公开(公告)号：CN118335197B

公开(公告)日：2024-09-24

申请号：CN202410772925.1

申请日：2024-06-17

Applicant: 南方科技大学

Inventor： 李毅 ,  赵旭阳 ,  李骏垚 ,  樊青远 ,  戴菁 ,  刘荣辉

IPC: G16B30/10 ,  G16B30/20 ,  G16B40/00 ,  G16B50/00

Abstract: 本发明提供了一种基于纳米孔测序芯片的DNA数据存储方法，涉及DNA数据存储技术领域，包括有效载荷、引物序列、条形码序列和若干个均匀分布于有效载荷上的锚定序列；引物序列用于启动复合核酸分子的复制或扩增；条形码序列用于识别和追踪不同的DNA特异性序列；有效载荷用于承载拟存储数据的DNA序列；锚定序列用于过滤数据、重定位和扩充条形码序列空间大小。能够精准过滤纳米孔测序得到的长度>200bp的测序读段中的高插入和删除错误，提高准确性，解决了现有技术中方法无法对应用于高纳米孔测序的长度>200bp的测序读段中的高插入和删除错误进行有效处理的技术问题。

公开(公告)号：CN118335197A

公开(公告)日：2024-07-12

申请号：CN202410772925.1

申请日：2024-06-17

Applicant: 南方科技大学

Inventor： 李毅 ,  赵旭阳 ,  李骏垚 ,  樊青远 ,  戴菁 ,  刘荣辉

IPC: G16B30/10 ,  G16B30/20 ,  G16B40/00 ,  G16B50/00

Abstract: 本发明提供了一种基于纳米孔测序芯片的DNA数据存储方法，涉及DNA数据存储技术领域，包括有效载荷、引物序列、条形码序列和若干个均匀分布于有效载荷上的锚定序列；引物序列用于启动复合核酸分子的复制或扩增；条形码序列用于识别和追踪不同的DNA特异性序列；有效载荷用于承载拟存储数据的DNA序列；锚定序列用于过滤数据、重定位和扩充条形码序列空间大小。能够精准过滤纳米孔测序得到的长度>200bp的测序读段中的高插入和删除错误，提高准确性，解决了现有技术中方法无法对应用于高纳米孔测序的长度>200bp的测序读段中的高插入和删除错误进行有效处理的技术问题。

公开(公告)号：CN116083395A

公开(公告)日：2023-05-09

申请号：CN202211024823.9

申请日：2022-08-25

Applicant: 南方科技大学

Inventor： 刘荣辉 ,  李毅 ,  戴菁 ,  冯起顺

IPC: C12N9/14 ,  C12N15/55 ,  C12Q1/6869

Abstract: 本申请提供一种分子马达、构建体、核酸、载体、宿主细胞及其应用，涉及生物技术领域，本申请提供的分子马达由氨基酸序列构造而成，在结构上构造形成塔结构、销结构和钩结构，其中，塔结构中由短的双β折叠区和长的双α螺旋结构构成，销结构和钩结构由双β折叠片构造而成，其中销结构短小。构造而成的特殊结构一方面有利于核酸与分子马达的结合；另一方面，也会加快核酸在分子马达中的解旋速度，提高分子马达的解旋活性。该分子马达能够在宽温度范围(10‑50℃)、盐离子(0‑600mMNaCl)以及多种重金属离子溶液中行使DNA解链活性，对环境溶液具备广泛的适应性。该分子马达能够实现核苷酸的移动控速，可应用于纳米孔测序等领域。

公开(公告)号：CN116083393A

公开(公告)日：2023-05-09

申请号：CN202310140791.7

申请日：2023-02-14

Applicant: 南方科技大学

Inventor： 李毅 ,  刘荣辉 ,  王卓飞 ,  戴菁

IPC: C12N9/12 ,  C12N15/54 ,  C12Q1/6844 ,  C12Q1/6869 ,  C40B50/06

Abstract: 本发明公开了一种DNA装配分子机器及其应用，涉及分子生物技术领域。DNA装配分子机器包括掌结构域、2个末端插入结构域、拇指结构域、手指结构域和外切酶活性结构域。DNA装配分子稳定性好，适用于等温扩增。此外，上述DNA装配分子及其突变体具备在多种金属离子、不同温度下的DNA组装功能，可应用于纳米孔测序、单分子测序、RCA建库、环境检测和体外诊断。

公开(公告)号：CN115974984A

公开(公告)日：2023-04-18

申请号：CN202310095505.X

申请日：2023-01-17

Applicant: 南方科技大学

Inventor： 刘荣辉 ,  傅暘 ,  李毅 ,  张阔 ,  冯起顺 ,  代馨 ,  戴菁

IPC: C07K14/00 ,  C07K1/107 ,  C12Q1/6806 ,  C12Q1/6869 ,  G01N33/487 ,  G01N27/327

Abstract: 本申请提供一种双门孔道蛋白、孔道蛋白突变体、核苷酸序列及其应用，属于纳米孔单分子检测技术领域。双门孔道蛋白的氨基酸序列如SEQ IDNO.1所示。孔道蛋白突变体，孔道蛋白突变体的氨基酸序列为：SEQ IDNO.2所示序列、第一突变体序列或第二突变体序列。第一突变体序列和第二突变体序列分别为与SEQ ID NO.1以及SEQ ID NO.2同源性大于等于75％的序列。本申请的双门孔道蛋白和孔道蛋白突变体有利于提高待测物质的检测准确性、孔道蛋白的集成组装效果，也有利于有效对连续同一碱基序列进行检测，具有较佳的结构稳定性和电生理稳定性，也有利于促进跨孔道蛋白的待测物质待测物的有效捕获和/或易位。