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公开(公告)号:CN115974984A
公开(公告)日:2023-04-18
申请号:CN202310095505.X
申请日:2023-01-17
Applicant: 南方科技大学
IPC: C07K14/00 , C07K1/107 , C12Q1/6806 , C12Q1/6869 , G01N33/487 , G01N27/327
Abstract: 本申请提供一种双门孔道蛋白、孔道蛋白突变体、核苷酸序列及其应用,属于纳米孔单分子检测技术领域。双门孔道蛋白的氨基酸序列如SEQ IDNO.1所示。孔道蛋白突变体,孔道蛋白突变体的氨基酸序列为:SEQ IDNO.2所示序列、第一突变体序列或第二突变体序列。第一突变体序列和第二突变体序列分别为与SEQ ID NO.1以及SEQ ID NO.2同源性大于等于75%的序列。本申请的双门孔道蛋白和孔道蛋白突变体有利于提高待测物质的检测准确性、孔道蛋白的集成组装效果,也有利于有效对连续同一碱基序列进行检测,具有较佳的结构稳定性和电生理稳定性,也有利于促进跨孔道蛋白的待测物质待测物的有效捕获和/或易位。
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公开(公告)号:CN113470751A
公开(公告)日:2021-10-01
申请号:CN202110739359.0
申请日:2021-06-30
Applicant: 南方科技大学
Abstract: 本发明提供一种蛋白纳米孔氨基酸序列的筛选方法、蛋白纳米孔及其应用。所述筛选方法包括:评估双孔结构的特征序列,利用模型搜索与所述双孔结构的特征序列相匹配的氨基酸序列,去除冗余候选序列后进行定位和筛选,计算候选序列的匹配长度和包络长度,再进行配准得到与已知的蛋白纳米孔的相对失配关系,分析得到最终序列。通过该方法筛选得到的氨基酸序列形成的蛋白纳米孔与已知T2SS、T3SS以及T4SS的分泌素蛋白相似度较低,所述蛋白纳米孔特有的序列缩小了孔的内径,使其通道孔径较小且选择性较高,是一类新型的选择性较好的蛋白纳米孔,能够应用于在物质检测或海水淡化等多个领域。
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公开(公告)号:CN117417916A
公开(公告)日:2024-01-19
申请号:CN202311404316.2
申请日:2023-10-25
Applicant: 南方科技大学
Abstract: 本申请提供酪氨酸整合酶、核酸分子、载体、宿主细胞、应用、遗传操作工具,涉及基因技术领域。本申请提供一种新的酪氨酸整合酶,其氨基酸序列如SEQ ID NO.1所示,或SEQ ID NO.1所示的氨基酸序列经一个或多个氨基酸残基的取代、缺失或添加且具有相同活性的由SEQ ID NO.1衍生的蛋白质。该酪氨酸整合酶弥补现有可用于开发为遗传操作工具的整合酶系统匮乏的问题,与先前的研究相比,本申请方案不仅鉴定到了一个新的可用于开发为遗传操作工具的酪氨酸整合酶,还鉴定出了其配套的attP特异结合序列,且该酪氨酸整合酶还可用做分子marker协助筛选新的细菌毒素,具有重要的科学价值和经济价值。
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公开(公告)号:CN116425841A
公开(公告)日:2023-07-14
申请号:CN202310378732.3
申请日:2023-03-30
Applicant: 南方科技大学
Abstract: 本申请提供一种专一杀伤弧菌的抗菌蛋白、核酸分子、表达载体、宿主细胞、抗弧菌药物及应用,涉及药物蛋白筛选鉴定技术领域。本申请提供的专一杀伤弧菌的抗菌蛋白TseV,氨基酸序列如SEQ ID NO.1所示,通过实验证明TseV具有高效且专一杀伤弧菌微生物的特性,可以应用于临床治疗弧菌感染或治疗水产养殖业弧菌感染,可避免对宿主和宿主菌群产生负面影响,具有重要的社会价值和经济价值。
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公开(公告)号:CN119119299A
公开(公告)日:2024-12-13
申请号:CN202411290646.8
申请日:2024-09-14
Applicant: 南方科技大学
IPC: C07K19/00 , C12Q1/6869
Abstract: 本申请涉及一种双门控纳米孔蛋白的修饰方法和测序用双门控纳米孔蛋白及其应用,属于生物技术领域。一种双门控纳米孔蛋白的修饰方法,包括:在双门控纳米孔的β桶的相邻两个β折叠片上分别插入x1L2x3L4x5氨基酸序列和x6L7x8L9x10氨基酸序列,其中,x1L2x3L4x5氨基酸序列和x6L7x8L9x10氨基酸序列均包括2‑20个氨基酸,其中包括至少两个疏水性氨基酸;且双门控纳米孔的感应区至少两个氨基酸被极性氨基酸取代。经修饰获得的测序用双门控纳米孔蛋白,可以在片上大规模集成,以形成稳定、均匀的孔道,具有高效的测序性能。
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公开(公告)号:CN113470751B
公开(公告)日:2024-09-20
申请号:CN202110739359.0
申请日:2021-06-30
Applicant: 南方科技大学
Abstract: 本发明提供一种蛋白纳米孔氨基酸序列的筛选方法、蛋白纳米孔及其应用。所述筛选方法包括:评估双孔结构的特征序列,利用模型搜索与所述双孔结构的特征序列相匹配的氨基酸序列,去除冗余候选序列后进行定位和筛选,计算候选序列的匹配长度和包络长度,再进行配准得到与已知的蛋白纳米孔的相对失配关系,分析得到最终序列。通过该方法筛选得到的氨基酸序列形成的蛋白纳米孔与已知T2SS、T3SS以及T4SS的分泌素蛋白相似度较低,所述蛋白纳米孔特有的序列缩小了孔的内径,使其通道孔径较小且选择性较高,是一类新型的选择性较好的蛋白纳米孔,能够应用于在物质检测或海水淡化等多个领域。
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公开(公告)号:CN112980832A
公开(公告)日:2021-06-18
申请号:CN202110444181.7
申请日:2021-04-23
Applicant: 南方科技大学
IPC: C12N15/10
Abstract: 本发明公开了一种核酸的提取方法以及用于核酸提取的试剂盒,涉及核酸提取技术领域,该提取方法包括采用裂解液对样本进行裂解,裂解液包括工作浓度为0.5~6M的强离子性离液盐、工作浓度为0.5v/v%~10v/v%的表面活性剂、工作浓度10v/v%~50v/v%的醇溶液;该裂解液在无需采用蛋白酶K的情况下,即可有效稳定地裂解样本,且裂解过程无需加热,在常温反应的条件下即可完成核酸的有效提取,此外,该提取方法通过在裂解样本时加入磁珠,实现裂解和结合一步完成,在保证提取质量的同时,提高了提取效率,简化了操作流程。
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