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公开(公告)号：CN113142034A
公开(公告)日：2021-07-23
申请号：CN202110325961.X
申请日：2021-03-26
Applicant: 北京大学
IPC: A01G31/00
Abstract: 本发明提供一种同步鉴定水生生态系统中浮游藻类和底栖藻类的方法，包括以下步骤：步骤S1，从所述水生生态系统中采集水样和沉积物样品；步骤S2，从水样和沉积物样品中分别提取并纯化DNA；步骤S3，以纯化的DNA作为模板进行PCR扩增；步骤S4，对PCR扩增的产物进行高通量测序，获取藻类ASV代表序列；步骤S5，建立藻类物种注释数据库；步骤S6，将藻类ASV代表序列与藻类物种注释数据库的序列数据进行比对和物种注释，获取藻类物种组成信息。该方法基于藻类遗传物质的差异，通过高通量测序技术，实现高效且快速地同步鉴定生态系统中水体和沉积物中的所有真核和原核藻类的物种组成。
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公开(公告)号：CN112951330A
公开(公告)日：2021-06-11
申请号：CN202110169153.9
申请日：2021-02-07
Applicant: 北京大学
Abstract: 本发明属于水土污染防治领域，具体涉及一种基于宏组学技术从复杂环境体系中获知全程氨氧化微生物相对丰度和活性的方法。本发明通过宏基因组/宏转录组测序及生物信息学处理，从环境复杂的微生物群落中提取全程氨氧化微生物基因组及转录本，明确体系中全程氨氧化微生物的相对丰度、活性和群落结构特征，构建群体代谢潜能模型的完整图景，从而确定该类微生物对氮转化过程的潜在贡献。该方法具有通量高、灵敏度高、准确率高的特点，无需对微生物进行富集、培养，具有“原位”特性，适用于大规模的采样调查研究，对特定区域硝化管理策略的优化具有重要意义。
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公开(公告)号：CN113142034B
公开(公告)日：2023-02-28
申请号：CN202110325961.X
申请日：2021-03-26
Applicant: 北京大学
IPC: C12Q1/6895
Abstract: 本发明提供一种同步鉴定水生生态系统中浮游藻类和底栖藻类的方法，包括以下步骤：步骤S1，从所述水生生态系统中采集水样和沉积物样品；步骤S2，从水样和沉积物样品中分别提取并纯化DNA；步骤S3，以纯化的DNA作为模板进行PCR扩增；步骤S4，对PCR扩增的产物进行高通量测序，获取藻类ASV代表序列；步骤S5，建立藻类物种注释数据库；步骤S6，将藻类ASV代表序列与藻类物种注释数据库的序列数据进行比对和物种注释，获取藻类物种组成信息。该方法基于藻类遗传物质的差异，通过高通量测序技术，实现高效且快速地同步鉴定生态系统中水体和沉积物中的所有真核和原核藻类的物种组成。
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公开(公告)号：CN112951330B
公开(公告)日：2022-09-27
申请号：CN202110169153.9
申请日：2021-02-07
Applicant: 北京大学
Abstract: 本发明属于水土污染防治领域，具体涉及一种基于宏组学技术从复杂环境体系中获知全程氨氧化微生物相对丰度和活性的方法。本发明通过宏基因组/宏转录组测序及生物信息学处理，从环境复杂的微生物群落中提取全程氨氧化微生物基因组及转录本，明确体系中全程氨氧化微生物的相对丰度、活性和群落结构特征，构建群体代谢潜能模型的完整图景，从而确定该类微生物对氮转化过程的潜在贡献。该方法具有通量高、灵敏度高、准确率高的特点，无需对微生物进行富集、培养，具有“原位”特性，适用于大规模的采样调查研究，对特定区域硝化管理策略的优化具有重要意义。
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