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公开(公告)号：CN118755781A
公开(公告)日：2024-10-11
申请号：CN202411158373.1
申请日：2024-08-22
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12P19/34
Abstract: 本发明公开了一种基于通用碱基的新型DNA酶促从头合成方法。本发明提供了一种人工DNA从头合成的方法，包括：制备生物素修饰的由通用碱基序列和特定碱基序列组成的DNA模板和互补引物；所述互补引物与所述特定碱基序列反向互补；将生物素修饰的DNA模板和链霉亲和素磁珠结合；将互补引物退火到DNA模板上，作为引发链；利用能识别通用碱基为模板的DNA聚合酶进行DNA酶促合成反应；期间，使用经修饰的dNTP进行可逆终止反应，控制合成的DNA序列；反应完成后，将酶促合成产物从DNA模板上剥离下来；检测。本发明所提供的人工DNA从头合成的方法是使用有模板聚合酶的酶促合成方法，可以极大的增加合成效率和降低合成成本。
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公开(公告)号：CN115274136A
公开(公告)日：2022-11-01
申请号：CN202211032553.6
申请日：2022-08-26
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明公开了一种整合多组学与必需基因信息的肿瘤细胞系药物响应预测方法，涉及肿瘤药物响应预测领域，该预测方法为DROEG预测方法(Drug Response basedon Omics and Essential Genes)，通过纳入基因表达数据、拷贝数变异数据、甲基化数据、体细胞突变数据四种组学数据，以及CRISPR基因效应数据(CERES Score)构建药物响应模型，并通过定性评价方法和定量评价方法全面评价模型的效果。本发明引入CRISPR必需基因信息，建立药物响应预测模型，比现有方法更加准确；同时具备定量与定性预测评估的功能，适用性更广，操作更灵活。
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公开(公告)号：CN104983733B
公开(公告)日：2019-01-08
申请号：CN201510385948.8
申请日：2015-06-30
Applicant: 上海交通大学
IPC: A61K31/4422 , A61P35/00
Abstract: 本发明公开了Nicardipine在制备抗肺癌产品中的应用。本发明提供了Nicardipine在制备治疗非小细胞肺癌产品中的应用。本发明的实验证明，本发明对FDA,CFDA已获批准的药物Nicardipine进行肿瘤药物重定位，根据肿瘤不同的细胞系(组织类型)以及突变位点对适应症不是抗肿瘤的药物进行筛选，发现Nicardipine抗小细胞肺癌和/或非小细胞肺癌这种新用途，实现旧药新用。
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公开(公告)号：CN107604046A
公开(公告)日：2018-01-19
申请号：CN201711073031.X
申请日：2017-11-03
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12Q1/6827 , C12Q1/6869 , C40B40/06 , C40B50/06 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了用于微量DNA超低频突变检测的双分子自校验文库制备及杂交捕获的二代测序方法。该方法包括如下步骤：血浆游离DNA提取，DNA化学错误修复，自校验双分子识别码发夹型接头制备，血浆游离DNA修复，DNA与接头连接，Pre-PCR扩增，超量杂交捕获，Post-PCR扩增，上机测序，数据纠错校正，突变分析与注释。本发明的方法可以高效实现血浆循环游离DNA的低频突变检测。DNA错误修复和双重冗余校验技术使得该方法在检测微量样本时具有超低的假阳性率和高灵敏度，避免了现有血浆循环游离DNA检测方法的缺陷，不仅可以实现癌症突变检测和靶向用药指导，也可实现胎儿遗传和出生缺陷早期筛查。
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公开(公告)号：CN105506116A
公开(公告)日：2016-04-20
申请号：CN201610005084.7
申请日：2016-01-05
Applicant: 上海交通大学 , 复旦大学附属华山医院
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/6886 , C12Q2600/156
