公开(公告)号：CN113142034B

公开(公告)日：2023-02-28

申请号：CN202110325961.X

申请日：2021-03-26

Applicant: 北京大学

Inventor： 王佳文 ,  陈倩 ,  倪晋仁 ,  刘宇心 ,  刘清香

IPC: C12Q1/6895

Abstract: 本发明提供一种同步鉴定水生生态系统中浮游藻类和底栖藻类的方法，包括以下步骤：步骤S1，从所述水生生态系统中采集水样和沉积物样品；步骤S2，从水样和沉积物样品中分别提取并纯化DNA；步骤S3，以纯化的DNA作为模板进行PCR扩增；步骤S4，对PCR扩增的产物进行高通量测序，获取藻类ASV代表序列；步骤S5，建立藻类物种注释数据库；步骤S6，将藻类ASV代表序列与藻类物种注释数据库的序列数据进行比对和物种注释，获取藻类物种组成信息。该方法基于藻类遗传物质的差异，通过高通量测序技术，实现高效且快速地同步鉴定生态系统中水体和沉积物中的所有真核和原核藻类的物种组成。

公开(公告)号：CN113142034A

公开(公告)日：2021-07-23

申请号：CN202110325961.X

申请日：2021-03-26

Applicant: 北京大学

Inventor： 王佳文 ,  陈倩 ,  倪晋仁 ,  刘宇心 ,  刘清香

IPC: A01G31/00

Abstract: 本发明提供一种同步鉴定水生生态系统中浮游藻类和底栖藻类的方法，包括以下步骤：步骤S1，从所述水生生态系统中采集水样和沉积物样品；步骤S2，从水样和沉积物样品中分别提取并纯化DNA；步骤S3，以纯化的DNA作为模板进行PCR扩增；步骤S4，对PCR扩增的产物进行高通量测序，获取藻类ASV代表序列；步骤S5，建立藻类物种注释数据库；步骤S6，将藻类ASV代表序列与藻类物种注释数据库的序列数据进行比对和物种注释，获取藻类物种组成信息。该方法基于藻类遗传物质的差异，通过高通量测序技术，实现高效且快速地同步鉴定生态系统中水体和沉积物中的所有真核和原核藻类的物种组成。