公开(公告)号：CN108754013B

公开(公告)日：2021-03-02

申请号：CN201810656257.0

申请日：2018-06-24

Applicant: 华中农业大学

Inventor： 欧阳波 ,  贾全锐 ,  于会洋 ,  周玉红 ,  刘峰 ,  陈文超 ,  李峰 ,  邹学校

IPC: C12Q1/6895 ,  C12Q1/6806 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明涉及一种与辣椒细胞质雄性不育恢复基因紧密连锁的分子标记及其获得方法和应用，利用细胞质雄性不育系材料YJ15和恢复系材料XJ07构建了F2分离群体HS；同时，用YJ15和恢复系材料XJ02构建了另一个F2分离群体BL。采用极端混池结合RNA‑Seq及重组单株分析法对HS群体进行恢复基因定位，最终获得与恢复基因紧密连锁的染色体区域和候选基因，进一步根据候选基因附近的变异设计分子标记CaML。采用该标记对HS群体进行鉴定，符合率达到100％，用该标记对BL群体进行鉴定，符合率达到93.2％。本发明为辣椒细胞质雄性不育恢复基因的克隆和相关育种工作提供了紧密连锁的分子标记，具有重要的利用价值。

公开(公告)号：CN110093444B

公开(公告)日：2020-09-11

申请号：CN201910420429.9

申请日：2019-05-20

Applicant: 华中农业大学

Inventor： 欧阳波 ,  马哈茂德·马迪 ,  陈蓉 ,  周玉红 ,  赫巴·哈桑 ,  于会洋 ,  欧立军 ,  李峰 ,  邹学校

IPC: C12Q1/6895 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明涉及一种鉴定辣椒栽培种及变种的分子标记、引物及应用，该鉴定辣椒栽培种及变种的分子标记的序列位于辣椒叶绿体基因组上rpl23和trnI的基因间隔区。该鉴定辣椒品种的分子标记引物的序列如下SEQID NO:3和SEQID NO:4所示。采用鉴定辣椒栽培种及变种的分子标记引物可准确地对辣椒材料进行种及变种鉴定和分类。

公开(公告)号：CN108754013A

公开(公告)日：2018-11-06

申请号：CN201810656257.0

申请日：2018-06-24

Applicant: 华中农业大学

Inventor： 欧阳波 ,  贾全锐 ,  于会洋 ,  周玉红 ,  刘峰 ,  陈文超 ,  李峰 ,  邹学校

IPC: C12Q1/6895 ,  C12Q1/6806 ,  C12N15/11

CPC classification number: C12Q1/6895 ,  C12Q1/6806 ,  C12Q2600/13

Abstract: 本发明涉及一种与辣椒细胞质雄性不育恢复基因紧密连锁的分子标记及其获得方法和应用，利用细胞质雄性不育系材料YJ15和恢复系材料XJ07构建了F2分离群体HS；同时，用YJ15和恢复系材料XJ02构建了另一个F2分离群体BL。采用极端混池结合RNA‑Seq及重组单株分析法对HS群体进行恢复基因定位，最终获得与恢复基因紧密连锁的染色体区域和候选基因，进一步根据候选基因附近的变异设计分子标记CaML。采用该标记对HS群体进行鉴定，符合率达到100％，用该标记对BL群体进行鉴定，符合率达到93.2％。本发明为辣椒细胞质雄性不育恢复基因的克隆和相关育种工作提供了紧密连锁的分子标记，具有重要的利用价值。

公开(公告)号：CN103013986B

公开(公告)日：2014-07-02

申请号：CN201110279445.4

申请日：2011-09-20

Applicant: 湖南省蔬菜研究所 ,  华中农业大学

Inventor： 邹学校 ,  孔秋生 ,  陈文超 ,  张竹青 ,  张广平

IPC: C12N15/11 ,  C12N15/10 ,  C12Q1/68

Abstract: 本发明属于分子标记开发技术领域。具体涉及一种利用EST序列的冗余性开发辣椒SSR标记及其制备方法。本发明是利用公共序列数据库中EST来源的异质性和冗余性的特点，以冗余的辣椒EST为研究对象，通过对冗余EST序列的比对，鉴定出多态性的EST-SSR位点并实验验证其多态性。本发明获得33个辣椒EST-SSR标记，其核苷酸序列如序列表SEQ？ID？NO：1-66所示。本发明不仅效率高，而且开发了大量低重复次数的SSR标记，显著地增加了SSR标记的数量，为辣椒遗传育种研究提供了有力的遗传工具。

