一种微生物智能梯级耐热调控方法

    公开(公告)号:CN105002188B

    公开(公告)日:2018-02-27

    申请号:CN201510069358.4

    申请日:2015-02-10

    Abstract: 发酵过程中,微生物的生长和生产经常遭受热胁迫的限制。以构建耐热大肠杆菌底盘宿主为目的,本专利利用合成生物学方法创建了一种微生物智能梯级耐热调控方法,能在细胞和菌群两个层面上提高微生物的耐热性,其主要包括梯级耐热系统和数量调控系统。梯级耐热系统包括热激蛋白(HSPs)、泛素和转录因子等耐热功能元件,以人工设计的RNA温敏开关与启动子组合为调控元件,可以实现微生物的梯级耐热。微生物数量调控系统则利用群体感应系统和RNA温敏开关组合为与门开关,动态地开启利他性程序死亡系统,有效地控制代谢热,在菌群层面上提高微生物适应热胁迫的能力。通过两个系统的协同作用,提高了微生物对特定高温以及高温波动的适应性与鲁棒性。

    一种提高酿酒酵母耐热性的分子调控方法

    公开(公告)号:CN103820345B

    公开(公告)日:2016-07-13

    申请号:CN201410022595.0

    申请日:2014-01-17

    Abstract: 针对现代生物医药与轻工业食品产业体系中,微生物控温发酵生产过程高能耗的问题。本发明提供一种提高酿酒酵母耐热性的分子调控方法,属于生物化工领域。以嗜热菌,耐热菌中的热激蛋白、泛素、ATP合成酶基因以及酿酒酵母中热激蛋白基因作为功能元件,以酿酒酵母中不同强度启动子作为调控元件,通过单功能、多功能、协同型3种不同组装方式构建耐热元器件,构建的耐热元器件再以载体和基因组整合2种策略导入酵母细胞中,实现耐热元器件与底盘宿主酿酒酵母的集成。通过梯度升温和恒定高温培养发酵表征元器件的耐热性,实现酿酒酵母在分子水平上不同耐热程度的调控,为工业发酵生产生物基产品的高效、低能耗过程提供了新方法。

    一种提高酿酒酵母耐热性的分子调控方法

    公开(公告)号:CN103820345A

    公开(公告)日:2014-05-28

    申请号:CN201410022595.0

    申请日:2014-01-17

    Abstract: 针对现代生物医药与轻工业食品产业体系中,微生物控温发酵生产过程高能耗的问题。本发明提供一种提高酿酒酵母耐热性的分子调控方法,属于生物化工领域。以嗜热菌,耐热菌中的热激蛋白、泛素、ATP合成酶基因以及酿酒酵母中热激蛋白基因作为功能元件,以酿酒酵母中不同强度启动子作为调控元件,通过单功能、多功能、协同型3种不同组装方式构建耐热元器件,构建的耐热元器件再以载体和基因组整合2种策略导入酵母细胞中,实现耐热元器件与底盘宿主酿酒酵母的集成。通过梯度升温和恒定高温培养发酵表征元器件的耐热性,实现酿酒酵母在分子水平上不同耐热程度的调控,为工业发酵生产生物基产品的高效、低能耗过程提供了新方法。

    一种提高大肠杆菌耐热性的分子调控方法

    公开(公告)号:CN103773791A

    公开(公告)日:2014-05-07

    申请号:CN201410020497.3

    申请日:2014-01-16

    Abstract: 针对现代生物医药与轻工业食品产业体系中,微生物控温发酵生产过程高能耗的问题。本发明提供了一种提高大肠杆菌耐热性的分子调控方法,属于生物化工领域。以嗜热菌和耐热菌热激蛋白、泛素、热诱导转录因子基因作为核心功能元件,不同强度启动子作为调控元件,通过单功能、簇状、多功能串联3种方式组装耐热元器件,并实现与底盘宿主大肠杆菌的集成。通过梯度升温和恒定高温培养发酵表征元器件的耐热性,根据工程菌不同耐热温度范围,将耐热元件划分为强、中、弱三类,实现大肠杆菌在分子水平上不同耐热程度的调控。为工业发酵生产生物基产品的高效、低能耗过程提供了新方法。

