一种筛选家禽RNA病毒源siRNA方法和应用

    公开(公告)号:CN116665779B

    公开(公告)日:2024-05-03

    申请号:CN202310368843.6

    申请日:2023-04-07

    Abstract: 本发明公开了一种筛选家禽RNA病毒源siRNA的方法及其应用。本发明筛选家禽病毒源siRNA方法是基于NCBI GEO数据库中GSE数据集的小RNA与相应参考文献的病毒毒株序列进行比对。其次,通过基因组可视化软件IGV比对可知,IBVM41病毒源siRNA富集区为IBV M41 NSP10siRNA富集区序列。我们将IBVM41 NSP10siRNA富集区序列克隆至能高效表达siRNA的pSilencer4.1载体中,构建成PS‑M10质粒。最后,将PS‑M10质粒转染至巨噬细胞,再进行IBVM41感染试验,荧光定量PCR以及蛋白质印迹结果表明,PS‑M10可高效抑制IBV M41的复制,限制病毒的增殖。

    一种筛选家禽RNA病毒源siRNA方法和应用

    公开(公告)号:CN116665779A

    公开(公告)日:2023-08-29

    申请号:CN202310368843.6

    申请日:2023-04-07

    Abstract: 本发明公开了一种筛选家禽RNA病毒源siRNA的方法及其应用。本发明筛选家禽病毒源siRNA方法是基于NCBI GEO数据库中GSE数据集的小RNA与相应参考文献的病毒毒株序列进行比对。其次,通过基因组可视化软件IGV比对可知,IBVM41病毒源siRNA富集区为IBV M41 NSP10siRNA富集区序列。我们将IBVM41 NSP10siRNA富集区序列克隆至能高效表达siRNA的pSilencer4.1载体中,构建成PS‑M10质粒。最后,将PS‑M10质粒转染至巨噬细胞,再进行IBVM41感染试验,荧光定量PCR以及蛋白质印迹结果表明,PS‑M10可高效抑制IBV M41的复制,限制病毒的增殖。

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