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公开(公告)号：CN119061115A
公开(公告)日：2024-12-03
申请号：CN202310627933.2
申请日：2023-05-30
Applicant: 北京大学
IPC: C12Q1/6806 , C12Q1/6874 , C12M1/34 , C12M1/00 , G16B20/30
Abstract: 本发明提供一种可编程表观遗传修饰的DNA分子探针制备方法和装置，包括：获取单链DNA并按照预定顺序分为不同区域，每个区域预先分配一个至多个表观遗传修饰位点；基于单链DNA不同区域的修饰分布信息，引入与各个区域互补的DNA短链，DNA短链内携带有表观遗传修饰信息；DNA短链与单链DNA杂交形成杂交体；根据DNA短链上的表观遗传修饰信息，选用对应的生物酶，对杂交体进行表观遗传修饰化学基团链转移反应，得到可编程表观遗传修饰的DNA分子探针。本发明利用探针序列的可编程性和纳米材料种类多样性，按需要设计不同结构的DNA探针和选择不同类型的纳米材料合成功能化的纳米探针，以研究基因在不同位置被修饰后基因表达水平的改变，在生物领域具有较大应用前景。
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公开(公告)号：CN114581724A
公开(公告)日：2022-06-03
申请号：CN202210485325.8
申请日：2022-05-06
Applicant: 北京大学
IPC: G06V10/764 , G06K9/62 , G06N3/00 , G06N3/04 , G06N3/08
Abstract: 本发明公开了一种生物分子冷冻电镜数据的构象分类方法，属于结构生物学与计算科学的交叉领域。本发明在卷积残差神经网络模型的基础上，对冷冻电镜单颗粒数据进行有监督的高精度构象分类，以发现生物分子的新构象类，使单颗粒图像数据进行性能更为强大的监督分类成为可能，从而获得生物分子潜在新构象状态的结构。
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公开(公告)号：CN114580603A
公开(公告)日：2022-06-03
申请号：CN202210484308.2
申请日：2022-05-06
Applicant: 北京大学
IPC: G06N3/00 , G06N3/04 , G06N3/08 , G06K9/62 , G06V10/764
Abstract: 本发明公开了一种基于冷冻电镜数据构建单颗粒水平的能量曲面的方法，属于数据科学与生物学的交叉领域。本发明通过单颗粒数据的分组分类、三维电子密度图数据集的低维流形映射、单颗粒图像与其对应投影图像的相似程度计算、利用卷积神经网络的训练与预测得到单颗粒水平的能量曲面。本发明得到单颗粒水平能量曲面，可以直观反映生物分子构象分布，扩展了冷冻电镜数据多构象分析的方式，提高了数据处理结果对高噪声的鲁棒性。
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公开(公告)号：CN103361263A
公开(公告)日：2013-10-23
申请号：CN201310291183.2
申请日：2013-07-11
Applicant: 北京大学
Abstract: 本发明涉及生物学技术领域，特别涉及一种细胞趋化分析芯片，包括进液腔室、趋化通道、栅栏通道和吸液腔室；进液腔室设有用于加入细胞溶液的进液口；进液腔室用于容纳细胞溶液；趋化通道的一端与进液腔室相连通，趋化通道的另一端与栅栏通道的一端相连通，趋化通道的内径大于细胞溶液中所含细胞的直径；栅栏通道的内径小于细胞溶液中所含细胞的直径；栅栏通道的另一端与吸液腔室相连通；吸液腔室用于吸收细胞溶液中的溶液。本发明还涉及该细胞趋化分析芯片的使用方法和制作方法。本发明可以非常方便的定量观测到细胞在特定浓度梯度下的趋化过程，排除流动对此过程的影响，为细胞趋化行为的研究提供了方便。
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公开(公告)号：CN1425777A
公开(公告)日：2003-06-25
申请号：CN03100489.X
申请日：2003-01-16
Applicant: 北京大学
Abstract: 本发明提供了一种能够在分子水平进行机械操作的可开关的工具——活性基因分子纳米舱，由多个基因分子单元在固体衬底上重复排列构成，每个基因分子单元包含一段双链和一段单链；相对于固体衬底，单链部分靠近衬底，双链部分远离衬底；单链部分的一端固联在固体衬底表面；各基因分子单元的双链部分紧密排列形成一层致密的分子膜，从而在双链部分形成的分子膜和固体衬底表面之间形成一个纳米量级高度的分子舱。本发明还提供了所述活性基因分子纳米舱的制备方法。本发明的活性基因分子纳米舱，可以在分子水平进行人工操作，包括分子捕捉、基因识别、微能量存储与释放等，可应用于分子生物学、生物化学的研究，广泛用于生物物理材料(如生物芯片)的制造和发展。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN1082189C
