公开(公告)号：CN117316292B

公开(公告)日：2024-01-30

申请号：CN202311615613.1

申请日：2023-11-30

Applicant: 北京大学 ,  生态环境部淮河流域生态环境监督管理局生态环境监测与科学研究中心

Inventor： 孙卫玲 ,  汤默然 ,  陈倩 ,  张婷婷 ,  陈曦

IPC: G16B40/00

Abstract: 本发明属于评价抗生素生态效应技术领域，尤其涉及基于细菌‑古菌‑真菌共现网络评价抗生素生态效应的方法。本发明构建了细菌‑古菌‑真菌之间的共现网络，去除了同一类群微生物内的相关关系，基于抗生素浓度进行高低浓度样本分组，对比两个组别下的细菌‑古菌‑真菌共现网络中网络和点的拓扑性质，发现高浓度抗生素条件下不同类群微生物之间的物种平均连接度和图密度更高，网络平均聚类系数和模块度更低，表明高浓度抗生素条件下不同类群微生物间关联增大，连接更紧密，但聚类模块数更少，模块分化程度更小，生态位分化更少，对评价抗生素对不同类群微生物间相互关联程度和生态位分化程度的影响具有重要价值。(56)对比文件Dawei Huang 等.Distribution and co-occurrence of antibiotic resistance genesand bacterial pathogens in the effluentof decentralized sewage treatment systemsin China《.International Biodeterioration& Biodegradation》.2023,全文.Moran Tang 等.Exploring diversitypatterns and driving mechanisms of theantibiotic resistome and microbiome insaline groundwater《.Journal of HazardousMaterials》.2023,全文.

公开(公告)号：CN117316292A

公开(公告)日：2023-12-29

申请号：CN202311615613.1

申请日：2023-11-30

Applicant: 北京大学 ,  生态环境部淮河流域生态环境监督管理局生态环境监测与科学研究中心

Inventor： 孙卫玲 ,  汤默然 ,  陈倩 ,  张婷婷 ,  陈曦

IPC: G16B40/00

Abstract: 本发明属于评价抗生素生态效应技术领域，尤其涉及基于细菌‑古菌‑真菌共现网络评价抗生素生态效应的方法。本发明构建了细菌‑古菌‑真菌之间的共现网络，去除了同一类群微生物内的相关关系，基于抗生素浓度进行高低浓度样本分组，对比两个组别下的细菌‑古菌‑真菌共现网络中网络和点的拓扑性质，发现高浓度抗生素条件下不同类群微生物之间的物种平均连接度和图密度更高，网络平均聚类系数和模块度更低，表明高浓度抗生素条件下不同类群微生物间关联增大，连接更紧密，但聚类模块数更少，模块分化程度更小，生态位分化更少，对评价抗生素对不同类群微生物间相互关联程度和生态位分化程度的影响具有重要价值。

公开(公告)号：CN118465166B

公开(公告)日：2024-09-24

申请号：CN202410930932.X

申请日：2024-07-12

Applicant: 北京大学 ,  北京大学深圳研究生院

Inventor： 孙卫玲 ,  吕轶韬 ,  许楠 ,  刘文 ,  陈倩 ,  倪晋仁

IPC: G01N30/88 ,  G01N30/06 ,  G01N30/86

Abstract: 本申请公开了一种增强源识别的定量源解析方法及设备，涉及环境监测技术及污染物溯源领域，该方法包括：获取污染受体样品和每个候选源样品的质谱数据；分析污染受体样品和候选源样品的质谱数据，构建污染受体样品和候选源样品向量；采用引入超参数的期望最大化算法，计算每个候选源样品对污染受体样品的贡献度并识别出有效污染源。本申请通过引入超参数的期望最大化算法，对候选源样品进行增强识别并定量解析，实现从大量源样品中计算每个候选源样品对污染受体样品的贡献度并识别出有效污染源，极大提升了源解析技术的抗干扰能力，充分利用污染源数据库进行溯源，并且能够在没有候选源样品的情况下进行溯源。

公开(公告)号：CN118465166A

公开(公告)日：2024-08-09

申请号：CN202410930932.X

申请日：2024-07-12

Applicant: 北京大学 ,  北京大学深圳研究生院

Inventor： 孙卫玲 ,  吕轶韬 ,  许楠 ,  刘文 ,  陈倩 ,  倪晋仁

IPC: G01N30/88 ,  G01N30/06 ,  G01N30/86

Abstract: 本申请公开了一种增强源识别的定量源解析方法及设备，涉及环境监测技术及污染物溯源领域，该方法包括：获取污染受体样品和每个候选源样品的质谱数据；分析污染受体样品和候选源样品的质谱数据，构建污染受体样品和候选源样品向量；采用引入超参数的期望最大化算法，计算每个候选源样品对污染受体样品的贡献度并识别出有效污染源。本申请通过引入超参数的期望最大化算法，对候选源样品进行增强识别并定量解析，实现从大量源样品中计算每个候选源样品对污染受体样品的贡献度并识别出有效污染源，极大提升了源解析技术的抗干扰能力，充分利用污染源数据库进行溯源，并且能够在没有候选源样品的情况下进行溯源。

