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公开(公告)号：CN116200513A
公开(公告)日：2023-06-02
申请号：CN202310324368.2
申请日：2023-03-30
Applicant: 南京医科大学
IPC: C12Q1/689 , C12Q1/6851 , C12Q1/6806 , C12N15/11 , C12R1/01
Abstract: 本发明公开了一种粪便样本中瘤胃球菌(Ruminococcus)分类检测的一步式qPCR分类方法。所述一步式qPCR分类方法包括瘤胃球菌荧光定量PCR引物组、高耐受的扩增酶、粪便菌群核酸释放技术、瘤胃球菌qPCR检测方法。所述瘤胃球菌荧光定量PCR引物组根据活泼瘤胃球菌的16S rRNA基因组序列自行设计。所述分类方法为非核酸提取qPCR方法，可提高瘤胃球菌检测的灵敏度。本方法可用于粪便样本中的瘤胃球菌快速、灵敏检测，更利于瘤胃球菌的便捷分类，有助于肠道健康管理。
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公开(公告)号：CN114283890B
公开(公告)日：2023-04-07
申请号：CN202111533823.7
申请日：2021-12-15
Applicant: 南京医科大学
Abstract: 本发明涉及一种基于瘤胃球菌微生物群的疾病风险预测装置，获取肠道菌群相对丰度信息；确定样本分类变量数据；将肠道菌群特征数据和分类变量输入机器学习模型中进行训练，得到疾病风险预测模型；利用网格搜索算法进行参数调整；进行测试；进行性能评价；利用性能评价合格的疾病风险预测模型进行疾病风险预测。其优点在于，通过瘤胃球菌微生物群及样本相关信息可以对多种疾病风险进行预测，获取简单，不会对被检测者造成创伤；利用随机森林模型从复杂繁多的生物大数据中筛选用于预测多种疾病风险的、无创的生物标志物，提高预测准确率，弥补了不同疾病临床预警的空白；预测方法简单快捷，效率高，可以快速指引或辅助被检测人群进行后续处理。
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公开(公告)号：CN118006452A
公开(公告)日：2024-05-10
申请号：CN202410288893.8
申请日：2024-03-14
Applicant: 南京医科大学
IPC: C12M1/34 , C12M1/00 , C12Q1/6851 , B01L3/00
Abstract: 本发明公开了一种用于样本高通量分型检测的离心式数字PCR芯片，其包括圆形的芯片本体，芯片本体内开设有有中轴安装孔，芯片本体上分为两个以上的扇形区域，每个扇形区域上从中心到外缘依次设置有缓液池、储液池和微滴生成单元，缓液池的进口处设有加样孔，储液池采用弧形槽结构，储液池上设有朝向芯片本体外缘的出液口，出液口至少有两个且在弧形槽上间隔分布，每个出液口上分别连接有微滴生成单元，每个微滴生成单元包括由芯片本体中心到外缘依次连通的第一微流控通道、引物室、第二微流控通道、微滴生成池和油相收集池，微滴生成池的侧面设有。本发明通过多个相互独立且密封的引物室存放不同引物，实现样本与多种不同引物的自动分配混合。
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公开(公告)号：CN114283890A
公开(公告)日：2022-04-05
申请号：CN202111533823.7
申请日：2021-12-15
Applicant: 南京医科大学
Abstract: 本发明涉及一种基于瘤胃球菌微生物群的疾病风险预测方法及装置，获取肠道菌群相对丰度信息；确定样本分类变量数据；将肠道菌群特征数据和分类变量输入机器学习模型中进行训练，得到疾病风险预测模型；利用网格搜索算法进行参数调整；进行测试；进行性能评价；利用性能评价合格的疾病风险预测模型进行疾病风险预测。其优点在于，通过瘤胃球菌微生物群及样本相关信息可以对多种疾病风险进行预测，获取简单，不会对被检测者造成创伤；利用随机森林模型从复杂繁多的生物大数据中筛选用于预测多种疾病风险的、无创的生物标志物，提高预测准确率，弥补了不同疾病临床预警的空白；预测方法简单快捷，效率高，可以快速指引或辅助被检测人群进行后续处理。
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公开(公告)号：CN111896762A
公开(公告)日：2020-11-06
申请号：CN202010631415.4
申请日：2020-07-03
Applicant: 江苏省人民医院(南京医科大学第一附属医院)
