公开(公告)号：CN115954055A

公开(公告)日：2023-04-11

申请号：CN202211130199.0

申请日：2022-11-02

Applicant: 上海交通大学医学院

Inventor： 钟清 ,  林新华 ,  付婉 ,  李琛 ,  王一超 ,  张仪方

IPC: G16B35/20 ,  G16B40/00 ,  G16B45/00 ,  G16B25/10

Abstract: 本发明公开了基于CRISPR的高通量筛选数据分析可视化操作系统，涉及生物医学技术领域。本发明包括文件输入模块、筛选分析模块和结果输出模块，文件输入模块进行输入文件的特征选择，首先进行文件参数填写，参数填写前确认流程运行项目，文件输入模块包括读取测序文件和读取sgRNA文件，分别对测序文件和sgRNA文件进行测序数据比对，筛选分析模块对比对后的测序数据进行筛选分析，并将分析结果上传至结果输出模块，利用结果输出模块对结果数据进行匹配输出，完成可视化分析操作。本发明基于现有的CRISPR筛选分析流程MAGeCKFlute，开发了一套可视化操作系统，能让分析者仅需通过上传数据和调整关键参数实现分析流程，拿到分析结果。