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公开(公告)号:CN112631562A
公开(公告)日:2021-04-09
申请号:CN202011383260.3
申请日:2020-12-01
Applicant: 上海欧易生物医学科技有限公司
Abstract: 本发明公开了一种基于python的二代测序样本混样方法,包括以下步骤:文件读取并解析,样品排序到流通槽,样品添加接头序列,计算样本混样体积,输出混样表格。本发明方法可以自动检测每个流通槽是否含有接头重复,计算流通槽中最优组合的样本,并自动计算最优混样体积,输出结果清晰明了,提高生产中样本混样的效率和精确性。本发明还公开了一种上述方法在二代测序混样中的应用。
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公开(公告)号:CN112631562B
公开(公告)日:2022-08-23
申请号:CN202011383260.3
申请日:2020-12-01
Applicant: 上海欧易生物医学科技有限公司
Abstract: 本发明公开了一种基于python的二代测序样本混样方法,包括以下步骤:文件读取并解析,样品排序到流通槽,样品添加接头序列,计算样本混样体积,输出混样表格。本发明方法可以自动检测每个流通槽是否含有接头重复,计算流通槽中最优组合的样本,并自动计算最优混样体积,输出结果清晰明了,提高生产中样本混样的效率和精确性。本发明还公开了一种上述方法在二代测序混样中的应用。
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公开(公告)号:CN111353283B
公开(公告)日:2021-09-10
申请号:CN202010057492.3
申请日:2020-01-19
Applicant: 上海欧易生物医学科技有限公司
IPC: G06F40/174 , G06F40/186 , G06F8/38
Abstract: 本发明提出了一种自动化网页报告生成方法,实现高度统一的报告输出,强化了风格统一类型。生成网页报告的同时,自动化生成word报告,word报告中自动插入链接,自动生成文档目录。生成的网页报告仅保存为单一文件,所以数据均存储在文件中,统一呈现,避免显示错误。网页报告中充满了各种交互式操作内容,可以非常方便客户进行结果查看。本发明还提出了一种自动化报告生成系统。
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公开(公告)号:CN112764894A
公开(公告)日:2021-05-07
申请号:CN202011465097.5
申请日:2020-12-14
Applicant: 上海欧易生物医学科技有限公司
Abstract: 本发明提供了一种基于容器技术的生信分析任务调度系统,该系统包括分析镜像仓库模块,镜像智能拉取模块,任务调度模块,任务运行模块。本发明不仅解决了分析环境搭建难的问题,而且具备可移植,一次搭建,多处使用的优点。使用该生信分析任务调度系统对生信分析任务进行了有效管理,方便分析任务迭代式升级,支持实时查看任务运行状态,极大避免了计算资源的浪费和挤兑的情况,大幅减少了生信分析人员重复搭建生信分析环境花费的工时,有效保证了分析任务的稳定性,同时降低了企业运营的成本。本发明还提供了一种基于上述系统的生信分析任务调度方案,使用该任务调度方案极大地优化了资源配置,促进了产能的提升。
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公开(公告)号:CN111353283A
公开(公告)日:2020-06-30
申请号:CN202010057492.3
申请日:2020-01-19
Applicant: 上海欧易生物医学科技有限公司
IPC: G06F40/174 , G06F40/186 , G06F8/38
Abstract: 本发明提出了一种自动化报告生成方法,实现高度统一的报告输出,强化了风格统一类型。生成网页报告的同时,自动化生成word报告,word报告中自动插入链接,自动生成文档目录。生成的网页报告仅保存为单一文件,所以数据均存储在文件中,统一呈现,避免显示错误。网页报告中充满了各种交互式操作内容,可以非常方便客户进行结果查看。本发明还提出了一种自动化报告生成系统。
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