公开(公告)号：CN111524555A

公开(公告)日：2020-08-11

申请号：CN202010313064.2

申请日：2020-04-20

Applicant: 上海欧易生物医学科技有限公司

Inventor： 王树伟 ,  肖云平 ,  史贤俊 ,  林博 ,  张建明

IPC: G16B40/30

Abstract: 本发明公开了一种基于人肠道菌群的自动化分型方法，采用LEfSe方式对聚类结果分组进行Biomarker筛选，然后确定具体肠型，结果全面，包含涉及到的聚类图、Biomarker筛选、肠型boxplot图展示，可自动整理所有分析结果，每一步分析完成之后自动对结果进行汇总统计，可视化，而且，所有操作步骤可以溯源，方便错误查询，如果分析报错，会有对应的报错日志信息。

公开(公告)号：CN112967756B

公开(公告)日：2022-07-26

申请号：CN202110338467.7

申请日：2021-03-30

Applicant: 上海欧易生物医学科技有限公司

Inventor： 张建明 ,  顾胤聪 ,  肖云平 ,  史贤俊 ,  刘钰钏 ,  林博

IPC: G16B30/00 ,  G16B40/00 ,  G16B45/00 ,  G16B50/00 ,  G06Q10/10

Abstract: 本发明公开了一种基于snakemake语言快速批量可自动邮件反馈结果的高通量测序质控分析方法，所述方法具体包括如下步骤：文件准备；多样本并行fastp质控过滤；单样本fastp运行监控；所有样本fastp质控结果汇总；质控结果汇总邮件反馈；多样本并行fastqc检测；所有样本结果进行整合；分析方法图绘制。本发明所述分析方法能够对样本进行批量处理，获得的结果全面，并能够自动整理所有分析结果，进行统计汇总可视化，同时所有操作步骤可溯源，方便错误查询。

公开(公告)号：CN112967756A

公开(公告)日：2021-06-15

申请号：CN202110338467.7

申请日：2021-03-30

Applicant: 上海欧易生物医学科技有限公司

Inventor： 张建明 ,  顾胤聪 ,  肖云平 ,  史贤俊 ,  刘钰钏 ,  林博

IPC: G16B30/00 ,  G16B40/00 ,  G16B45/00 ,  G16B50/00 ,  G06Q10/10

Abstract: 本发明公开了一种基于snakemake语言快速批量可自动邮件反馈结果的高通量测序质控分析方法，所述方法具体包括如下步骤：文件准备；多样本并行fastp质控过滤；单样本fastp运行监控；所有样本fastp质控结果汇总；质控结果汇总邮件反馈；多样本并行fastqc检测；所有样本结果进行整合；分析方法图绘制。本发明所述分析方法能够对样本进行批量处理，获得的结果全面，并能够自动整理所有分析结果，进行统计汇总可视化，同时所有操作步骤可溯源，方便错误查询。