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公开(公告)号：CN111584065A
公开(公告)日：2020-08-25
申请号：CN202010265470.6
申请日：2020-04-07
Applicant: 上海交通大学医学院附属第九人民医院 , 上海交通大学
Abstract: 本申请提供噪声性听力损失预测及易感人群筛选方法、装置、终端和介质，包括：采集噪声暴露人群样本的多种听力特征数据并进行预处理；基于人群样本预处理数据定义高频听阈切迹听力特征数据，构建用于预测个体易感情况的高频听阈切迹面积预测模型；获取待测人群样本中的医学特征数据和听力阈值测量数据；比较所述预测切迹面积值和实际切迹面积值，据以判断待测人群样本的个体易感情况。本发明通过大数据预测和长期的临床经验，辅助判断听力损失情况和筛选易感抵抗个体，达到填补噪声性听力损失早期辅助诊断的空白效果，解决了当前各界对于噪声性听力损失早期诊断没有金标准，帮助患者早期预防，这是防治噪声性听力损失的关键。
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公开(公告)号：CN119274653A
公开(公告)日：2025-01-07
申请号：CN202411152028.7
申请日：2024-08-21
Applicant: 上海交通大学医学院附属仁济医院 , 上海交通大学
Abstract: 本发明提供一种基于血浆游离DNA突变检测的胆囊癌预测方法及设备，包括：基因突变特征提取模块利用基因突变分析算法从样本基因测序数据中提取样本基因突变特征；胆囊占位良恶性鉴别模型建立模块，基于基因突变特征从靶向基因中筛选胆囊癌的关键基因，以得到训练完成的胆囊占位良恶性鉴别模型；检测模块从待检测者的血浆游离DNA中获取待检测者的关键基因的基因突变特征，将待检测者的关键基因的基因突变特征输入所述胆囊占位良恶性鉴别模型，以得到胆囊占位性病变的恶性概率。可以采用非侵入性的方式采集患者外周血提取游离DNA，减少对患者的伤害和痛苦，通过胆囊占位良恶性鉴别模型，可以准确高效的得到一个包含有胆囊癌的预测概率的判断结果。
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公开(公告)号：CN111584065B
公开(公告)日：2023-09-19
申请号：CN202010265470.6
申请日：2020-04-07
Applicant: 上海交通大学医学院附属第九人民医院 , 上海交通大学
Abstract: 本申请提供噪声性听力损失预测及易感人群筛选方法、装置、终端和介质，包括：采集噪声暴露人群样本的多种听力特征数据并进行预处理；基于人群样本预处理数据定义高频听阈切迹听力特征数据，构建用于预测个体易感情况的高频听阈切迹面积预测模型；获取待测人群样本中的医学特征数据和听力阈值测量数据；比较所述预测切迹面积值和实际切迹面积值，据以判断待测人群样本的个体易感情况。本发明通过大数据预测和长期的临床经验，辅助判断听力损失情况和筛选易感抵抗个体，达到填补噪声性听力损失早期辅助诊断的空白效果，解决了当前各界对于噪声性听力损失早期诊断没有金标准，帮助患者早期预防，这是防治噪声性听力损失的关键。
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公开(公告)号：CN114490011B
公开(公告)日：2024-06-18
申请号：CN202011260657.3
申请日：2020-11-12
Applicant: 上海交通大学
IPC: G06F9/50
Abstract: 一种N体模拟在异构架构的并行加速实现方法，通过初始化后更新缓冲区，通过CPU内存与GPU显存之间的信息传输后，依次通过GPU以分桶算法计算粒子之间的短程力并返回结果至CPU端；通过CPU计算粒子之间的长程力及加速度后更新粒子速度，最后更新缓冲区粒子的速度信息并当满足条件时结束模拟；本发明在CPU端进行主体程序的计算和数据读取、输出等功能，在GPU端进行程序中热点函数的计算，通过基于粒子‑网格算法，将粒子之间的力分为短程力和长程力，利用CPU和GPU的算力及其架构特点，实现快速计算。
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公开(公告)号：CN110275733B
公开(公告)日：2022-11-22
申请号：CN201910564493.4
申请日：2019-06-27
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 一种基于有限体积法求解声子玻尔兹曼方程的GPU并行加速方法，通过划分非结构网格，确定边界条件和计算参数并初始化能量密度分布后，从CPU内存向GPU显存传输每个网格单元之间的影响系数；然后计算声子散射项，并使用稳定双共轭梯度法(BiCGSTAB)求解线性方程组，对每个网格单元的能量密度分布进行更新并通过GPU对声子模式温度分布和平衡态分布函数进行更新，最后通过比较每个网格单元的能量密度分布更新前后的变化，并当满足收敛条件时停止计算并输出结果。本发明在GPU上并行计算求解过程中的主要迭代部分，CPU负责整个计算过程的数据读取、数据输出以及计算流程控制，从而显著提高了计算效率。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN110275732A