公开(公告)号：CN118243888A

公开(公告)日：2024-06-25

申请号：CN202410666328.0

申请日：2024-05-28

Applicant: 北京大学

Inventor： 陈倩 ,  陈天一 ,  孙卫玲 ,  倪晋仁

IPC: G01N33/18 ,  G06F17/16 ,  G06N20/00 ,  G06N5/01 ,  G06F18/2431

Abstract: 本发明公开一种耦合生物和非生物要素的水质综合评价方法及系统，涉及环境监测和环境保护技术领域，方法包括获取待检测水域的非生物要素；采用环境DNA技术构建生物要素指标库；基于非生物要素和生物要素指标库确定基于生物‑非生物响应关系的非生物要素权重矩阵；基于所述非生物要素和LightGBM模型，得到基于机器学习的非生物要素权重矩阵；根据基于生物‑非生物响应关系的非生物要素权重矩阵和基于机器学习的非生物要素权重矩阵确定非生物要素综合权重矩阵；基于非生物要素综合权重矩阵和非生物要素开展待检测水域水质综合评价确定待检测水域的水质综合评价结果，本发明能够全面、准确和快速的实现多元化水质综合评价。

公开(公告)号：CN117219165B

公开(公告)日：2024-03-08

申请号：CN202311465605.3

申请日：2023-11-07

Applicant: 北京大学 ,  成都市环境保护科学研究院

Inventor： 孙卫玲 ,  游秀琪 ,  陈倩 ,  袁一斌 ,  张玉娇 ,  韩迁

IPC: G16B30/00 ,  G16B40/00

公开(公告)号：CN117272070A

公开(公告)日：2023-12-22

申请号：CN202311548690.X

申请日：2023-11-21

Applicant: 北京大学 ,  成都市环境保护科学研究院

Inventor： 孙卫玲 ,  吕轶韬 ,  陈倩 ,  袁一斌 ,  张玉娇 ,  韩迁

IPC: G06F18/22 ,  G06F18/214 ,  G06F18/15 ,  G06F18/2415 ,  G06F17/16

Abstract: 一种同时利用有机和无机污染物的定量源解析方法，包括以下步骤：采集污染源和污染受体样品并进行样品预处理；对预处理后的样品进行仪器分析，获取有机和无机污染物的定量浓度数据；依据污染源和污染受体位置信息，构建源‑汇关系；耦合有机和无机污染物的多来源数据和源‑汇关系，构建污染源和污染受体的特征向量；依据特征向量构建输入矩阵，采用快速期望最大化法或贝叶斯方法定量计算各源贡献。本发明耦合了有机污染物、金属元素和无机阴离子多种污染物数据，全面、精准评价污染源贡献，可实现存在多类别污染源情形下的快速、准确源解析。

公开(公告)号：CN113142034B

公开(公告)日：2023-02-28

申请号：CN202110325961.X

申请日：2021-03-26

Applicant: 北京大学

Inventor： 王佳文 ,  陈倩 ,  倪晋仁 ,  刘宇心 ,  刘清香

IPC: C12Q1/6895

Abstract: 本发明提供一种同步鉴定水生生态系统中浮游藻类和底栖藻类的方法，包括以下步骤：步骤S1，从所述水生生态系统中采集水样和沉积物样品；步骤S2，从水样和沉积物样品中分别提取并纯化DNA；步骤S3，以纯化的DNA作为模板进行PCR扩增；步骤S4，对PCR扩增的产物进行高通量测序，获取藻类ASV代表序列；步骤S5，建立藻类物种注释数据库；步骤S6，将藻类ASV代表序列与藻类物种注释数据库的序列数据进行比对和物种注释，获取藻类物种组成信息。该方法基于藻类遗传物质的差异，通过高通量测序技术，实现高效且快速地同步鉴定生态系统中水体和沉积物中的所有真核和原核藻类的物种组成。

公开(公告)号：CN112342284B

公开(公告)日：2022-09-16

申请号：CN202011119177.5

申请日：2020-10-19

Applicant: 北京大学

Inventor： 刘思彤 ,  赵云鹏 ,  陈倩

IPC: C12Q1/6869 ,  G01N30/02

Abstract: 本发明公开了一种分析微生物群落功能基因转录和翻译活性的方法，其包括：提取微生物群落的总DNA样本、总RNA样本和总蛋白质样本；对提取样本进行宏基因组测序、宏转录组测序、宏蛋白质学分析；利用宏基因组测序结果构建微生物群落功能基因编码蛋白质数据库；基于此蛋白质数据库和宏转录组测序产生的mRNA序列数据组来分析微生物群落功能基因转录活性；基于宏蛋白质学分析结果和此蛋白质数据库来分析微生物群落功能基因翻译活性。本发明构建了统一的微生物群落功能基因组蛋白质数据库，并根据此数据库分析群落功能基因转录与翻译的表达量，直接比较群落功能基因转录和翻译表达水平的差异，进而研究群落功能基因的转录后调控过程。

公开(公告)号：CN107201329A

公开(公告)日：2017-09-26

申请号：CN201710474774.1

申请日：2017-06-21

Applicant: 北京大学

Inventor： 倪晋仁 ,  桂梦瑶 ,  陈倩

IPC: C12N1/20 ,  C02F3/02 ,  C02F3/34 ,  C12R1/025 ,  C02F101/22 ,  C02F101/16

Abstract: 本发明涉及一株兼具六价铬去除和好氧反硝化性能的无色杆菌(Achromobacter sp.)及其在污水处理中的应用。该无色杆菌保藏号为CGMCC № 2964，其不但具有去除六价铬的能力，同时具有在好氧条件下的反硝化能力。当污水中六价铬浓度在4～8mg/L范围内，该菌株能够以硝酸盐氮为唯一氮源，在好氧环境下硝酸盐氮的去除率可达100％，六价铬的去除率可达70％以上。本发明具有操作便捷，脱氮效率高等优点，对优化污水生物处理系统和减弱六价铬对污水脱氮系统的影响具有重要意义。