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公开(公告)号:CN117116344A
公开(公告)日:2023-11-24
申请号:CN202311385076.6
申请日:2023-10-25
Applicant: 北京大学第三医院(北京大学第三临床医学院)
Abstract: 本发明涉及一种单细胞水平PMP22重复变异的检测系统和方法,该系统包括胚胎单细胞样本的获取及储存单元、全基因组扩增单元、文库构建及二代测序单元、单细胞数据的过滤和比对单元、胚胎PMP22区域正常2拷贝数参考系构建单元和待测样本PMP22区域拷贝数判断单元;待测样本PMP22区域拷贝数判断单元用于统计待测样本参考基因组窗口中PMP22区域的比对读段数,计算待测样本矫正后每个窗口的测序深度,将待测样本与胚胎PMP22区域正常2拷贝数参考系进行样本合并和样本间矫正,得到最终用于分析的窗口读段数,判断待测样本PMP22区域拷贝数并进行可视化。
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公开(公告)号:CN116287280B
公开(公告)日:2023-08-15
申请号:CN202310595270.0
申请日:2023-05-25
Applicant: 北京大学第三医院(北京大学第三临床医学院)
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/6869 , C12Q1/6858 , C12N15/11 , C12M1/34 , C12M1/33 , C12M1/00
Abstract: 本发明提供了一种对着床前的胚胎进行EXT1和/或EXT2基因序列检测的试剂盒及其应用,该试剂盒包括以下4个引物对中的一个或更多个,引物对1:第一上游引物:SEQ ID No:1、第一下游引物:SEQ ID No:2,引物对2:第二上游引物:SEQ ID No:3、第二下游引物:SEQ ID No:4,3)引物对3:第三上游引物:SEQ ID No:5、第三下游引物:SEQ ID No:6,4)引物对4:第四上游引物:SEQ ID No:7、第四下游引物:SEQ ID No:8,该方法基于转录组进行诊断,降低了脱扣的可能,提高在着床前胚胎细胞中EXT1和EXT2基因检测的精准性和成功率,为连锁分析困难的胚胎检测家系提供了新方法。
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公开(公告)号:CN116640853B
公开(公告)日:2023-10-31
申请号:CN202310875802.6
申请日:2023-07-18
Applicant: 北京大学第三医院(北京大学第三临床医学院)
IPC: C12Q1/6886 , C12N15/11 , C12Q1/6858
Abstract: 本发明提供了一种对着床前胚胎进行林奇综合征相关基因检测的试剂盒套装及其应用,该方法基于转录组进行检测,降低了脱扣的可能,提高在着床前胚胎细胞中针对林奇综合征相关基因检测的精准性和成功率。
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公开(公告)号:CN116287280A
公开(公告)日:2023-06-23
申请号:CN202310595270.0
申请日:2023-05-25
Applicant: 北京大学第三医院(北京大学第三临床医学院)
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/6869 , C12Q1/6858 , C12N15/11 , C12M1/34 , C12M1/33 , C12M1/00
Abstract: 本发明提供了一种对着床前的胚胎进行EXT1和/或EXT2基因序列检测的试剂盒及其应用,该试剂盒包括以下4个引物对中的一个或更多个,引物对1:第一上游引物:SEQ ID No:1、第一下游引物:SEQ ID No:2,引物对2:第二上游引物:SEQ ID No:3、第二下游引物:SEQ ID No:4,3)引物对3:第三上游引物:SEQ ID No:5、第三下游引物:SEQ ID No:6,4)引物对4:第四上游引物:SEQ ID No:7、第四下游引物:SEQ ID No:8,该方法基于转录组进行诊断,降低了脱扣的可能,提高在着床前胚胎细胞中EXT1和EXT2基因检测的精准性和成功率,为连锁分析困难的胚胎检测家系提供了新方法。
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公开(公告)号:CN116640853A
公开(公告)日:2023-08-25
申请号:CN202310875802.6
申请日:2023-07-18
Applicant: 北京大学第三医院(北京大学第三临床医学院)
IPC: C12Q1/6886 , C12N15/11 , C12Q1/6858
Abstract: 本发明提供了一种对着床前胚胎进行林奇综合征相关基因检测的试剂盒套装及其应用,该方法基于转录组进行检测,降低了脱扣的可能,提高在着床前胚胎细胞中针对林奇综合征相关基因检测的精准性和成功率。
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公开(公告)号:CN119823982A
公开(公告)日:2025-04-15
申请号:CN202510324128.1
申请日:2025-03-19
Applicant: 北京大学第三医院(北京大学第三临床医学院)
IPC: C12N15/10 , C12Q1/6806
Abstract: 本发明涉及生物技术领域,具体的,本发明涉及一种快速提取GV(germinal vesicle)期卵母细胞核及合子期原核的方法。该方法采用自制的移卵针吸取卵母细胞或受精卵,再通过自制的玻璃针从核提取液滴中吸取卵母细胞核及合子期原核,可以短时间内获取较大量的GV期卵母细胞核或受精卵时期的原核样本,并且不需要昂贵的设备和专业技术人员,获得的GV期卵母细胞核或受精卵时期的原核样本完整性高,污染率低,具有极大的应用价值。
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公开(公告)号:CN117116344B
公开(公告)日:2024-07-19
申请号:CN202311385076.6
申请日:2023-10-25
Applicant: 北京大学第三医院(北京大学第三临床医学院)
Abstract: 本发明涉及一种单细胞水平PMP22重复变异的检测系统和方法,该系统包括胚胎单细胞样本的获取及储存单元、全基因组扩增单元、文库构建及二代测序单元、单细胞数据的过滤和比对单元、胚胎PMP22区域正常2拷贝数参考系构建单元和待测样本PMP22区域拷贝数判断单元;待测样本PMP22区域拷贝数判断单元用于统计待测样本参考基因组窗口中PMP22区域的比对读段数,计算待测样本矫正后每个窗口的测序深度,将待测样本与胚胎PMP22区域正常2拷贝数参考系进行样本合并和样本间矫正,得到最终用于分析的窗口读段数,判断待测样本PMP22区域拷贝数并进行可视化。
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