公开(公告)号：CN116397008A

公开(公告)日：2023-07-07

申请号：CN202211367270.7

申请日：2022-11-02

Applicant: 北京林业大学

Inventor： 林金星 ,  张莹莹 ,  张曦 ,  沈微微 ,  胡子建 ,  洪岩铭 ,  杨舜垚 ,  许会敏 ,  钮世辉 ,  沈应柏

IPC: C12Q1/6809 ,  C12Q1/6895 ,  C12N15/29 ,  C12N15/11 ,  G16B40/00

Abstract: 本发明公开了一种油松年龄标记基因PtMADS26的筛选鉴定方法与应用，涉及林木育种技术领域。本发明基于加权共表达网络分析筛选和鉴定到油松年龄标记基因PtMADS26，进一步通过实时荧光定量分析实验检测PtMADS26在不同年龄油松中的表达模式，并测定其在反复截顶和未截顶油松中的表达水平，从而确定其参与油松成熟态向幼年态的调控。本发明通过共表达网络分析为挖掘树木年龄标记基因及互作关系预测提供了新的思路，在克服多年生树木成熟效应，促进无性繁殖，缩短育种年限方面具有重要意义。

公开(公告)号：CN115995269A

公开(公告)日：2023-04-21

申请号：CN202211547264.X

申请日：2022-12-05

Applicant: 北京林业大学

Inventor： 林金星 ,  洪岩铭 ,  张莹莹 ,  沈诗雅 ,  张曦 ,  钮世辉 ,  沈应柏 ,  崔亚宁

IPC: G16B50/30 ,  G16B40/00

Abstract: 本发明提供了一种挖掘油松年龄相关基因的方法，属于基因工程技术领域，包括：构建不同年龄的油松茎段的转录组数据集，获得原始数据；分析差异表达基因；利用差异表达基因确定皮尔逊相关系数的分界值，通过PCC的分界值构建多个基因表达网络；对基因表达网络中的TF表达量进行单调性测绘，以确定种子基因；将种子基因进行BFS算法运算，获得多个时序层级基因表达网络模型；根据获得的时序层级基因表达网络模型中出现的核心连接点基因，作为油松年龄相关基因。本发明成功挖掘出与年龄性状密切相关的基因DAL35，为分析油松老化分子机制奠定了基础，也为改善油松老化现象提供了遗传资源和技术支持。