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公开(公告)号:CN114032331A
公开(公告)日:2022-02-11
申请号:CN202111517635.5
申请日:2021-12-13
Applicant: 南京林业大学
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6844 , C12N15/11 , C12R1/77
Abstract: 本发明公开了一种层出镰孢菌(Fusarium proliferatum)的检测新靶标FPRO_09882及其检测引物、检测试剂盒和检测方法,该检测靶标FPRO_09882的蛋白序列如SEQ ID NO:1所示,编码该蛋白的DNA序列如SEQ ID NO:2所示。同时,本发明还公开了特异性检测靶标FPRO_09882的RPA检测技术的特异性引物及探针组合,其正向引物序列如SEQ ID NO:3所示,反向引物序列如SEQ ID NO:4所示,探针序列如SEQ ID NO:5所示。本发明发现了层出镰孢菌新的检测靶标,为层出镰孢菌的检测提供了新的检测途径,同时基于该靶标开发的RPA‑LFD检测引物和探针,能够实现层出镰孢菌的特异性检测,灵敏度高。
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公开(公告)号:CN111118038A
公开(公告)日:2020-05-08
申请号:CN202010041623.9
申请日:2020-01-15
Applicant: 南京林业大学
IPC: C12N15/31 , C07K14/37 , C12Q1/6895 , C12Q1/6844 , C12Q1/04 , C12N15/11 , C12R1/645
Abstract: 本发明公开了一种冬生疫霉的检测新靶标Phibe_s00003g00002.1及其专用检测引物和检测方法,该检测靶标Phibe_s00003g00002.1的DNA序列如SEQ ID NO:1所示,蛋白序列如SEQ ID NO:2所示。同时,公开了特异性检测靶标Phibe_s00003g00002.1的RPA检测技术的特异性引物及探针组合,其正向引物序列如SEQ ID NO:3所示,反向引物序列如SEQ ID NO:4所示,探针序列如SEQ ID NO:5所示。本发明发现了新的检测靶标,且基于该靶标的快速检测方法准确性高、特异性强、操作方便、实用性好、实现了恒温扩增,同时本发明设计的引物及探针组合用于RPA-LFD检测技术,其特异性强,灵敏度高,为冬生疫霉(Phytophthora hibernalis)的检测提供了新的技术平台。
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公开(公告)号:CN109825628B
公开(公告)日:2019-10-18
申请号:CN201910241240.3
申请日:2019-03-28
Applicant: 南京林业大学
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6844 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种基于RPA‑侧流层析技术检测茄腐镰孢菌的引物及探针组合及其应用。所述应用具体为:1)提取待测样本DNA;2)以DNA为模板,进行RPA扩增;3)应用侧流层析试纸条进行扩增产物检测;当试纸条出现两条棕色条带,一条位于质控区内,一条位于检测区,则结果为阳性,表明样本中含有茄腐镰孢菌;当试纸条只有质控区出现一条棕色条带,检测区没有条带,则结果是阴性,表明样本中不含有茄腐镰孢菌。本发明所使用的引物及探针组RPA扩增效果好,条带特异性强,与其他病菌无交叉反应,在质控区有阳性对照,增加了检测的灵敏性,为茄腐镰孢菌的检测提供了新的技术平台,同时在病害侵染初期鉴定出病原物,能够对苗圃地或者发病植株中的茄腐镰孢菌进行检测。
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公开(公告)号:CN109439792B
公开(公告)日:2019-08-20
申请号:CN201811547749.2
申请日:2018-12-17
Applicant: 南京林业大学
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6844 , C12Q1/04 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种樟疫霉菌的检测靶标Pcin100006及其专用检测引物和快速检测方法,该检测靶标Pcinn100006的DNA序列如SEQ ID NO.1所示。专用检测引物由正向内引物FIP、反向内引物BIP、正向外引物F3、反向外引物B3、正向环引物LF和反向环引物LB组成。本发明的检测方法准确性高、特异性强、操作方便、实用性好、实现了恒温扩增,同时还为樟疫霉菌的检测提供了新的技术平台,可用于樟疫霉菌的高灵敏度快速检测,同时在病害侵染初期鉴定出病原物,能够对田间土壤中的樟疫霉菌进行检测。本发明对樟疫霉菌引起的疫病防治和对减少农药盲目使用,降低生产成本,减少农药的环境污染也具有重要意义。
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公开(公告)号:CN110066885A
公开(公告)日:2019-07-30
申请号:CN201910361142.3
申请日:2019-04-30
Applicant: 南京林业大学
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6844 , C12Q1/04 , C12N15/11 , C12R1/645
Abstract: 本发明公开了一种基于重组酶介导等温扩增-侧流层析技术(RPA-LFD)检测栗黑水疫霉(Phytophthora cambivora)的引物及探针组合及其应用。采用所述引物及探针组合检测栗黑水疫霉(P.cambivora)的具体方法为:1)提取待测样本DNA;2)以DNA为模板,进行RPA扩增;3)应用侧流层析试纸条进行扩增产物检测。本发明所使用的引物及探针组RPA扩增效果好,条带特异性强,与其他病菌无交叉反应,在质控区有阳性对照,增加了检测的灵敏性,为栗黑水疫霉(P.cambivora)的检测提供了新的技术平台,同时适用于栗黑水疫霉病菌寄主苗木、插枝等植物材料及其土壤和介质中的栗黑水疫霉(P.cambivora)进行检测。
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公开(公告)号:CN109988864A
公开(公告)日:2019-07-09
申请号:CN201910410222.3
申请日:2019-05-15
Applicant: 南京林业大学
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6844 , C12Q1/04 , C12N15/11 , C12R1/645
Abstract: 本发明公开了一种RPA‑LFD技术检测雪松疫霉的引物和探针组合及其应用方法。采用所述引物及探针组合检测雪松疫霉的具体方法为:1)提取待测样本DNA;2)以DNA为模板,进行RPA扩增;3)应用LFD进行扩增产物检测;当试纸条出现两条棕色条带,一条位于质控区内,一条位于检测区,则结果为阳性,表明样本中含有雪松疫霉;当试纸条只有质控区出现一条棕色条带,检测区没有条带,则结果是阴性,表明样本中不含有雪松疫霉。本发明所提供的引物及探针组合RPA扩增效果好,条带特异性强、灵敏度高,为雪松疫霉的检测提供了新的技术手段。
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公开(公告)号:CN109988860A
公开(公告)日:2019-07-09
申请号:CN201910194831.X
申请日:2019-03-14
Applicant: 南京林业大学
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6844 , C12Q1/04 , C12N15/11 , C12R1/645
Abstract: 本发明公开了一种用于检测冬生疫霉的引物及探针组合物及其试剂盒和检测方法,该引物和探针序列为:RPA‑PSYPT‑F:5'‑TTCCACCCTTCCACCAGACTGCTGAGGAGG‑3',RPA‑PSYPT‑R:5’‑[Biotin]TGTTAGCTGCGTGTTCGTTGGTCACCCCAGA‑3’,SYPT‑P:5’‑[FAM]CTTCTGTGATTTATCCAGAAAATCCGTACGAT‑THE‑GAGCTGGACGGCAAGA[C3‑spacer]‑3’。本发明所使用的引物探针组RPA扩增效果好,条带特异性强,与其他病菌无交叉反应,在检测区的有阳性反应,增加了检测的灵敏性。
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