染色体拓扑关联结构域的预测方法及预测系统

    公开(公告)号:CN114446384B

    公开(公告)日:2024-11-05

    申请号:CN202210245600.9

    申请日:2022-03-14

    Applicant: 中南大学

    Abstract: 本发明公开了一种染色体拓扑关联结构域的预测方法,包括获取基因组区块之间互作矩阵中每个基因组区块并识别得到高频互作区;针对每个基因组区块从高频互作区中识别准核:处理每条染色体上识别的准核得到互不重叠的准核;对一条染色体上互不重叠的准核进行合并得到要预测的染色体拓扑关联结构域的核;确定附件候选区中每个基因组区块的从属关系并结合染色体拓扑关联结构域的核得到最终预测的染色体拓扑关联结构域。本发明还公开了一种实现所述染色体拓扑关联结构域的预测方法的预测系统。本发明充分利用Hi‑C数据的全局信息,缩减候选边界定位的范围,无需用户给出预定义参数,能够准确预测拓扑关联结构域,可靠性高、准确性好且效果较好。

    多标签lncRNA亚细胞定位预测方法、系统、设备及介质

    公开(公告)号:CN117133363A

    公开(公告)日:2023-11-28

    申请号:CN202311118735.X

    申请日:2023-09-01

    Applicant: 中南大学

    Abstract: 本发明公开了一种多标签lncRNA亚细胞定位预测方法、系统、设备及介质,其中方法包括:使用子序列嵌入技术对待测lncRNA序列进行编码;利用Transformer模型中的位置编码和多头注意力机制,对lncRNA序列中的远程依赖关系进行建模,实现lncRNA序列内部的信息流转和共享;使用定位特异性注意力机制,为不同的亚细胞定位学习不同的注意力权重矩阵;基于Transformer模型捕获到的lncRNA序列高级特征及不同的亚细胞定位注意力权重矩阵,利用全连接网络,对待测lncRNA序列进行亚细胞定位输出。本发明比现有计算模型有着更好的预测性能,可以同时预测任意lncRNA序列的多个亚细胞定位。

    一种交联功能化修饰的聚丙烯酰胺及其制备方法与应用

    公开(公告)号:CN118684911A

    公开(公告)日:2024-09-24

    申请号:CN202410864622.2

    申请日:2024-06-28

    Applicant: 中南大学

    Abstract: 本发明公开了一种交联功能化修饰的聚丙烯酰胺及其制备方法与应用,该方法通过将聚丙烯酰胺与结构式为R‑(NH2)2的化合物在惰性气体环境下进行交联反应得到。该方法具有无引发剂和溶剂参与、反应速度快、操作过程简易且产率较高的特点,避免了其它无关副产品的生成,且通过该方法得到的交联功能化修饰的聚丙烯酰胺该化合物中不仅引入了双位点的功能化基团,且该化合物具有稳定的交联结构,在絮凝沉降过程对铁的捕获提供了丰富的配位位点,能够协同聚丙烯酰胺主体单元显著增加对铁元素的絮凝稳定性和选择性。

    染色体拓扑关联结构域的预测方法及预测系统

    公开(公告)号:CN114446384A

    公开(公告)日:2022-05-06

    申请号:CN202210245600.9

    申请日:2022-03-14

    Applicant: 中南大学

    Abstract: 本发明公开了一种染色体拓扑关联结构域的预测方法,包括获取基因组区块之间互作矩阵中每个基因组区块并识别得到高频互作区;针对每个基因组区块从高频互作区中识别准核:处理每条染色体上识别的准核得到互不重叠的准核;对一条染色体上互不重叠的准核进行合并得到要预测的染色体拓扑关联结构域的核;确定附件候选区中每个基因组区块的从属关系并结合染色体拓扑关联结构域的核得到最终预测的染色体拓扑关联结构域。本发明还公开了一种实现所述染色体拓扑关联结构域的预测方法的预测系统。本发明充分利用Hi‑C数据的全局信息,缩减候选边界定位的范围,无需用户给出预定义参数,能够准确预测拓扑关联结构域,可靠性高、准确性好且效果较好。

    一种吡啶基功能化絮凝剂及其制备方法与应用

    公开(公告)号:CN118667046A

    公开(公告)日:2024-09-20

    申请号:CN202410852530.2

    申请日:2024-06-28

    Applicant: 中南大学

    Abstract: 本发明公开了一种吡啶基功能化修饰的聚丙烯酰胺及其制备方法与应用,该方法通过将聚丙烯酰胺与含吡啶基的化合物在惰性气体环境下进行氨交换反应得到。该方法具有无引发剂和溶剂参与、反应速度快、操作过程简易且产率较高的特点,避免了其它无关副产品的生成,且通过向聚丙烯酰胺主体单元中引入了单位点的吡啶基功能化基团,为絮凝沉降过程对铁的捕获提供了充分的配位位点,显著提高了化合物作为絮凝剂的絮凝效果。

    基于图对比学习融合注意力机制的lncRNA亚细胞定位预测方法、系统、设备及介质

    公开(公告)号:CN117393055A

    公开(公告)日:2024-01-12

    申请号:CN202311528182.5

    申请日:2023-11-16

    Applicant: 中南大学

    Abstract: 本发明公开了一种基于图对比学习融合注意力机制的lncRNA亚细胞定位预测方法、系统、设备及介质,方法包括:将每个lncRNA序列样本转化为对应的德布鲁因图;使用基于图卷积和全局注意力机制的编码器获取德布鲁因图的编码向量,再使用解码器解码;基于正负样本对的解码向量构建有监督的对比学习损失函数,再结合分类器对输入编码向量的定位预测概率构建的分类损失函数,得到整体损失函数;利用lncRNA序列样本并基于整体损失函数,学习整体模型参数;对于待进行亚细胞定位预测的lncRNA序列,将其转化为德布鲁因图,并使用编码器获取编码向量,再使用分类器进行亚细胞定位预测。本发明对lncRNA亚细胞定位预测精度高。

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