公开(公告)号：CN117497066A

公开(公告)日：2024-02-02

申请号：CN202311389932.5

申请日：2023-10-24

Applicant: 华中农业大学

Inventor： 刘建晓 ,  王振业 ,  彭勇 ,  李杰 ,  李骥英 ,  周雄辉 ,  谢傲 ,  张江陵 ,  袁豪 ,  丁新茹 ,  王守哲 ,  李克勤 ,  石佳奇 ,  刑广杰 ,  史维瀚 ,  严建兵

IPC: G16B40/20 ,  G16B35/00 ,  G16B20/20

Abstract: 本发明公开了一种基于染色质交互高精度预测玉米基因表达量的方法，其特征在于，该方法通过构建的DeepCBA模型实现，包括：对输入染色质序列进行one‑hot编码处理；将编码后的序列输入卷积神经网络，实现特征降维和特征提取。为了捕获序列中的时序特征，利用双向长短期记忆网络捕获隐藏在DNA序列中的时序特征，得到两个向量矩阵，垂直拼接两个向量矩阵。使用注意力机制增强关键特征对模型的贡献，并使用Dropout防止过拟合等。在输出层，使用sigmoid/linear函数完成相应的基于启动子近端和远端染色质交互的玉米基因表达量预测；并识别和挖掘玉米染色质序列中潜在的重要基序。本发明实现了对基因表达量的从头预测，进而为基因表达量精准设计乃至未来智能育种提供了新的思路。

公开(公告)号：CN118516359A

公开(公告)日：2024-08-20

申请号：CN202410692781.9

申请日：2024-05-31

Applicant: 华中农业大学 ,  未米生物科技(海南)有限公司

Inventor： 胡学海 ,  刘丽芬 ,  邱洋 ,  王守哲 ,  许洁婷 ,  金敏亮 ,  吴晓昱 ,  严建兵

IPC: C12N15/113 ,  C12N15/54 ,  C12N15/82 ,  A01H5/10 ,  A01H6/46

Abstract: 本发明属于基因工程领域，具体涉及一种调控元件及其应用。本发明人工智能的基因调控区编辑方法，获得一种具有增强基因表达效果的新型调控元件。该调控元件可以用于增强基因表达。另一方面，本发明还提供了一种提高玉米籽粒中维生素E含量的方法。

公开(公告)号：CN118658527A

公开(公告)日：2024-09-17

申请号：CN202410692614.4

申请日：2024-05-31

Applicant: 华中农业大学 ,  未米生物科技(海南)有限公司

Inventor： 胡学海 ,  刘丽芬 ,  邱洋 ,  王守哲 ,  许洁婷 ,  金敏亮 ,  吴晓昱 ,  严建兵

IPC: G16B25/10 ,  G16B40/00 ,  G16B30/00 ,  G06N3/0464 ,  G06N3/084 ,  G06N5/045 ,  G16B35/00 ,  C12N15/82 ,  C12N15/113 ,  C12N15/54

Abstract: 本发明属于生物信息学领域，具体涉及一种基于人工智能的基因调控区编辑方法。本发明使用人工智能算法对启动子、5’‑UTR、3’‑UTR、终止子构成的基因调控区进行模拟突变，以衡量不同基因编辑方案对基因表达的影响，从而根据育种需求生成精准的基因编辑方案。