公开(公告)号：CN101875977B

公开(公告)日：2012-05-23

申请号：CN201010235173.3

申请日：2010-07-23

Applicant: 西北农林科技大学

Inventor： 陈宏 ,  黄永震 ,  淮永涛 ,  张宝 ,  李转见 ,  蓝贤勇 ,  胡沈荣 ,  雷初朝

IPC: C12Q1/68

Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛SREBP1c基因单核苷酸多态性的方法，以包含SREBP1c基因的待测黄牛全基因组DNA为模板，以引物对P为引物，PCR扩增黄牛SREBP1c基因；用限制性内切酶Bgl I消化PCR扩增产物之后，再对酶切后的扩增片段进行琼脂糖凝胶电泳；根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定黄牛SREBP1c基因第10914位的单核苷酸多态性。由于SREBP1c基因功能涉及体重、日增重、体斜长和胸围4个重要的生长性状，本发明提供的检测方法为SREBP1c基因的SNP与生长性状关系的建立奠定了基础，以便用于中国黄牛肉用生长性状的标记辅助选择(MAS)，快速建立遗传资源优良的黄牛种群。

公开(公告)号：CN112813175B

公开(公告)日：2023-07-07

申请号：CN202110342428.4

申请日：2021-03-30

Applicant: 西北农林科技大学

Inventor： 黄永震 ,  丁晓婷 ,  贺花 ,  李欣淼 ,  柴亚楠 ,  刘贤 ,  李克丽 ,  杜雪儿 ,  郑中华 ,  乔小玉 ,  郎利敏 ,  张子敬 ,  施巧婷 ,  王二耀 ,  茹宝瑞 ,  胡沈荣 ,  王建钦 ,  雷初朝 ,  陈宏

IPC: C12Q1/6888 ,  C12Q1/6851

Abstract: 本发明公开了一种黄牛CHRDL1基因CNV标记快速辅助检测生长性状的方法及其应用：以牛血液全基因组DNA为模板，通过实时荧光定量PCR技术，用两对引物P1、P2分别对牛CHRDL1基因CNV区域、内参基因BTF3的一段区域进行扩增，根据2*2‑ΔΔCt确定个体CHRDL1基因的拷贝数变异类型为多拷贝型、缺失型或正常型。根据CHRDL1基因拷贝数变异与生长性状的关联分析结果，本发明可以在DNA水平上检测与牛生长性状密切相关的CNV标记，可用于牛生长性状的标记辅助选择，加速良种选育进程。

公开(公告)号：CN113481303B

公开(公告)日：2023-05-26

申请号：CN202110892448.9

申请日：2021-08-04

Applicant: 西北农林科技大学

Inventor： 黄永震 ,  何瑞莹 ,  李欣淼 ,  杨鹏 ,  贺花 ,  王红利 ,  张会侠 ,  鲁沛佳 ,  陈俊岭 ,  杨国杰 ,  侯兵 ,  张子敬 ,  王二耀 ,  雷初朝

IPC: C12Q1/6888 ,  C12Q1/6851

Abstract: 本发明公开了一种黄牛ACTR3基因CNV标记辅助检测生长性状的方法及其应用。基于实时荧光定量PCR技术，以黄牛个体基因组DNA为模板，以一对特异性引物扩增ACTR3基因拷贝数变异区域的部分片段，以另外一对特异性引物扩增BTF3基因的部分片段作为内参，最后利用‑ΔΔCt判定个体的拷贝数变异类型。本发明提供的方法基于ACTR3基因拷贝数变异与生长性状之间的关联，可用于快速建立黄牛遗传资源优势种群，有利于加快牛分子标记辅助选择育种工作，该方法简单、快速，便于推广应用。

公开(公告)号：CN113444811B

公开(公告)日：2023-05-26

申请号：CN202110893489.X

申请日：2021-08-04

Applicant: 西北农林科技大学

Inventor： 黄永震 ,  沙克拉 ,  王献伟 ,  辛晓玲 ,  丁晓婷 ,  贺花 ,  胡沈荣 ,  张子敬 ,  刘贤 ,  李志明 ,  李文献 ,  徐泽君

