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公开(公告)号:CN118910262A
公开(公告)日:2024-11-08
申请号:CN202411129340.4
申请日:2024-08-16
Applicant: 北京大学第三医院(北京大学第三临床医学院)
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/6869 , C12N15/11 , C12M1/34 , C12M1/00
Abstract: 本发明提供了一种对着床前胚胎进行BRCA1/2基因检测的试剂盒套装及其应用,该方法基于转录组进行检测,降低了脱扣的可能,提高在着床前胚胎细胞中针对BRCA1/2基因检测的精准性和成功率。
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公开(公告)号:CN116083560B
公开(公告)日:2024-01-23
申请号:CN202310095883.8
申请日:2023-01-18
Applicant: 北京大学第三医院(北京大学第三临床医学院)
IPC: C12Q1/6883 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明提供了用于着床前胚胎NF1基因检测的试剂盒及其应用,该试剂盒包括设计的n个引物对中的一个或更多个引物对,所述n为大于2的自然数,其中第2对引物的上游引物位于第1对引物的下游引物的上游或与之重叠,依此类推,第n对引物的上游引物位于第n‑1对引物的下游引物的下游或与之重叠,即所述n个引物对扩增的序列涵盖了NF1基因所有外显子的完整CDS区,且所述n个引物对的每个引物对的上游引物和下游引物分别设计在NF1基因无假基因的不同外显子区域着床前胚胎NF1基因检测的方法;以及用于着床前胚胎基因检测的试剂盒、系统及其应用方法。
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公开(公告)号:CN117116344A
公开(公告)日:2023-11-24
申请号:CN202311385076.6
申请日:2023-10-25
Applicant: 北京大学第三医院(北京大学第三临床医学院)
Abstract: 本发明涉及一种单细胞水平PMP22重复变异的检测系统和方法,该系统包括胚胎单细胞样本的获取及储存单元、全基因组扩增单元、文库构建及二代测序单元、单细胞数据的过滤和比对单元、胚胎PMP22区域正常2拷贝数参考系构建单元和待测样本PMP22区域拷贝数判断单元;待测样本PMP22区域拷贝数判断单元用于统计待测样本参考基因组窗口中PMP22区域的比对读段数,计算待测样本矫正后每个窗口的测序深度,将待测样本与胚胎PMP22区域正常2拷贝数参考系进行样本合并和样本间矫正,得到最终用于分析的窗口读段数,判断待测样本PMP22区域拷贝数并进行可视化。
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公开(公告)号:CN116287280B
公开(公告)日:2023-08-15
申请号:CN202310595270.0
申请日:2023-05-25
Applicant: 北京大学第三医院(北京大学第三临床医学院)
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/6869 , C12Q1/6858 , C12N15/11 , C12M1/34 , C12M1/33 , C12M1/00
Abstract: 本发明提供了一种对着床前的胚胎进行EXT1和/或EXT2基因序列检测的试剂盒及其应用,该试剂盒包括以下4个引物对中的一个或更多个,引物对1:第一上游引物:SEQ ID No:1、第一下游引物:SEQ ID No:2,引物对2:第二上游引物:SEQ ID No:3、第二下游引物:SEQ ID No:4,3)引物对3:第三上游引物:SEQ ID No:5、第三下游引物:SEQ ID No:6,4)引物对4:第四上游引物:SEQ ID No:7、第四下游引物:SEQ ID No:8,该方法基于转录组进行诊断,降低了脱扣的可能,提高在着床前胚胎细胞中EXT1和EXT2基因检测的精准性和成功率,为连锁分析困难的胚胎检测家系提供了新方法。
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公开(公告)号:CN116103388A
公开(公告)日:2023-05-12
申请号:CN202211661776.9
申请日:2022-12-23
Applicant: 北京大学第三医院(北京大学第三临床医学院)
IPC: C12Q1/6883 , C12Q1/686 , C12Q1/6869 , C12N15/11 , C12M1/34 , C12M1/00
Abstract: 本发明提供了一种实现着床前胚胎ATXN3基因检测的试剂盒、系统和方法,试剂盒包括用于扩增(CAG)n序列的引物对,引物对包括下游引物和荧光基团修饰的上游引物;系统包括:样本预处理装置,用于从外滋养层细胞获得核酸样本;特定核酸序列扩增装置,使用试剂盒对ATXN3基因中包含(CAG)n序列的部分进行扩增;以及判断装置,以便对所述扩增得到的产物进行分析对比,得到n的数值;方法包括:裂解外滋养层细胞获得mRNA,使用mRNA反转录引物进行反转录,然后使用反转录得到的cDNA产物和随机引物进行扩增,得到核酸样本;使用本发明的试剂盒与所述核酸样本进行目标序列的扩增;对扩增得到的产物进行毛细管电泳,然后进行分析,得到n。
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公开(公告)号:CN117721222B