Abstract: 本发明公开了一种BRAF基因检测物在制备ACTH型垂体腺瘤分子病理诊断及分型产品中的应用。实验证明：BRAF基因突变为ACTH型垂体腺瘤所特有，其他类型的垂体腺瘤中未见该基因突变，可作为ACTH型垂体腺瘤一个特异性的分子病理诊断标记物。根据BRAF基因是否突变可进一步将ACTH垂体腺瘤分为两种亚型，即BRAF突变型和野生型，前者平均体积偏小，侵袭度小，午夜血清皮质醇浓度小于或等于22ug/dl；后组平均体积偏大，侵袭度大，午夜血清皮质醇浓度大于22ug/dl。因此可以通过检测BRAF基因是否突变判断ACTH垂体腺瘤的不同亚型，从而及时采取不同的临床治疗策略。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN104983736A
公开(公告)日：2015-10-21
申请号：CN201510385949.2
申请日：2015-06-30
Applicant: 上海交通大学
IPC: A61K31/567 , A61P35/00 , A61P15/00
Abstract: 本发明公开了Levonorgestrel在制备抗卵巢癌产品中的应用。本发明提供了Levonorgestrel在制备治疗卵巢癌产品中的应用。本发明的实验证明，本发明对FDA,CFDA已获批准的药物Levonorgestrel进行肿瘤药物重定位，根据肿瘤不同的细胞系(组织类型)以及突变位点对适应症不是抗肿瘤的药物进行筛选，发现Levonorgestrel抗卵巢癌这种新用途，实现旧药新用。
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公开(公告)号：CN104411824A
公开(公告)日：2015-03-11
申请号：CN201280074086.1
申请日：2012-06-18
Applicant: 山东大学 , 山东山大附属生殖医院有限公司 , 上海交通大学
CPC classification number: C12Q1/6883 , C12Q2600/156 , C12Q2600/16
Abstract: 本发明提供与PCOS相关的SNP标记、用于检测所述SNP标记的探针、芯片、引物、试剂盒和方法。另外，本发明还提供所述探针、芯片和引物在预测和诊断PCOS风险中的应用。
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公开(公告)号：CN102918158A
公开(公告)日：2013-02-06
申请号：CN201080067164.6
申请日：2010-05-31
Applicant: 山东大学 , 山东山大附属生殖医院有限公司 , 上海交通大学
CPC classification number: C12Q1/6886 , C12Q1/6883 , C12Q2600/156 , C12Q2600/172
Abstract: 本发明提供了与多囊卵巢综合征（PCOS）相关的SNP，这些SNP在数以千计的中国PCOS病例中被发现。本发明还提供了具有所述SNP的探针和包括一个或多个这些探针的芯片。所述探针和芯片可以用于筛选、预测或诊断PCOS。
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公开(公告)号：CN102191329A
公开(公告)日：2011-09-21
申请号：CN201110109934.5
申请日：2011-04-29
Applicant: 上海交通大学 , 上海佰真生物科技有限公司
IPC: C12Q1/68
Abstract: 一种分子生物技术领域的检测重度抑郁关联基因的试剂盒及其制备方法。试剂盒PCR试剂组和LDR试剂组，其中：PCR试剂组包括：缓冲液，dNTP混合液，Taq DNA聚合酶，纯水，四对PCR专用扩增引物；LDR试剂组包括：缓冲液，dNTP混合液，Taq DNA连接酶，纯水，四组LDR专用探针。制备方法包括：PCR引物的设计及合成：PCR引物采用引物设计软件PRIMER3进行引物设计，TM值选择60度左右；LDR探针的设计及合成：LDR探针每个位点包括三条，两条5’端探针和一条3’端探针；Taq DNA聚合酶和Taq DNA连接酶采用TAKARA的产品或New England Biolabs的产品。本发明可以实现对重度抑郁关联基因内特定SNP位点的快速、高效、准确的分型。
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公开(公告)号：CN1706968A
公开(公告)日：2005-12-14
申请号：CN200510026203.9
申请日：2005-05-26
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 检测单核苷酸多态性的方法。包括：收集待测者的静脉血液样品，提取DNA；取250ng基因组DNA分别酶切；酶切后DNA联结酶联结；连接产物分成3孔，每孔PCR反应体系总体积为100ul；PCR反应产物经纯化，与基因芯片杂交；杂交后的芯片经洗涤、染色，用扫描仪和分析软件检测单核苷酸位点是否存在多态性。本发明利用分子标记检测单核苷酸多态性的方法，而不依赖于医生对诊断对象的主观判断。由于血液具有取材方便，无创伤性，并可连续检测的优点，因此本发明使诊断具有极大的临床应用的可能。本发明同时可用于评价治疗精神分裂症药物的疗效，指导药物开发。
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