公开(公告)号：CN119479796A

公开(公告)日：2025-02-18

申请号：CN202410792632.X

申请日：2024-06-19

Applicant: 南京邮电大学

Inventor： 郭丽 ,  赵鑫淼 ,  金佳铭

IPC: G16B20/50 ,  G16B30/00 ,  G16B40/30 ,  G06F18/2321

Abstract: 本发明属于生物信息技术领域，具体涉及一种基于平面距离的簇突变检测方法及装置，本发明通过对样本数据分析得到聚类条件分界值、确定范围参数及突变参数、处理待测样本数据并合并簇得到聚类结果、对结果验证；本发明基于平面的距离识别进行聚类，采用完全不同的簇突变识别算法，相比于已有的多重滑动窗口，此算法拥有更高性能和更高的识别精度，且基于Java开发的算法只需提供API便可以方便地进行网页在线检测，不需要配置或下载任何配套环境或软件，极大地提高了便捷程度。

公开(公告)号：CN118116452A

公开(公告)日：2024-05-31

申请号：CN202311362572.X

申请日：2023-10-19

Applicant: 南京邮电大学

Inventor： 郭丽 ,  窦宇阳 ,  向阳洋 ,  金佳铭 ,  赵鑫淼 ,  任玉杰 ,  任得康

IPC: G16B15/30 ,  G16B40/00

Abstract: 本发明公开了一种合成致死基因组合的预测方法及系统，1集中预测方法包括获取基因组合；基于双尾Wilcoxon秩和检验和Spearman相关性分析，利用基因组合获得基因组合的第一特征；基于igraph包的相关函数，利用基因组合获得基因组合的第二特征；基于GO语义相似性，利用基因组合评估基因组合的基因间的细胞组成、分子功能以及生物过程相似性，以获得基因组合的第三特征；基于OCSVM模型，利用基因组合和基因组合的各特征确定基因组合是否具有合成致死相互作用，以预测所述基因组合是否为合成致死基因组合；其中，igraph包的相关函数包括closeness、eccentricity以及page.rank。本发明能够预测基因组合是否为合成致死基因组合。