公开(公告)号：CN119020524A

公开(公告)日：2024-11-26

申请号：CN202411137906.8

申请日：2024-08-19

Applicant: 中国农业科学院深圳农业基因组研究所(岭南现代农业科学与技术广东省实验室深圳分中心)

Inventor： 刘毓文 ,  鲍泳舟 ,  宋琰未 ,  李昭宏 ,  陈云 ,  郑伟刚

IPC: C12Q1/6895 ,  C12Q1/6869 ,  G16B30/20

Abstract: 本申请公开了一种基于STARR‑seq在植物体内筛选活性调控元件的方法和活性调控元件，方法包括：将多个片段化序列连接到载体的核酸序列中，以得到包括片段化序列的初始目标载体文库；将目标载体文库转入可侵染微生物，接着通过可侵染微生物将多个片段化序列转入目的植株，并将目的植株进行培养，以使片段化序列表达；对微生物中的文库进行检测获得第一株植物的输入文库；检测目的植株中的片段化序列表达情况，以得到输出文库；比较输出文库和输入文库中多个片段化序列的含量，以实现从多个片段化序列中筛选出活性调控元件。该方法在植物体内进行高通量筛选，真实地反映了植物体内细胞环境，得到不同外界环境以及调控元件的真实活性。