公开(公告)日：2019-09-24
申请号：CN201910482225.8
申请日：2019-06-04
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 一种在支持ARMv8指令集的处理器上质点网格法的并行实现方法，在完成进程空间与线程空间划分后，加载网格单元内粒子并初始化，完成计算更新粒子及场强数据信息后再将结果数据以文件形式输出，当计算时出现负载不均衡则进行动态负载均衡操作。本发明基于消息传递接口(MPI)与OpenMP并行实现框架，通过线程绑定规避进程内socket间传输数据，使用单指令多数据向量化，降低浮点数精度，采用动态负载均衡等优化方法，基于硬件平台的体系架构，充分利用计算资源，提高质点网格法的计算性能。
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公开(公告)号：CN119861790A
公开(公告)日：2025-04-22
申请号：CN202411920600.X
申请日：2024-12-25
Applicant: 上海交通大学
IPC: G06F1/04
Abstract: 一种通过模拟采样过滤计时波动的方法，通过计算一个模拟区间的模拟测量值，以模拟测量值与真实测量值的误差最小化为目标循环调整该模拟区间的计算，直至完成所有区间的计算，得到实际耗时的分布。本发明通过由内外两层循环结构，利用对被计时程序的原始计时测量结果分布和计时波动采样结果分布，通过模拟采样的方式计算计时误差对原始计时结果的影响，从而从原始计时测量得到的时间分布中，过滤计时波动导致的误差，得到更真实的运行时间分布。
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公开(公告)号：CN115954055A
公开(公告)日：2023-04-11
申请号：CN202211130199.0
申请日：2022-11-02
Applicant: 上海交通大学医学院
Abstract: 本发明公开了基于CRISPR的高通量筛选数据分析可视化操作系统，涉及生物医学技术领域。本发明包括文件输入模块、筛选分析模块和结果输出模块，文件输入模块进行输入文件的特征选择，首先进行文件参数填写，参数填写前确认流程运行项目，文件输入模块包括读取测序文件和读取sgRNA文件，分别对测序文件和sgRNA文件进行测序数据比对，筛选分析模块对比对后的测序数据进行筛选分析，并将分析结果上传至结果输出模块，利用结果输出模块对结果数据进行匹配输出，完成可视化分析操作。本发明基于现有的CRISPR筛选分析流程MAGeCKFlute，开发了一套可视化操作系统，能让分析者仅需通过上传数据和调整关键参数实现分析流程，拿到分析结果。
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公开(公告)号：CN111858243B
公开(公告)日：2024-03-19
申请号：CN202010678027.1
申请日：2020-07-15
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 一种基于指数增长的多硬件事件监控计数值估计方法，分别通过主线程维护工作流程的生命周期、创建和初始化相关数据结构和从线程，发送从线程控制信号以及运行被监控应用，通过从线程响应主线程的生命周期信号、进行硬件事件调度、定时轮流监控和后处理估计，通过读取CPU内置的硬件事件计数寄存器得到多硬件事件监控计数值。本发明通过指数增长估计算法填充非监控时间片上的硬件事件计数值，能够提升基于MPX技术的多硬件事件监控计数库的准确性，增强MPX下监控结果的可用性。
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公开(公告)号：CN115794557A
公开(公告)日：2023-03-14
申请号：CN202211585373.0
申请日：2022-12-10
Applicant: 上海交通大学
IPC: G06F11/30 , G06F18/214 , G06F11/34
Abstract: 一种硬件计数器复用估计实现方法，在离线阶段构建训练集并训练Transformer模型，并在在线阶段对性能监控软件的硬件计数器采集到的估计数据进行拟合，从而提升硬件计数器复用的精度。所述的训练集，通过运行选取的应用，同时使用性能监控软件的硬件计数器复用模式以及硬件事件模式监控选取的硬件事件集合中的事件，记录获得的硬件计数器的值后得到，后经过依次进行的异常数据筛选、一阶差分处理、对数化处理和乱序排列处理。本发明利用Transformer模型时序分析能力，对硬件计数器采集到的估计数据做数据拟合，从而显著提升硬件计数器复用的精度、提高性能监控(如VTune,PAPI)的准确性。
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