公开(公告)号：CN107287326A

公开(公告)日：2017-10-24

申请号：CN201710619782.0

申请日：2017-07-26

Applicant: 中国人民解放军南京军区南京总医院

Inventor： 饶秋 ,  夏秋媛 ,  方茹 ,  叶胜兵 ,  李芳秋 ,  周晓军

IPC: C12Q1/68 ,  C12N15/11

CPC classification number: C12Q1/6886 ,  C12Q2600/112

Abstract: 本发明公开了一种Xp11.2的新易位伴侣FUBP1及其检测引物和应用。Xp11.2的新易位伴侣为FUBP1-TFE3基因易位，FUBP1基因位于1p31.1，共22个外显子；基因融合发生于FUBP1的17号外显子与TFE3基因2号外显子之间；优选包含SEQ ID NO.3所示的核苷酸序列。一种检测FUBP1-TFE3易位性肿瘤的PCR引物，上游引物FUBP1-E17-F序列如SEQ ID NO.1所示；下游引物TFE3-E2-R序列如SEQ ID NO.2所示。本发明针对高通量测序发现的新融合位点设计了特异性的PCR引物，扩大了原引物组合的检测范围，应用于临床，可提高诊断该类肿瘤的检出率和准确率。

公开(公告)号：CN107287326B

公开(公告)日：2018-02-16

申请号：CN201710619782.0

申请日：2017-07-26

Applicant: 中国人民解放军南京军区南京总医院

Inventor： 饶秋 ,  夏秋媛 ,  方茹 ,  叶胜兵 ,  李芳秋 ,  周晓军

IPC: C12Q1/6886 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明公开了一种Xp11.2的新易位伴侣FUBP1及其检测引物和应用。Xp11.2的新易位伴侣为FUBP1‑TFE3基因易位，FUBP1基因位于1p31.1，共22个外显子；基因融合发生于FUBP1的17号外显子与TFE3基因2号外显子之间；优选包含SEQ ID NO.3所示的核苷酸序列。一种检测FUBP1‑TFE3易位性肿瘤的PCR引物，上游引物FUBP1‑E17‑F序列如SEQ ID NO.1所示；下游引物TFE3‑E2‑R序列如SEQ ID NO.2所示。本发明针对高通量测序发现的新融合位点设计了特异性的PCR引物，扩大了原引物组合的检测范围，应用于临床，可提高诊断该类肿瘤的检出率和准确率。