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公开(公告)号：CN111732637B
公开(公告)日：2022-03-01
申请号：CN202010450107.1
申请日：2020-05-25
Applicant: 上海交通大学
IPC: C07K14/165 , A61K39/215 , A61P31/14 , G01N21/19
Abstract: 本发明公开了一种抑制新型冠状病毒SARS‑CoV‑2感染宿主细胞的多肽及其应用，所述多肽包括Peptide‑1到Peptide‑10中的至少一条多肽；所述多肽含有20‑37个氨基酸；所述Peptide‑1到Peptide‑10的氨基酸序列如SEQ ID NO.1～SEQ ID NO.10所示。本发明采用敏感的圆二色性光谱法测试并观察到设计的多肽可以与SARS‑CoV‑2病毒HR1序列(其中的40个氨基酸)结合，预示本发明设计的多肽具有抑制病毒通过与宿主细胞膜融合感染细胞的能力，可以单独或者组合用于预防和治疗SARS‑CoV‑2病毒感染。
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公开(公告)号：CN109033743B
公开(公告)日：2021-01-01
申请号：CN201810828849.6
申请日：2018-07-25
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明公开了一种降低单细胞转录组数据中技术噪声的方法，包括以下步骤：步骤一，根据单细胞转录组数据获取每个基因表达的平均方差；步骤二，根据所述每个基因表达的平均方差构建卡方分布模型并使用所述卡方分布模型计算多个候选阈值；步骤三，计算使用每个所述候选阈值时所得到的有效特征向量的个数；步骤四，基于所述有效特征向量的个数判定基因滤除的最优阈值；步骤五，基于所述最优阈值进行基因滤除。本发明的降低单细胞转录组数据中技术噪声的方法，可以平衡单细胞转录组数据预处理中控制残留噪声和减小信息损失之间的矛盾，并且基于统计最优化原则降低噪声，摒除人为干扰因素，显著提高了单细胞数据解读的可靠性。
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公开(公告)号：CN108531597A
公开(公告)日：2018-09-14
申请号：CN201810416417.4
申请日：2018-05-03
Applicant: 上海交通大学医学院附属第九人民医院
IPC: C12Q1/6886
Abstract: 本发明涉及基因检测技术领域，公开了一种用于口腔鳞癌早期诊断的检测试剂盒，包括11种基因：MMP1、PLAU、SPP1、KRT15、NUM、IL1RN、HOPX、TGM3、KRT13、MAL、EMP1的mRNA序列的上、下游引物序列。本发明还公开了一种筛选用于口腔鳞癌早期诊断的基因或基因组合方法。本发明是首次提出的用于口腔鳞癌早期诊断的检测试剂盒，能客观、及早、准确、灵敏地确诊口腔鳞癌，从而有助于提高口腔鳞癌患者生存率。
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公开(公告)号：CN109116279B
公开(公告)日：2020-11-10
申请号：CN201810953635.1
申请日：2018-08-21
Applicant: 上海交通大学
IPC: G01R33/46
Abstract: 本发明公开了一种基于核磁共振谱洛伦兹曲线数学性质的小波去噪方法，涉及解谱分析领域，所述方法包括以下步骤：步骤1、对核磁共振谱数据的实数部分和虚数部分别进行离散小波变换去噪，得到小波去噪后的核磁共振谱实数部分Re和核磁共振谱虚数部分Im；步骤2、使用实数部分和虚数部分之间的数学关系，对小波去噪后的所述核磁共振谱虚数部分Im进行数学计算，得出核磁共振谱的实数部分Re’；步骤3、对Re和Re’求平均，得到最终的去噪结果。本发明提供的小波去噪的方法可以更多地去除MRS信号中的噪声，同时降低了小波去噪过程中对MRS造成的信号损伤，更多的保留了MRS数据中化合物的真实信息。
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公开(公告)号：CN111732637A
公开(公告)日：2020-10-02
申请号：CN202010450107.1
申请日：2020-05-25
Applicant: 上海交通大学
IPC: C07K14/165 , A61K39/215 , A61P31/14 , G01N21/19
Abstract: 本发明公开了一种抑制新型冠状病毒SARS-CoV-2感染宿主细胞的多肽及其应用，所述多肽包括Peptide-1到Peptide-10中的至少一条多肽；所述多肽含有20-37个氨基酸；所述Peptide-1到Peptide-10的氨基酸序列如SEQ ID NO.1～SEQ ID NO.10所示。本发明采用敏感的圆二色性光谱法测试并观察到设计的多肽可以与SARS-CoV-2病毒HR1序列(其中的40个氨基酸)结合，预示本发明设计的多肽具有抑制病毒通过与宿主细胞膜融合感染细胞的能力，可以单独或者组合用于预防和治疗SARS-CoV-2病毒感染。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN114693692B