IPC: C12Q1/6888 ,  C12Q1/6858 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明公开了一种基于山羊GPR157基因CNV标记评估生长性状的分子诊断方法及其应用。基于实时荧光定量PCR技术，以山羊个体基因组DNA为模板，以一对特异性引物扩增GPR157基因拷贝数变异区域的部分片段，以另外一对特异性引物扩增MC1R基因的部分片段作为内参，利用2*2‑ΔΔCt判定个体的拷贝数变异类型。本发明提供的方法基于GPR157基因拷贝数变异与生长性状之间的关联，可用于快速建立山羊遗传资源优势种群，有利于加快山羊分子标记辅助选择育种工作，该方法简单、快速，便于推广应用。

公开(公告)号：CN116024354A

公开(公告)日：2023-04-28

申请号：CN202211154046.X

申请日：2022-09-21

Applicant: 西北农林科技大学 ,  河南农业大学 ,  泌阳县现代农业产业园服务中心

Inventor： 陈宏 ,  蔡含芳 ,  李静 ,  许会芬 ,  黄永震 ,  雷初朝 ,  李明

IPC: C12Q1/6888 ,  C12Q1/6858 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明涉及一种与黄牛生长性状相关的SNP分子标记、检测引物、试剂盒及育种方法。本发明的SNP分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，5’端起第96位碱基为T或G。该SNP位点能够作为黄牛品种遗传改良的分子标记，采用该分子标记对黄牛进行选育，有利于提高黄牛群体的体高性状，可应用于中国黄牛生长性状的标记辅助选择育种中，有利于性状优良的黄牛种群的遗传改良。本发明提供了检测FGF13基因SNP分子标记的引物、试剂盒，同时提供了基于FGF13基因SNP分子标记的黄牛生长性状改良育种方法，有利于缩短育种时间，加快育种进程。

公开(公告)号：CN110564829B

公开(公告)日：2022-11-04

申请号：CN201910943149.6

申请日：2019-09-30

Applicant: 西北农林科技大学

Inventor： 黄永震 ,  贺花 ,  丁晓婷 ,  施巧婷 ,  文逸凡 ,  胡瑞芳 ,  张子敬 ,  王大会 ,  吕世杰 ,  蔡翠翠 ,  王献伟 ,  雷初朝 ,  王二耀 ,  陈宏

IPC: C12Q1/6858 ,  C12Q1/6888

Abstract: 本发明公开了一种奶牛NCAM2基因CNV标记辅助检测泌乳性状的方法及其专用试剂盒：利用实时定量PCR技术，以中国荷斯坦奶牛基因组DNA为模板，分别用两对引物P1、P2对牛NCAM2基因的CNV标记位点和内参基因BTF3的一段区域进行扩增，最后利用2*2‑ΔΔCt的方法计算并判定个体的拷贝数变异类型，并将结果分为多拷贝型、缺失型和正常型。本发明可在DNA水平上检测与中国荷斯坦奶牛泌乳性状密切相关的CNV标记，可加快奶牛优良产乳性能的选育进程。该方法简单、快速，便于推广应用。

公开(公告)号：CN110144412B

公开(公告)日：2022-08-19

申请号：CN201910497680.5

申请日：2019-06-10

Applicant: 西北农林科技大学

Inventor： 陈宏 ,  程杰 ,  曹修凯 ,  黄永震 ,  蓝贤勇

IPC: C12Q1/6888 ,  C12Q1/6858 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明公开了一种与南阳牛生长相关的CNV标记的检测方法及其应用：所述的CNV标记是指南阳牛SSTR2基因的拷贝数变异，该检测方法是以南阳牛基因组DNA为模板，通过实时荧光定量PCR分别扩增南阳牛SSTR2基因CNV区域和内参基因RPP30部分片段，根据2‑ΔΔCt将定量结果分为增加型、减少型和正常型，从而鉴定南阳牛SSTR2基因的拷贝数变异类型。本发明在DNA水平上检测与南阳牛生长性状密切相关的SSTR2基因的拷贝数变异，以便快速建立遗传资源优良的南阳牛种群。

