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公开(公告)号:CN101985659A
公开(公告)日:2011-03-16
申请号:CN201010543122.7
申请日:2010-11-13
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 一种分子生物技术领域的检测精神分裂关联基因的试剂盒及其制备方法。试剂盒PCR试剂组和LDR试剂组,其中:PCR试剂组包括:缓冲液,dNTP混合液,Taq DNA聚合酶,纯水,四对PCR专用扩增引物;LDR试剂组包括:缓冲液,dNTP混合液,Taq DNA连接酶,纯水,四组LDR专用探针。制备方法包括:PCR引物的设计及合成:PCR引物采用引物设计软件PRIMER3进行引物设计,TM值选择60度左右;LDR探针的设计及合成:LDR探针每个位点包括三条,两条5’端探针和一条3’端探针;Taq DNA聚合酶和Taq DNA连接酶采用TAKARA的产品或New England Biolabs的产品。本发明可以实现对精神分裂关联基因内特定SNP位点的快速、高效、准确的分型。
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公开(公告)号:CN1182245C
公开(公告)日:2004-12-29
申请号:CN01126148.X
申请日:2001-07-13
Applicant: 上海交通大学 , 中国科学院上海生命科学研究院
Abstract: 一种短指和身高相关基因,属于生物技术的基因领域。其核酸序列如SEQ IDNO.3所示。它具有SEQ ID NO.4所示的氨基酸序列。本发明为A-1型短指发病和身高发育的分子遗传的相互关系提供了基因关系的依据,本发明将有力地推动人类骨骼发育异常病理机制研究的进一步发展,加深了人类在分子水平上对骨骼发育的认识,并为今后相应的基因诊断、药物设计和临床治疗提供了基因学的根据。
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公开(公告)号:CN1966720A
公开(公告)日:2007-05-23
申请号:CN200610116310.5
申请日:2006-09-21
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明涉及的是基因技术领域的一种CYP3A4基因第一号外显子的单核苷酸多态性的检测方法,同时涉及一种分离核酸、一种等位基因特异性的核酸引物。它包括步骤:(a)确定在人CYP3A4基因第一号外显子的SEQ ID NO:1所示序列的第27位的核苷酸;(b)检测在所述位置是否存在单核苷酸多态性;一种分离核酸,具有SEQ ID NO:1所示的序列,且第27位为A;一种等位基因特异性的核酸引物,其长度为15-50bp,且特异性地杂交并扩增出含人CYP3A4基因第一号外显子的SEQ ID NO:1所示序列的第27位的单核苷酸多态性的扩增产物。本发明为研究我国人群中CYP3A4基因多态性与临床用药安全的关系奠定了基础,为临床用药个体化提供理论基础,同时也为基于药物基因组学理念的新药研发提供指导依据。
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公开(公告)号:CN1706968A
公开(公告)日:2005-12-14
申请号:CN200510026203.9
申请日:2005-05-26
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 检测单核苷酸多态性的方法。包括:收集待测者的静脉血液样品,提取DNA;取250ng基因组DNA分别酶切;酶切后DNA联结酶联结;连接产物分成3孔,每孔PCR反应体系总体积为100ul;PCR反应产物经纯化,与基因芯片杂交;杂交后的芯片经洗涤、染色,用扫描仪和分析软件检测单核苷酸位点是否存在多态性。本发明利用分子标记检测单核苷酸多态性的方法,而不依赖于医生对诊断对象的主观判断。由于血液具有取材方便,无创伤性,并可连续检测的优点,因此本发明使诊断具有极大的临床应用的可能。本发明同时可用于评价治疗精神分裂症药物的疗效,指导药物开发。
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公开(公告)号:CN1683559A
公开(公告)日:2005-10-19
申请号:CN200510024103.2
申请日:2005-02-28
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种与精神分裂症相关的基因TTR及其新发现的多态性位点,以及在检测精神分裂症方面的用途。本发明还提供了一种检测TTR基因的单核苷酸多态性的方法,并用上述方法在TTR基因的SEQ ID NO:1所示序列的第293位,SEQ ID NO:2所示序列的第224位、第265位、第322位和第352位检测到了四个新的单核苷酸多态性位点和一个9核苷酸缺失的位点。其中,位于第二号外显子293位的SNP1T→A的突变会造成氨基酸序列由谷氨酸到缬氨酸的改变,引起蛋白结构和功能的变化,等位位点A,即在其DNA互补链上为T等位位点,是产生精神分裂症的一个危险等位位点,其可应用于精神分裂症的诊断。
