辣椒果实长度的分子标记、引物、试剂盒及应用

    公开(公告)号:CN117402998A

    公开(公告)日:2024-01-16

    申请号:CN202311457611.4

    申请日:2023-11-03

    Abstract: 本申请涉及辣椒果实长度技术领域,具体涉及辣椒果实长度的分子标记、引物、试剂盒及应用。该分子标记包括辣椒基因组第3号染色体的第216582884位碱基处发生单核苷酸突变T>A形成的核苷酸序列。该引物如SEQ ID NO.2~3所示。该试剂盒包括该引物。采用该分子标记、该引物或该试剂盒能够用于辣椒果实长度的检测与分析、以及辣椒的筛选与育种,能够为解析辣椒的人工驯化过程,克隆辣椒果实长度基因,进而解析辣椒果实长度分子机理奠定了重要基础。

    一种与辣椒果实朝向紧密关联的SNP位点及其通用性分子标记、获取方法和应用

    公开(公告)号:CN110305978B

    公开(公告)日:2021-02-12

    申请号:CN201810259902.5

    申请日:2018-03-27

    Abstract: 本发明利用基因组重测序数据和全基因组关联分析(GWAS)获得与果实朝向高度关联的单核苷酸多态性(SNP)位点,同时利用果实朝向性状的F2分离群体,通过构建朝向表型的两个极端混池,结合对混池进行RNA测序(BSR),获得与辣椒果实朝向性状紧密连锁的SNP位点,利用两种策略获得的分子标记对朝向性状进行精细定位,开发得到1个紧密连锁的酶切扩增多态性序列(CAPS)标记CaUP12。利用CaUP12对辣椒种质资源进行鉴定,其准确率达到95.6%,利用CaUP12对F2分离群体进行鉴定,准确率达到100%。因此,本发明为辣椒果实朝向控制基因的克隆和辣椒育种提供了紧密关联的分子标记,具有重要的应用价值。

    一种与辣椒果实朝向紧密关联的SNP位点及其通用性分子标记、获取方法和应用

    公开(公告)号:CN110305978A

    公开(公告)日:2019-10-08

    申请号:CN201810259902.5

    申请日:2018-03-27

    Abstract: 本发明利用基因组重测序数据和全基因组关联分析(GWAS)获得与果实朝向高度关联的单核苷酸多态性(SNP)位点,同时利用果实朝向性状的F2分离群体,通过构建朝向表型的两个极端混池,结合对混池进行RNA测序(BSR),获得与辣椒果实朝向性状紧密连锁的SNP位点,利用两种策略获得的分子标记对朝向性状进行精细定位,开发得到1个紧密连锁的酶切扩增多态性序列(CAPS)标记CaUP12。利用CaUP12对辣椒种质资源进行鉴定,其准确率达到95.6%,利用CaUP12对F2分离群体进行鉴定,准确率达到100%。因此,本发明为辣椒果实朝向控制基因的克隆和辣椒育种提供了紧密关联的分子标记,具有重要的应用价值。

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