公开(公告)号：CN114790440A

公开(公告)日：2022-07-26

申请号：CN202210278071.2

申请日：2022-03-21

Applicant: 哈尔滨医科大学

Inventor： 宋盈 ,  孟祥宁 ,  蔡梦迪 ,  肖云 ,  傅松滨 ,  冯犇 ,  王利强 ,  关荣伟

IPC: C12N5/071 ,  C12N5/09 ,  C12Q1/6869 ,  C12N15/11 ,  C12Q1/6886

Abstract: 本发明公开了一种MTX耐药肿瘤细胞扩增子的进化和形成机制分析方法，涉及生物技术领域，可以针对MTX耐药且DHFR基因高度扩增的恶性肿瘤细胞，以断裂点接头序列为切入点，构建置信断裂点筛选模型，揭示扩增子的非线性进化过程和肿瘤耐药克隆进化的全过程，并揭示非同源修复机制介导扩增子的形成，从而为去除肿瘤细胞中DMs的形成或逆转肿瘤耐药提供关键靶点。

公开(公告)号：CN105950739A

公开(公告)日：2016-09-21

申请号：CN201610369364.6

申请日：2016-05-30

Applicant: 哈尔滨医科大学

Inventor： 庞达 ,  张显玉 ,  肖云 ,  魏巍

IPC: C12Q1/68 ,  C12N15/11

CPC classification number: C12Q1/6869 ,  C12Q1/6886 ,  C12Q2600/156 ,  C12Q2565/519 ,  C12Q2535/122 ,  C12Q2525/191

Abstract: 本发明公开了一种用于人乳腺癌循环肿瘤DNA检测的探针及其用途，属于疾病的诊断和防治领域。本发明设计了一种乳腺癌“selector”，它是由靶向乳腺癌相关基因突变区域的DNA片段组成。将乳腺癌患者循环肿瘤DNA(ctDNA)，用selector设计成的探针进行液相杂交捕获，高通量测序后，发现病人特异的癌症基因变异，并监测肿瘤负荷。与常规的检测手段相比，本发明具有非侵入性，且通量高、灵敏度和特异性好等特点，能更好地进行人乳腺癌的筛查和早期诊断，并应用于癌症的个体化治疗。

公开(公告)号：CN114621928A

公开(公告)日：2022-06-14

申请号：CN202210276646.7

申请日：2022-03-21

Applicant: 哈尔滨医科大学

Inventor： 宋盈 ,  孟祥宁 ,  蔡梦迪 ,  肖云 ,  傅松滨 ,  冯犇 ,  王利强 ,  关荣伟

IPC: C12N5/09 ,  C12N5/071 ,  C12Q1/6869 ,  C12Q1/6806 ,  G16B30/00 ,  G16B50/00

Abstract: 本发明公开了一种MTX耐药肿瘤细胞的高置信断裂点筛选方法，涉及生物技术领域，利用MTX作为主要治疗药物且易产生耐药性的恶性肿瘤的生物治疗提供新的研究方案，为有效对抗MTX耐药提供了科学的依据，针对MTX耐药且DHFR基因高度扩增的恶性肿瘤细胞，联合应用DELLY、LUMPY和CREST共同调取全基因组测序结构变异数据，并设定具体阈值及标准流程，提高断裂点的验证率，降低断裂点筛选的假阳性率和假阴性率，从而获得高度置信的断裂点合集，进而为研究肿瘤耐药细胞中扩增子的进化及形成机制，去除肿瘤细胞中DMs的形成或逆转肿瘤耐药提供依据。