公开(公告)日：2025-01-10
申请号：CN202210330890.7
申请日：2022-03-30
Applicant: 上海交通大学医学院附属第九人民医院
IPC: G06T7/10 , G06V10/764 , G06V10/82 , G06N3/0464 , G06N3/08
Abstract: 本申请提供的一种病理图像分割分级方法、装置和设备，通分将包含特异性病理染色标志物的原始病理图像进行经过HE‑Norm处理，分别得到H通道图像和E通道图像，并分别进行数据增强处理与标准化处理；输入卷积神经网络模型中以进行病变区域自动分割得到分割结果；将图像与分割结果输入分类器以得到病变程度的分级结果；根据分割结果和分级结果生成对应不同病变等级的分割图像。本申请能提高病理诊断的效率和准确性，对转移判断、预后预测、用药指导等进行支持，提高临床科室产能的同时为患者带来福音。
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公开(公告)号：CN113113150A
公开(公告)日：2021-07-13
申请号：CN202110406089.1
申请日：2021-04-15
Applicant: 上海交通大学医学院附属第九人民医院
Abstract: 本申请提供的一种淋巴结转移预测模型构建与训练方法、装置、设备和介质，本申请通分别获取多个转录组样本测序数据或多个miRNA样本测序数据，并从中筛选出m个转录组标记物或n个miRNA标记物；根据留一交叉验证法将样本测序数据分为训练集与测试集；判断是否发生淋巴结转移以计算二值化的转移值，并进行去均值的归一化处理，进行偏最小二乘回归模型和逻辑回归模型的建立，将测试集score值作为预测结果，得到测试集的逻辑回归预测值；循环M次以完成淋巴结转移预测模型的训练。本申请通过将标记物的表达矩阵带入机器学习模型，可实现对淋巴结转移的判断，利用转录组和miRNA两个层面数据，可将AUC提高到了90％以上，极大提高了诊断效率。
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公开(公告)号：CN109033743A
公开(公告)日：2018-12-18
申请号：CN201810828849.6
申请日：2018-07-25
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明公开了一种降低单细胞转录组数据中技术噪声的方法，包括以下步骤：步骤一，根据单细胞转录组数据获取每个基因表达的平均方差；步骤二，根据所述每个基因表达的平均方差构建卡方分布模型并使用所述卡方分布模型计算多个候选阈值；步骤三，计算使用每个所述候选阈值时所得到的有效特征向量的个数；步骤四，基于所述有效特征向量的个数判定基因滤除的最优阈值；步骤五，基于所述最优阈值进行基因滤除。本发明的降低单细胞转录组数据中技术噪声的方法，可以平衡单细胞转录组数据预处理中控制残留噪声和减小信息损失之间的矛盾，并且基于统计最优化原则降低噪声，摒除人为干扰因素，显著提高了单细胞数据解读的可靠性。
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公开(公告)号：CN108546761A
公开(公告)日：2018-09-18
申请号：CN201810415762.6
申请日：2018-05-03
Applicant: 上海交通大学医学院附属第九人民医院
IPC: C12Q1/6886
CPC classification number: C12Q1/6886 , C12Q2600/118 , C12Q2600/158
Abstract: 本发明涉及基因检测技术领域，公开了一种用于口腔鳞癌淋巴结转移预测的检测试剂盒，包括7种基因：PDGFRA、PLAU、SOX9、SPP1、CDKN2A、CASP1、MAL的上、下游引物序列。本发明还公开了一种筛选用于口腔鳞癌淋巴结转移预测的基因或基因组合的方法。本发明的检测试剂盒，能客观、准确、灵敏地预测口腔鳞癌淋巴结转移情况，从而有助于提高口腔鳞癌患者生存率。
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公开(公告)号：CN109116279A
公开(公告)日：2019-01-01
申请号：CN201810953635.1
申请日：2018-08-21
Applicant: 上海交通大学
IPC: G01R33/46
Abstract: 本发明公开了一种基于核磁共振谱洛伦兹曲线数学性质的小波去噪方法，涉及解谱分析领域，所述方法包括以下步骤：步骤1、对核磁共振谱数据的实数部分和虚数部分别进行离散小波变换去噪，得到小波去噪后的核磁共振谱实数部分Re和核磁共振谱虚数部分Im；步骤2、使用实数部分和虚数部分之间的数学关系，对小波去噪后的所述核磁共振谱虚数部分Im进行数学计算，得出核磁共振谱的实数部分Re’；步骤3、对Re和Re’求平均，得到最终的去噪结果。本发明提供的小波去噪的方法可以更多地去除MRS信号中的噪声，同时降低了小波去噪过程中对MRS造成的信号损伤，更多的保留了MRS数据中化合物的真实信息。
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