公开(公告)号：CN110305978B

公开(公告)日：2021-02-12

申请号：CN201810259902.5

申请日：2018-03-27

Applicant: 华中农业大学

Inventor： 欧阳波 ,  陈蓉 ,  于会洋 ,  李峰 ,  陈文超 ,  欧立军 ,  邹学校

IPC: C12Q1/6895 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明利用基因组重测序数据和全基因组关联分析(GWAS)获得与果实朝向高度关联的单核苷酸多态性(SNP)位点，同时利用果实朝向性状的F2分离群体，通过构建朝向表型的两个极端混池，结合对混池进行RNA测序(BSR)，获得与辣椒果实朝向性状紧密连锁的SNP位点，利用两种策略获得的分子标记对朝向性状进行精细定位，开发得到1个紧密连锁的酶切扩增多态性序列(CAPS)标记CaUP12。利用CaUP12对辣椒种质资源进行鉴定，其准确率达到95.6％，利用CaUP12对F2分离群体进行鉴定，准确率达到100％。因此，本发明为辣椒果实朝向控制基因的克隆和辣椒育种提供了紧密关联的分子标记，具有重要的应用价值。

公开(公告)号：CN110305978A

公开(公告)日：2019-10-08

申请号：CN201810259902.5

申请日：2018-03-27

Applicant: 华中农业大学

Inventor： 欧阳波 ,  陈蓉 ,  于会洋 ,  李峰 ,  陈文超 ,  欧立军 ,  邹学校

IPC: C12Q1/6895 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明利用基因组重测序数据和全基因组关联分析(GWAS)获得与果实朝向高度关联的单核苷酸多态性(SNP)位点，同时利用果实朝向性状的F2分离群体，通过构建朝向表型的两个极端混池，结合对混池进行RNA测序(BSR)，获得与辣椒果实朝向性状紧密连锁的SNP位点，利用两种策略获得的分子标记对朝向性状进行精细定位，开发得到1个紧密连锁的酶切扩增多态性序列(CAPS)标记CaUP12。利用CaUP12对辣椒种质资源进行鉴定，其准确率达到95.6％，利用CaUP12对F2分离群体进行鉴定，准确率达到100％。因此，本发明为辣椒果实朝向控制基因的克隆和辣椒育种提供了紧密关联的分子标记，具有重要的应用价值。

公开(公告)号：CN110093444A

公开(公告)日：2019-08-06

申请号：CN201910420429.9

申请日：2019-05-20

Applicant: 华中农业大学

Inventor： 欧阳波 ,  马哈茂德·马迪 ,  陈蓉 ,  周玉红 ,  赫巴·哈桑 ,  于会洋 ,  欧立军 ,  李峰 ,  邹学校

IPC: C12Q1/6895 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明涉及一种鉴定辣椒栽培种及变种的分子标记、引物及应用，该鉴定辣椒栽培种及变种的分子标记的序列位于辣椒叶绿体基因组上rpl23和trnI的基因间隔区。该鉴定辣椒品种的分子标记引物的序列如下SEQID NO:3和SEQID NO:4所示。采用鉴定辣椒栽培种及变种的分子标记引物可准确地对辣椒材料进行种及变种鉴定和分类。

公开(公告)号：CN103013986A

公开(公告)日：2013-04-03

申请号：CN201110279445.4

申请日：2011-09-20

Applicant: 湖南省蔬菜研究所 ,  华中农业大学

Inventor： 邹学校 ,  孔秋生 ,  陈文超 ,  张竹青 ,  张广平

IPC: C12N15/11 ,  C12N15/10 ,  C12Q1/68

Abstract: 本发明属于分子标记开发技术领域。具体涉及一种利用EST序列的冗余性开发辣椒SSR标记及其制备方法。本发明是利用公共序列数据库中EST来源的异质性和冗余性的特点，以冗余的辣椒EST为研究对象，通过对冗余EST序列的比对，鉴定出多态性的EST-SSR位点并实验验证其多态性。本发明获得33个辣椒EST-SSR标记，其核苷酸序列如序列表SEQ ID NO：1-66所示。本发明不仅效率高，而且开发了大量低重复次数的SSR标记，显著地增加了SSR标记的数量，为辣椒遗传育种研究提供了有力的遗传工具。