基于深度学习的多层次生物分子网络构建方法

    公开(公告)号:CN117912573B

    公开(公告)日:2024-05-17

    申请号:CN202410303148.6

    申请日:2024-03-18

    Applicant: 南开大学

    Abstract: 本发明涉及生物分子网络构建技术领域,具体为基于深度学习的多层次生物分子网络构建方法。本发明中,从公共数据库中收集生物分子数据,生物分子数据包括蛋白质作用数据、基因表达数据、代谢途径数据和蛋白质结构数据,利用基于图的聚类算法模型,根据蛋白质作用数据和基因表达数据进行生物分子网络的建构,利用基于系统生物学的模型,根据代谢途径数据和蛋白质结构数据进行生物分子网络的建构,计算基两者生物分子网络的平均最短路径长度,将两者的长度进行比对,根据比对结果进行最终生物分子网络的确定以及对基于图的聚类算法模型和基于系统生物学的模型的优化。

    基于深度学习的海洋生物智能检测方法

    公开(公告)号:CN117911793B

    公开(公告)日:2024-05-17

    申请号:CN202410302058.5

    申请日:2024-03-18

    Applicant: 南开大学

    Abstract: 本发明涉及海洋生物检测技术领域,具体为基于深度学习的海洋生物智能检测方法。本发明中,从公共数据库中收集不同的海洋生物图像数据,海洋生物图像数据包括不同的种类、环境和角度的图像数据,并接收用户发送的待检测的海洋生物图像数据,利用卷积神经网络算法根据不同的海洋生物图像数据进行模型的构建,构建好的模型对待检测的海洋生物图像数据进行海洋生物种类和预测概率的检测,利用生成对抗网络算法根据不同的海洋生物图像数据进行模型的构建,构建好的模型对待检测的海洋生物图像数据进行海洋生物种类和预测概率的检测,比较卷积神经网络算法和生成对抗网络算法检测结果,根据检测结果的一致性来确定最终结果以及优化处理。

    线粒体分离纯化方法
    3.
    发明公开

    公开(公告)号:CN115948462A

    公开(公告)日:2023-04-11

    申请号:CN202211010200.6

    申请日:2022-08-23

    Applicant: 南开大学

    Abstract: 本发明公开一种线粒体分离纯化方法,构建能够产生连接有标签的线粒体的细胞,破碎研磨后,采用能够连接标签的磁珠结合研磨液中的线粒体,洗脱后得到纯化线粒体。本发明的有益效果是:采用匀浆研磨的方法,降低了分离得到的线粒体中细胞碎块的含量,通过磁珠结合洗脱的方式,能够大幅提高线粒体的纯度;本方案中无需使用超高速离心机,该方法适用范围较广,操作简便易行,具有很强的可操作性和实用性;另外通过本方案分离得到的线粒体,能够最大限度保留线粒体功能和活性,为后续研究提供稳定的研究基础。

    基于深度学习的多层次生物分子网络构建方法

    公开(公告)号:CN117912573A

    公开(公告)日:2024-04-19

    申请号:CN202410303148.6

    申请日:2024-03-18

    Applicant: 南开大学

    Abstract: 本发明涉及生物分子网络构建技术领域,具体为基于深度学习的多层次生物分子网络构建方法。本发明中,从公共数据库中收集生物分子数据,生物分子数据包括蛋白质作用数据、基因表达数据、代谢途径数据和蛋白质结构数据,利用基于图的聚类算法模型,根据蛋白质作用数据和基因表达数据进行生物分子网络的建构,利用基于系统生物学的模型,根据代谢途径数据和蛋白质结构数据进行生物分子网络的建构,计算基两者生物分子网络的平均最短路径长度,将两者的长度进行比对,根据比对结果进行最终生物分子网络的确定以及对基于图的聚类算法模型和基于系统生物学的模型的优化。

    基于深度学习的海洋生物智能检测方法

    公开(公告)号:CN117911793A

    公开(公告)日:2024-04-19

    申请号:CN202410302058.5

    申请日:2024-03-18

    Applicant: 南开大学

    Abstract: 本发明涉及海洋生物检测技术领域,具体为基于深度学习的海洋生物智能检测方法。本发明中,从公共数据库中收集不同的海洋生物图像数据,海洋生物图像数据包括不同的种类、环境和角度的图像数据,并接收用户发送的待检测的海洋生物图像数据,利用卷积神经网络算法根据不同的海洋生物图像数据进行模型的构建,构建好的模型对待检测的海洋生物图像数据进行海洋生物种类和预测概率的检测,利用生成对抗网络算法根据不同的海洋生物图像数据进行模型的构建,构建好的模型对待检测的海洋生物图像数据进行海洋生物种类和预测概率的检测,比较卷积神经网络算法和生成对抗网络算法检测结果,根据检测结果的一致性来确定最终结果以及优化处理。

    基于TIP-1-多肽相互作用的新型分子胶水

    公开(公告)号:CN114656549A

    公开(公告)日:2022-06-24

    申请号:CN202210502251.4

    申请日:2022-05-10

    Applicant: 南开大学

    Abstract: 本发明公开一种基于TIP‑1‑多肽相互作用的新型分子胶水及其在蛋白非共价偶联中的应用,分子胶水包括能够特异性结合的TIP‑1蛋白和β‑catenin蛋白的C末端多肽,经测试可知,二者的亲和力达到了0.41μM,TIP‑1蛋白能够以异常高的亲和力专一性地结合β‑catenin蛋白的C末端多肽;将分子胶水的两个组分分别连接在两个待连接的蛋白上,则能够实现这两个蛋白的非共价偶联,尤其用于疏水特性显著的膜蛋白时,也能够实现高效特异性的非共价偶联,从而介导膜蛋白复合物中不同组分之间的相互作用。

    一种高灵敏度快速SDS-PAGE蛋白胶染色液

    公开(公告)号:CN111474032A

    公开(公告)日:2020-07-31

    申请号:CN202010442234.7

    申请日:2020-05-22

    Applicant: 南开大学

    Abstract: 本发明的一种高灵敏度快速SDS-PAGE蛋白胶染色液,每500ml染色液由以下份量的材料制备而成:糊精5g~10g;考马斯亮蓝G-250 25mg~75mg;无水乙醇40ml~60ml;磷酸40ml~60ml;余量为纯化水。本发明的染色液毒性小,在配制和使用过程中能够有效减少对操作人员的危害,以及避免对实验环境带来污染;操作过程十分简单,仅需将蛋白胶浸泡在染色液中,然后置于摇床上染色即可看到条带,无需进行固定和脱色处理;灵敏度高,染色20分钟可分辨凝胶中30ng的蛋白条带;反应迅速,蛋白量达6μg时,仅需1分钟就可以显出条带。

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