特征。本方法的保真性经不同pmoA/amoA基因重组质粒混合实验的验证，故本方法能够在显著提高引物覆盖度的前提下提高PCR扩增效果，并真实反映环境样品中不同类群的分布，使得环境样品中氨氧化或甲烷氧化细菌群落结构分析更加完整。本方法也可应用于其它功能微生物群落结构分析。

公开(公告)号：CN105238867B

公开(公告)日：2019-10-15

申请号：CN201510743453.8

申请日：2015-11-05

Applicant: 复旦大学

Inventor： 全哲学 ,  王建功 ,  杰马纳 ,  夏飞

IPC: C12Q1/686 ,  C12Q1/04

Abstract: 本发明属于生物分析技术领域，具体为一种同时分析氨氧化或甲烷氧化相关细菌群落结构的分析方法。本发明步骤为：设计能同时覆盖颗粒性甲烷氧化酶α亚基基因和氨氧化单加氧酶α亚基基因的高简并加tag引物；利用此引物对环境样品中提取的基因组DNA进PCR扩增；利用barcode标记的tag引物对纯化过的第一步PCR产物进行PCR扩增；对扩增序列进行测序，分析得到氨氧化或甲烷氧化相关细菌的群落结构特征。本方法的保真性经不同pmoA/amoA基因重组质粒混合实验的验证，故本方法能够在显著提高引物覆盖度的前提下提高PCR扩增效果，并真实反映环境样品中不同类群的分布，使得环境样品中氨氧化或甲烷氧化细菌群落结构分析更加完整。本方法也可应用于其它功能微生物群落结构分析。