公开(公告)号：CN111321232B

公开(公告)日：2022-08-16

申请号：CN202010192466.1

申请日：2020-03-18

Applicant: 西北农林科技大学

Inventor： 黄永震 ,  彭梦阳 ,  蔡翠翠 ,  梁君桐 ,  亐开兴 ,  刘贤 ,  张子敬 ,  施巧婷 ,  茹宝瑞 ,  黄必志 ,  雷初朝 ,  胡沈荣 ,  陈宏

IPC: C12Q1/6888 ,  C12Q1/6851

Abstract: 本发明公开了一种快速检测肉牛EIF4A2基因拷贝数变异的方法及其应用：基于实时定量PCR，以云岭牛基因组DNA为模板，利用一对引物扩增地方肉牛(例如，云岭牛)EIF4A2基因的拷贝数变异区域部分片段，同时利用另外一对引物扩增牛通用转录因子3基因部分片段作为内参，对定量结果进行计算，判定个体的拷贝数变异类型。本发明提供的方法建立在肉牛EIF4A2基因拷贝数变异与生长性状之间的关联基础之上，有利于加快肉牛分子标记辅助选择育种工作，该方法简单、快速，便于推广应用。

公开(公告)号：CN112359120B

公开(公告)日：2022-07-05

申请号：CN202011296046.4

申请日：2020-11-18

Applicant: 西北农林科技大学

Inventor： 雷初朝 ,  黄永震 ,  李佳霄 ,  徐嘉威 ,  亐开兴 ,  张继才 ,  黄必志 ,  陈宁博 ,  贺花 ,  文逸凡 ,  杨鹏 ,  姚治

IPC: C12Q1/6888 ,  C12Q1/6851 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛MFN1基因CNV标记的方法及其应用：以云岭牛的血样基因组DNA为模板，通过实时荧光定量PCR分别扩增MFN1基因CNV区域和参考基因BTF3的部分片段，根据2*log22‑ΔΔCt将定量结果分为插入型、缺失型和正常型，从而鉴定云岭牛MFN1基因的拷贝数变异类型。与云岭牛生长数据的关联分析显示，MFN1基因不同拷贝数对个体生长发育有显著影响，其中缺失型个体的胸宽低于插入型个体。本发明在DNA水平上检测与牛生长性状密切相关的CNV标记，可作为生长性状的标记辅助选择的重要候选分子标记，快速建立遗传资源优良的肉牛种群。

公开(公告)号：CN110172516B

公开(公告)日：2022-05-17

申请号：CN201910218571.5

申请日：2019-03-21

Applicant: 西北农林科技大学

Inventor： 张思欢 ,  蓝贤勇 ,  杜书增 ,  潘传英 ,  黄永震 ,  党瑞华 ,  雷初朝 ,  陈宏

IPC: C12Q1/6888 ,  C12Q1/6869

Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛lncFAM200B基因5'侧翼区单核苷酸多态性的方法及其应用，以中国地方黄牛全基因组DNA为模板，PCR扩增黄牛lncFAM200B基因5'侧翼区序列，再对PCR扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳和DNA测序；根据测序结果鉴定黄牛lncFAM200B基因5'侧翼区的2个单核苷酸变异；关联分析发现lncFAM200B基因5'侧翼区的这2个单核苷酸位点对生长性状具有重要调控，可作为分子标记。本发明提供的检测方法为建立lncFAM200B基因SNP与生长性状关系提供简单、快速的途径，检测结果可用于生长性状的标记辅助选择，加快建立遗传资源优良的黄牛种群。