公开(公告)号：CN112908410B

公开(公告)日：2022-08-23

申请号：CN202110223562.2

申请日：2021-03-01

Applicant: 上海欧易生物医学科技有限公司

Inventor： 安冬 ,  肖云平 ,  史贤俊 ,  林博 ,  刘钰钏 ,  顾胤聪 ,  鲍志贵 ,  范旭蕾

IPC: G16B20/00 ,  G16B25/00 ,  G16B40/30 ,  G16B30/10 ,  G16B50/10

Abstract: 本发明公开了一种基于snakemake流程的正选择基因的检测方法，能够高效快速鉴定目标物种受正选择基因，为解析物种环境适应性的分子机制、物种演化提供分子依据。本发明还公开了一种实现上述方法的检测系统，所述检测系统具体包括：序列提取模块、基因家族聚类模块、多序列比对模块、基因树构建模块、基因树标记模块、正选择筛选模块。本发明基于snakemake流程的正选择基因的检测方法和检测系统可以高效鉴定目标物种在进化过程中受正选择的基因，对于研究物种对环境适应等演化机制的研究有重要意义。本发明还提出了一种基于snakemake流程的正选择基因的检测系统。

公开(公告)号：CN112908410A

公开(公告)日：2021-06-04

申请号：CN202110223562.2

申请日：2021-03-01

Applicant: 上海欧易生物医学科技有限公司

Inventor： 安冬 ,  肖云平 ,  史贤俊 ,  林博 ,  刘钰钏 ,  顾胤聪 ,  鲍志贵 ,  范旭蕾

IPC: G16B20/00 ,  G16B25/00 ,  G16B40/30 ,  G16B30/10 ,  G16B50/10

Abstract: 本发明公开了一种基于snakemake流程的正选择基因的检测方法，能够高效快速鉴定目标物种受正选择基因，为解析物种环境适应性的分子机制、物种演化提供分子依据。本发明还公开了一种实现上述方法的检测系统，所述检测系统具体包括：序列提取模块、基因家族聚类模块、多序列比对模块、基因树构建模块、基因树标记模块、正选择筛选模块。本发明基于snakemake流程的正选择基因的检测方法和检测系统可以高效鉴定目标物种在进化过程中受正选择的基因，对于研究物种对环境适应等演化机制的研究有重要意义。本发明还提出了一种基于snakemake流程的正选择基因的检测系统。