公开(公告)号：CN106755433A

公开(公告)日：2017-05-31

申请号：CN201611237641.4

申请日：2016-12-28

Applicant: 厦门大学

Inventor： 李庆阁 ,  孙利 ,  许晔

IPC: C12Q1/68 ,  C12Q1/14 ,  C12R1/445

CPC classification number: C12Q1/689 ,  C12Q1/6858 ,  C12Q2600/156 ,  C12Q2531/113 ,  C12Q2563/107 ,  C12Q2527/107

Abstract: 一种二维编码的金黄色葡萄球菌分子分型方法，从MLST数据库获取金黄色葡萄球菌7个管家基因的各等位基因序列信息；利用Minimum SNPs软件将7个管家基因进行连锁，并计算筛选出对于提高分型分辨率具有最大贡献的15个SNPs位点；针对选出的SNPs位点合理设计探针和引物；建立实时PCR体系；在实时PCR仪上运行反应程序，产生3组菌株的熔点特征值；对3组菌株熔点特征值进行等位基因图谱转换，确定熔解类型，建立具有传输性的标准MLMT数据库；将MT的等位基因图谱转化为条形码，便于菌株信息记录和数据的电子快速读取，实现SNPs‑熔点特征值‑等位基因图谱‑MT类型‑条形码的一条完整的菌株数字化分型系统。