公开(公告)日：2002-04-03
申请号：CN98120104.0
申请日：1998-09-29
Applicant: 北京大学
Abstract: 本发明光纤阵列型基因芯片，其制作方法是预先在单根光纤单元的端面生长基因探针并固化后，再将一组带不同基因探针的光纤单元排布成阵列。本发明的特点是相邻基因探针间不会形成串扰，光纤阵列型基因芯片允许在光纤单元两端进行检测，每种光纤单元的基因探针生长可大批量一次性完成，再组合成一定规格的阵列。本发明可靠性高，检测灵敏度高，制作效率高且成本低，可广泛应用于分子生物学，生物医学及人类基因组研究，以至临床诊断。
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公开(公告)号：CN117672375A
公开(公告)日：2024-03-08
申请号：CN202311435775.7
申请日：2023-10-31
Applicant: 北京大学
Abstract: 本发明提供一种合成生物学元件挖掘方法、装置、电子设备及存储介质，通过根据用户输入的功能描述信息筛选出与所述功能相关的文献；从与功能相关的文献提取基因实体、物种实体和功能实体，以及基因和功能之间的关系；将基因实体、物种实体和功能实体，以及基因和功能之间的关系与生物数据库中存储的结构化生物数据结合，获取与功能相关的知识；对与功能相关的知识进行筛选，获取用户所需的候选生物元件信息；将文本挖掘出的非结构化数据与生物医药领域数据库中结构化数据的有机融合，在基因、功能和知识结构三个层面进行交叉验证，实现了元件的通用化、智能化、自动化挖掘，是合成生物学丰富元件库、提高元件多样性的渠道。
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公开(公告)号：CN115985398A
公开(公告)日：2023-04-18
申请号：CN202211677721.7
申请日：2022-12-26
Applicant: 北京大学
Abstract: 本发明提供一种DNA分子序列的信息存储方法、装置、电子设备和存储介质，其中方法包括：对目标数据进行编码，并在编码得到的序列中添加引导碱基进行序列锚定，得到待处理序列；对待处理序列进行切分，得到对应的若干子序列，并对若干子序列中的每一个子序列进行序列扩展，得到每一个子序列对应的序列集合；对序列集合进行筛选，得到若干子序列中每一个子序列对应的标准子序列；基于标准子序列进行序列组合，得到目标数据对应的目标DNA序列，并将目标DNA序列合成为DNA分子。使得在进行长读长测序即单分子测序时，能够准确的对错误序列进行纠正，提高了DNA分子中信息读取的稳定性。
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公开(公告)号：CN114545554B
公开(公告)日：2022-07-22
申请号：CN202210456612.6
申请日：2022-04-28
Applicant: 北京大学
IPC: G02B6/122
Abstract: 本发明公开了一种基于能谷光子晶体与金属微纳光学腔的可控开关光耦合器，通过将二维能谷光子晶体的边界态模式与金属表面等离激元的共振模式相结合，构造出微纳尺度的混合光学模式，解决了可调控性与拓扑鲁棒性二者的矛盾，其中，边界态模式可以控制耦合器的分光比，而金属微纳光学腔能够控制输出端是否有光输出，从而实现了可控开关且分束比动态可调的光耦合器，提高了能谷光子晶体阵列波导的调控自由度。该动态可调控拓扑光子耦合器可以用于集成光电子芯片，作为光电信息处理的重要平台。
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公开(公告)号：CN112063510A
公开(公告)日：2020-12-11
申请号：CN202010772736.6
申请日：2020-08-04
Applicant: 北京大学
Abstract: 本发明提供一种高通量细胞培养芯片的结构及其制作与使用方法，包括培养层芯片和进样层芯片；培养层芯片包括若干主通道结构和与主通道结构对应连通的多个分支结构；每个分支结构包括培养层连接区；进样层芯片包括：多个通道结构；每个通道结构均包括：多个进样层连接区；每个进样层连接区均与分支结构上的一培养层连接区连通。本发明提供的高通量细胞培养芯片的结构，通过将培养层芯片中的培养层连接区与进样层芯片中的进样层连接区连通，通过不同功能流道的分层连接结构，大幅简化了针对不同环境培养的细胞样品进样流程，使多种标记的细胞能够直接通过进样层芯片被装载入不同培养环境的培养层芯片，实现高通量的定量研究细胞在不同环境下的检测。
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