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公开(公告)号:CN1300588C
公开(公告)日:2007-02-14
申请号:CN200510024102.8
申请日:2005-02-28
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明提供一种用于精神分裂症诊断的血浆特异性蛋白获取方法及应用,利用双向凝胶电泳的方法分离待测个体血浆蛋白质,从双向凝胶电泳图谱上得到α珠蛋白、α1抗胰蛋白酶、α1巨球蛋白、血清淀粉样蛋白P组份、抗纤维蛋白酶Ⅲ和维生素D结合蛋白的表达量,并将此六个特异性蛋白的表达量作为判断被测个体是否患精神分裂症的参考依据。本发明利用分子标记客观地诊断精神分裂症,而不依赖于医生对诊断对象的主观判断。由于血浆具有取材方便,无创伤性,并可连续检测的优点,因此本发明使诊断具有极大的临床应用的可能。本发明同时可用于评价治疗精神分裂症药物的疗效,指导药物开发。
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公开(公告)号:CN1737140A
公开(公告)日:2006-02-22
申请号:CN200510026204.3
申请日:2005-05-26
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明涉及一组生物技术的精神分裂症相关核酸序列。包括:它具有SEQ ID NO:1-12所示的序列,单核苷酸多态性是在第26为存在G,在其DNA互补链上为A等位位点;单核苷酸多态性是在第26为存在C,在其DNA互补链上为T等位位点。本发明所提供的一组12种核酸序列可用于分析人类基因组上述单核苷酸多态性位点,将大大提高对精神分裂症的诊断和对个体是否具有精神分裂症易感性进行评判。同时上述核酸序列等位位点还可以作为药物设计靶点来进行药物的筛选,构建对精神分裂症进行遗传学诊断的试剂盒。
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公开(公告)号:CN1654957A
公开(公告)日:2005-08-17
申请号:CN200510024102.8
申请日:2005-02-28
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明提供一种用于精神分裂症诊断的血浆特异性蛋白获取方法及应用,利用双向凝胶电泳的方法分离待测个体血浆蛋白质,从双向凝胶电泳图谱上得到α珠蛋白、α1抗胰蛋白酶、α1巨球蛋白、血清淀粉样蛋白P组份、抗纤维蛋白酶III和维生素D结合蛋白的表达量,并将此六个特异性蛋白的表达量作为判断被测个体是否患精神分裂症的参考依据。本发明利用分子标记客观地诊断精神分裂症,而不依赖于医生对诊断对象的主观判断。由于血浆具有取材方便,无创伤性,并可连续检测的优点,因此本发明使诊断具有极大的临床应用的可能。本发明同时可用于评价治疗精神分裂症药物的疗效,指导药物开发。
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公开(公告)号:CN1557827A
公开(公告)日:2004-12-29
申请号:CN03141984.4
申请日:2003-07-31
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 一种与精神分裂症相关的基因及其多态性位点及其应用,属于生物基因领域。本发明具有SEQ ID No.1所示的核酸序列和具有SEQ ID No.2所示的核酸序列。位于6q25.3-26区域T-复合物蛋白-1基因上的常见型单核苷酸多态性位点rs15982的C等位位点,即在其DNA互补链上为G等位位点,是产生精神分裂症的一个危险等位位点。位于6q25.3-26区域的T-复合物蛋白-1基因单核苷酸多态性位点rs15982的C等位位点,即在其DNA互补链上为G等位位点,前后2000bp区域内的多态性位点及其所组合的各类单倍体型进行诊断、治疗、药物靶点和一切商业性的开发利用。本发明揭示了T-复合物蛋白-1基因与精神分裂症相关性,找到了T-复合物蛋白-1(其编码基因位于6q25.3-26)的浓度在精神分裂症患者大脑中出现升高的分子基础。
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公开(公告)号:CN100365118C
公开(公告)日:2008-01-30
申请号:CN200510026204.3
申请日:2005-05-26
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明涉及一组生物技术的精神分裂症相关核酸序列。包括:它具有SEQ IDNO:1-12所示的序列,单核苷酸多态性是在第26为存在G,在其DNA互补链上为A等位位点;单核苷酸多态性是在第26为存在C,在其DNA互补链上为T等位位点。本发明所提供的一组12种核酸序列可用于分析人类基因组上述单核苷酸多态性位点,将大大提高对精神分裂症的诊断和对个体是否具有精神分裂症易感性进行评判。同时上述核酸序列等位位点还可以作为药物设计靶点来进行药物的筛选,构建对精神分裂症进行遗传学诊断的试剂盒。
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