公开(公告)号：CN104131093A

公开(公告)日：2014-11-05

申请号：CN201410352942.6

申请日：2014-07-23

Applicant: 哈尔滨工程大学

Inventor： 冯伟兴 ,  廉德源 ,  刘晓龙 ,  宋锋飞 ,  贺波

IPC: C12Q1/68

CPC classification number: G06F19/22 ,  G06F19/28

Abstract: 本发明公开了DNA蛋白结合位点的DNase高通测序检测信号预处理方法。包括以下几个步骤：获取基因基本信息，和DNA蛋白结合位点的DNase-Seq高通测序检测数据和ChIP-Seq高通测序监测数据；对DNase-Seq高通测序检测数据质量评估，筛选出可信测序数据；将每条可信测序数据仅保留直接反映蛋白结合位点的测序起始位置；得到DNase-Seq检测样本数据集合；对DNase-Seq检测样本数据集合进行归一化处理；对DNase-Seq检测样本数据集合进行细分；分别从正面和背面两个方向对两个子集中数据进行纵向求和，完成操作。本发明大幅提高了DNA蛋白结合位点的识别精度和识别分辨率。

公开(公告)号：CN104131093B

公开(公告)日：2015-12-09

申请号：CN201410352942.6

申请日：2014-07-23

Applicant: 哈尔滨工程大学

Inventor： 冯伟兴 ,  廉德源 ,  刘晓龙 ,  宋锋飞 ,  贺波

IPC: C12Q1/68

Abstract: 本发明公开了DNA蛋白结合位点的DNase高通测序检测信号预处理方法。包括以下几个步骤：获取基因基本信息，和DNA蛋白结合位点的DNase-Seq高通测序检测数据和ChIP-Seq高通测序监测数据；对DNase-Seq高通测序检测数据质量评估，筛选出可信测序数据；将每条可信测序数据仅保留直接反映蛋白结合位点的测序起始位置；得到DNase-Seq检测样本数据集合；对DNase-Seq检测样本数据集合进行归一化处理；对DNase-Seq检测样本数据集合进行细分；分别从正面和背面两个方向对两个子集中数据进行纵向求和，完成操作。本发明大幅提高了DNA蛋白结合位点的识别精度和识别分辨率。