公开(公告)日:2024-05-10
申请号:CN202410172651.2
申请日:2024-02-07
Applicant: 北京大学第三医院(北京大学第三临床医学院)
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6869 , G16B25/10 , G16B30/10
Abstract: 本发明涉及医药检测领域,具体涉及一种单细胞转录组预测胚胎着床的方法及应用。所述单细胞转录组预测胚胎着床的方法,主要通过两步实现对胚胎着床潜能的预测:第一是发育潜能初步评估,即确定着床成功与着床失败的胚胎在转录组整体水平上的差异的规律,然后根据这个规律,将临床上的胚胎分为“高发育潜能组”和“低发育潜能组”;第二是发育异常的胚胎的排查,即根据染色体表达量的分布划分阈值,将染色体分为“正常表达”与“异常表达”染色体,含有“异常表达”染色体的胚胎被认为是发育异常的胚胎;可见,“高发育潜能组”中不含有“异常表达”染色体的胚胎被认为是能成功着床的胚胎。
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公开(公告)号:CN116103388B
公开(公告)日:2024-01-23
申请号:CN202211661776.9
申请日:2022-12-23
Applicant: 北京大学第三医院(北京大学第三临床医学院)
IPC: C12Q1/6883 , C12Q1/686 , C12Q1/6869 , C12N15/11 , C12M1/34 , C12M1/00
Abstract: 本发明提供了一种实现着床前胚胎ATXN3基因检测的试剂盒、系统和方法,试剂盒包括用于扩增(CAG)n序列的引物对,引物对包括下游引物和荧光基团修饰的上游引物;系统包括:样本预处理装置,用于从外滋养层细胞获得核酸样本;特定核酸序列扩增装置,使用试剂盒对ATXN3基因中包含(CAG)n序列的部分进行扩增;以及判断装置,以便对所述扩增得到的产物进行分析对比,得到n的数值;方法包括:裂解外滋养层细胞获得mRNA,使用mRNA反转录引物进行反转录,然后使用反转录得到的cDNA产物和随机引物进行扩增,得到核酸样本;使用本发明的试剂盒与所述核酸样本进行目标序列的扩增;对扩增得到的产物进行毛细管电泳,然后进行分析,得到n。
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公开(公告)号:CN116640853B
公开(公告)日:2023-10-31
申请号:CN202310875802.6
申请日:2023-07-18
Applicant: 北京大学第三医院(北京大学第三临床医学院)
IPC: C12Q1/6886 , C12N15/11 , C12Q1/6858
Abstract: 本发明提供了一种对着床前胚胎进行林奇综合征相关基因检测的试剂盒套装及其应用,该方法基于转录组进行检测,降低了脱扣的可能,提高在着床前胚胎细胞中针对林奇综合征相关基因检测的精准性和成功率。
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公开(公告)号:CN116287280A
公开(公告)日:2023-06-23
申请号:CN202310595270.0
申请日:2023-05-25
Applicant: 北京大学第三医院(北京大学第三临床医学院)
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/6869 , C12Q1/6858 , C12N15/11 , C12M1/34 , C12M1/33 , C12M1/00
Abstract: 本发明提供了一种对着床前的胚胎进行EXT1和/或EXT2基因序列检测的试剂盒及其应用,该试剂盒包括以下4个引物对中的一个或更多个,引物对1:第一上游引物:SEQ ID No:1、第一下游引物:SEQ ID No:2,引物对2:第二上游引物:SEQ ID No:3、第二下游引物:SEQ ID No:4,3)引物对3:第三上游引物:SEQ ID No:5、第三下游引物:SEQ ID No:6,4)引物对4:第四上游引物:SEQ ID No:7、第四下游引物:SEQ ID No:8,该方法基于转录组进行诊断,降低了脱扣的可能,提高在着床前胚胎细胞中EXT1和EXT2基因检测的精准性和成功率,为连锁分析困难的胚胎检测家系提供了新方法。
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公开(公告)号:CN116083560A
公开(公告)日:2023-05-09
申请号:CN202310095883.8
申请日:2023-01-18
Applicant: 北京大学第三医院(北京大学第三临床医学院)
IPC: C12Q1/6883 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明提供了用于着床前胚胎NF1基因检测的试剂盒及其应用,该试剂盒包括设计的n个引物对中的一个或更多个引物对,所述n为大于2的自然数,其中第2对引物的上游引物位于第1对引物的下游引物的上游或与之重叠,依此类推,第n对引物的上游引物位于第n‑1对引物的下游引物的下游或与之重叠,即所述n个引物对扩增的序列涵盖了NF1基因所有外显子的完整CDS区,且所述n个引物对的每个引物对的上游引物和下游引物分别设计在NF1基因无假基因的不同外显子区域着床前胚胎NF1基因检测的方法;以及用于着床前胚胎基因检测的试剂盒、系统及其应用方法。
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