Abstract: 本发明公开了一种鼻咽拭子标本病毒核酸混样检测自动混样装置，其包括样本盒和收集盒，样本盒内设有间隔设置的隔板，隔板将样本盒内部空间分隔成三个以上的独立腔室，一个腔室作为检测管，其余腔室作为采样管，检测管和各采样管的顶部均设有管盖，所述收集盒连接在样本盒的下半部分并紧贴检测管和各采样管，每个采样管和收集盒之间的壁面上分别开设有溢出孔，溢出孔供采样管中的液体溢出到收集盒内，检测管和收集盒之间的壁面上开设有进样孔，收集盒内设有供液体从溢出孔流向进样孔的收集槽。混样检测前，只需要装置整体朝向收集盒的方向倾斜，各样本管内的标本由溢出孔溢出，然后样本经收集槽由进样孔流入检测管，从而实现自动混样。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN116606945A
公开(公告)日：2023-08-18
申请号：CN202310324413.4
申请日：2023-03-30
Applicant: 南京医科大学
IPC: C12Q1/689 , C12Q1/6851 , C12Q1/6806 , C12N15/11 , C12R1/01
Abstract: 本发明公开了一种粪便样本中活泼瘤胃球菌的非核酸提取式qPCR检测方法，免核酸提取步骤，并优化了包括扩增酶、活泼瘤胃球菌荧光定量PCR反应体系和反应条件，可以检测出活泼瘤胃球菌，用于快速、准确地检测肠样本中的活泼瘤胃球菌。
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公开(公告)号：CN116240099A
公开(公告)日：2023-06-09
申请号：CN202310318552.6
申请日：2023-03-29
Applicant: 南京医科大学
Abstract: 本发明公开了一种可拆的液滴式数字PCR芯片，设计离心式微流控液滴生成装置，属于微流控技术领域。装置整体呈CD状，由中心圆形固定装置和液滴生成装置两部分构成，所述液滴生成装置包括8个反应单元。设置油相通道，只要在三个油相加样口一次性加入含活性剂的油相，减少油相加样操作次数。在水相加样口加入样本，在离心作用下，样本和油相在十字交叉处汇合，被切割为单分散液滴。由于十字交叉处的直径各有差异，每个反应单元可得到不同体积的液滴，满足多体积数字PCR的检测需求。液滴经导管进入下方三角形液体储存腔，三角形液体储存腔为包括可密封活塞的可拆卸设计，利于液滴的转移与保存。
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公开(公告)号：CN114574542B
公开(公告)日：2023-01-31
申请号：CN202111532604.7
申请日：2021-12-15
Applicant: 南京医科大学
Abstract: 本发明提出一种瘤胃球菌微生物群评估生物年龄或生物老化的用途，所述瘤胃球菌微生物群包括Ruminococcaceae科Ruminococcus属的R.flavefaciens种、R.albus种、和R.bromii种；以及Ruminococcaceae科Faecalibacterium属的F.prausnitzii种；以及Lachnospiraceae科Ruminococcus属的R.gnavus种、R.lactaris种、和R.obeum种，从生物学角度为评估生物年龄或衰弱提供了途径。
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公开(公告)号：CN114574542A
公开(公告)日：2022-06-03
申请号：CN202111532604.7
申请日：2021-12-15
Applicant: 南京医科大学
Abstract: 本发明提出一种瘤胃球菌微生物群评估生物年龄或生物老化的用途，所述瘤胃球菌微生物群包括Ruminococcaceae科Ruminococcus属的R.flavefaciens种、R.albus种、和R.bromii种；以及Ruminococcaceae科Faecalibacterium属的F.prausnitzii种；以及Lachnospiraceae科Ruminococcus属的R.gnavus种、R.lactaris种、和R.obeum种，从生物学角度为评估生物年龄或衰弱提供了途径。
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公开(公告)号：CN111855370A
公开(公告)日：2020-10-30
申请号：CN202010596891.7
申请日：2020-06-28
Applicant: 江苏省人民医院(南京医科大学第一附属医院)
Abstract: 本发明公开了一种病毒核酸非稀释混样检测的鼻咽拭子标本自动混样装置，其包括收集管和两个以上的采样管，采样管和收集管的管口处分别设有管盖，各采样管环形分布于收集管的周围，各采样管的下部分别和收集管的下部连通，采样管和收集管的底部均具有向下逐渐缩小的锥形底，采样管和收集管连通的部位位于锥形底上方的位置。本发明在采样时分别将每个拭子放置于采样管内，采样管底部的锥形底保证每个拭子都能充分浸润到细胞保存液；采样结束后，标本前处理时只需要倾斜整个装置，细胞保存液就可以汇集到某一个采样管，实现充分洗脱病毒标本，依此类推，保证每个标本都能充分洗脱，实现多个样本独立采样、自动混合、一次吸样、全部检测的效果。
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