    一种微生物智能梯级耐热调控方法

    公开(公告)号:CN105002188A

    公开(公告)日:2015-10-28

    申请号:CN201510069358.4

    申请日:2015-02-10

    Abstract: 发酵过程中,微生物的生长和生产经常遭受热胁迫的限制。以构建耐热大肠杆菌底盘宿主为目的,本发明利用合成生物学方法创建了一种微生物智能梯级耐热调控方法,能在细胞和菌群两个层面上提高微生物的耐热性,其主要包括梯级耐热系统和数量调控系统。梯级耐热系统包括热激蛋白(HSPs)、泛素和转录因子等耐热功能元件,以人工设计的RNA温敏开关与启动子组合为调控元件,可以实现微生物的梯级耐热。微生物数量调控系统则利用群体感应系统和RNA温敏开关组合为与门开关,动态地开启利他性程序死亡系统,有效地控制代谢热,在菌群层面上提高微生物适应热胁迫的能力。通过两个系统的协同作用,提高了微生物对特定高温以及高温波动的适应性与鲁棒性。

    一种用于交叉活性抗体的高通量筛选方法和应用

    公开(公告)号:CN117965528A

    公开(公告)日:2024-05-03

    申请号:CN202410094417.2

    申请日:2024-01-23

    Inventor: 贾海洋 孙欢

    Abstract: 本发明提供一种用于交叉活性抗体的高通量筛选方法,包括如下步骤:步骤1、构建抗体基因文库,基于抗体基因文库构建得到用于展示抗体的复合体;步骤2、使用至少两种抗原展示系统依次对复合体进行筛选,每种抗原展示系统表面展示有不同靶抗原分子,以筛选出能够同时与不同靶抗原分子结合的目标复合体;步骤3、根据目标复合体得到目标抗体的基因信息。本发明将多种靶抗原分子展示在人工脂滴表面,作为多轮抗体筛选的抗原展示系统,有助于高效、快速、经济地筛选出具有交叉活性的广谱抗体。

    一种用于交叉活性抗体的高通量筛选方法和应用

    公开(公告)号:CN117965528B

    公开(公告)日:2025-01-21

    申请号:CN202410094417.2

    申请日:2024-01-23

    Inventor: 贾海洋 孙欢

    Abstract: 本发明提供一种用于交叉活性抗体的高通量筛选方法,包括如下步骤:步骤1、构建抗体基因文库,基于抗体基因文库构建得到用于展示抗体的复合体;步骤2、使用至少两种抗原展示系统依次对复合体进行筛选,每种抗原展示系统表面展示有不同靶抗原分子,以筛选出能够同时与不同靶抗原分子结合的目标复合体;步骤3、根据目标复合体得到目标抗体的基因信息。本发明将多种靶抗原分子展示在人工脂滴表面,作为多轮抗体筛选的抗原展示系统,有助于高效、快速、经济地筛选出具有交叉活性的广谱抗体。

    一种面向控制流程图的跨平台二进制函数表征方法及装置

    公开(公告)号:CN115202736A

    公开(公告)日:2022-10-18

    申请号:CN202210684915.3

    申请日:2022-06-14

    Abstract: 本发明公开了一种面向控制流程图的跨平台二进制函数表征方法及装置,所述方法包括:获取二进制代码的指令集并统计特征;获取各个指令特征的特征向量;基于所述指令特征的特征向量及LSTM模型,对各个CFG中的各个基本块进行基本块嵌入,得到各个基本块的特征向量;过滤CFG中的无效节点,得到过滤后的基本块对应的特征向量集;使用图神经网络模型进行函数表征;所述图神经网络模型中,每个节点获取其对应的k阶邻居的信息;某节点的k阶邻居为所述图神经网络模型中,与该节点的连接级数小于或等于k的节点。本方法具有强大的数据理解能力和认知能力,并对邻居节点进行随机采样来控制k阶子图的数据规模,节省开销。

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