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公开(公告)号：CN117116355A
公开(公告)日：2023-11-24
申请号：CN202311109290.9
申请日：2023-08-30
Applicant: 中国农业科学院农业信息研究所
Abstract: 本发明涉及基因挖掘技术领域，公开了一种优异多效基因的挖掘方法、装置、设备及介质，包括：选取实体类并确定对应的数据属性及对象属性，来构建性状调控基因本体模型；从多源数据库中抽取各类实体及其之间的关系来构建三元组，并通过多源知识融合来生成性状调控基因知识图谱；基于不同实体之间的连接关系构建性状调控基因预测模型；基于预测模型计算未知性状基因与不同已知性状基因之间的相似度，若相似度超过预设阈值则预测未知性状基因与已知性状基因调控相同的性状，当预测的性状超过预设个数则未知性状基因为优异多效基因。本发明能够提高知识发现结果的可解释性，增加生物学意义上的特征考虑，进而提高优异多效基因挖掘的可靠性与准确率。
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公开(公告)号：CN119358775A
公开(公告)日：2025-01-24
申请号：CN202411918500.3
申请日：2024-12-24
Applicant: 中国农业科学院农业信息研究所
IPC: G06Q10/04 , G06Q50/02 , G06N5/025 , G06N5/02 , G06N3/042 , G06N3/0455 , G06N3/08 , G06F18/27 , G06F123/02
Abstract: 本发明涉及作物管理技术领域，公开了一种产量的预测方法、装置、设备、介质及程序产品，方法包括：获取目标地区范围的历史时间内作物的历史产量及产量影响因素的历史参数值；构建产量、影响因素、时间之间的时序知识图谱；将时序知识图谱作为产量时序预测模型的输入，得到目标地区范围内作物的预估产量；基于可解释模型对产量时序预测模型的预测结果进行可解释分析，确定产量影响因素对预估产量的影响程度。本发明通过构建时序知识图谱，并进行模型产量预测和可解释分析，能够将连续时间内影响因素数据进行有效关联融合，揭示多影响因素之间的动态耦合关系，提高产量预测的准确率，为技术人员提供可靠的数据参考和科学指导，进而提高小麦产量。
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公开(公告)号：CN117079712B
公开(公告)日：2024-02-20
申请号：CN202311109387.X
申请日：2023-08-30
Applicant: 中国农业科学院农业信息研究所
Abstract: 本发明涉及通路基因簇挖掘技术领域，公开了一种通路基因簇的挖掘方法、装置、设备及介质，包括：选取实体类及对应的数据属性和对象属性来构建性状调控基因本体模型；构建性状调控基因本体模型中各类实体之间的三元组来生成性状调控基因知识图谱；构建蛋白互作预测模型；基于性状调控基因知识图谱获取待挖掘蛋白的互作蛋白连通子图，并根据蛋白互作预测模型的互作关系预测对其进行补充，从而挖掘出互作蛋白完全子图；基于互作蛋白完全子图挖掘蛋白和对应基因之间的共连实体节点来获得基因结构图，并通过物理位置判断来获得通路基因簇。本发明能够增强互作蛋白预测的准确率，并成功进行通路基因簇的挖掘。
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公开(公告)号：CN117116355B
公开(公告)日：2024-02-20
申请号：CN202311109290.9
申请日：2023-08-30
Applicant: 中国农业科学院农业信息研究所
Abstract: 本发明涉及基因挖掘技术领域，公开了一种优异多效基因的挖掘方法、装置、设备及介质，包括：选取实体类并确定对应的数据属性及对象属性，来构建性状调控基因本体模型；从多源数据库中抽取各类实体及其之间的关系来构建三元组，并通过多源知识融合来生成性状调控基因知识图谱；基于不同实体之间的连接关系构建性状调控基因预测模型；基于预测模型计算未知性状基因与不同已知性状基因之间的相似度，若相似度超过预设阈值则预测未知性状基因与已知性状基因调控相同的性状，当预测的性状超过预设个数则未知性状基因为优异多效基因。本发明能够提高知识发现结果的可解释性，增加生物学意义上的特征考虑，进而提高优异多效基因挖掘的可靠性与准确率。
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公开(公告)号：CN117079712A
公开(公告)日：2023-11-17
申请号：CN202311109387.X
申请日：2023-08-30
Applicant: 中国农业科学院农业信息研究所
Abstract: 本发明涉及生物合成基因簇挖掘技术领域，公开了一种生物合成基因簇的挖掘方法、装置、设备及介质，包括：选取实体类及对应的数据属性和对象属性来构建性状调控基因本体模型；构建性状调控基因本体模型中各类实体之间的三元组来生成性状调控基因知识图谱；构建蛋白互作预测模型；基于性状调控基因知识图谱获取待挖掘蛋白的互作蛋白连通子图，并根据蛋白互作预测模型的互作关系预测对其进行补充，从而挖掘出互作蛋白完全子图；基于互作蛋白完全子图挖掘蛋白和对应基因之间的共连实体节点来获得基因结构图，并通过物理位置判断来获得生物合成基因簇。本发明能够增强互作蛋白预测的准确率，并成功进行生物合成基因簇的挖掘。
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