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公开(公告)号：CN118240864A
公开(公告)日：2024-06-25
申请号：CN202410299735.2
申请日：2024-03-15
Applicant: 华南农业大学
IPC: C12N15/82 , C12N15/113 , C12N15/29 , A01H5/00 , A01H6/46
Abstract: 本发明属于基因编辑技术领域，具体涉及一种水稻OsFD1基因启动子区的STR或靶向删除该STR的方法在水稻分子育种中的应用。本发明基于CRISPR/Cas9系统的删除实验以及对基因编辑水稻的抽穗期和产量等农艺性状的分析，发现启动子区的短串联重复影响OsFD1基因的表达，通过对该区域的序列删除，可以适当延迟水稻抽穗期，提升水稻的产量。本发明获得的T1代纯合突变体即可筛选出抽穗期和产量优良的材料应用于后续育种，极大地缩短了育种年限，提高了优良水稻品种对不同地区和季节的适应能力，对扩大优良品种的种植范围和提高产量有重要意义，为作物育种改良提供一种新策略。
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公开(公告)号：CN118197405A
公开(公告)日：2024-06-14
申请号：CN202410299676.9
申请日：2024-03-15
Applicant: 华南农业大学
Abstract: 本申请涉及一种基因表达矩阵在线交互分析方法、装置、设备及介质，所述方法包括：获取当前基因分析项目信息；基于所述基因分析项目信息在所述基因表达矩阵分析界面中显示多个基因信息编辑区，每个基因信息编辑区显示单个基因信息相对应的多个可选项；确定所述可选项中选定的基因表达矩阵、基因分组信息和/或基因注释信息，在所述基因表达矩阵分析界面中初始化显示与所述基因表达矩阵相对应的基因分析结果；将所述基因分析结果相互串联组合为所述基因分析项目信息相对应的分析流程图，以展示出所述基因分析项目信息相对应的生物信息学分析报告。本申请能够达到无需代码基础即可进行高级生物信息学分析。
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公开(公告)号：CN117024540A
公开(公告)日：2023-11-10
申请号：CN202310775433.3
申请日：2023-06-27
Applicant: 华南农业大学
IPC: C07K14/415 , C12N15/29 , C12N15/82 , A01H5/00 , A01H6/46
Abstract: 本发明公开了一种水稻杂种不育相关基因Sc‑P1和Sc‑P3及其编码蛋白和应用。本发明利用遗传学分析方法鉴定到了杂种不育座位Sci的组成基因Sc‑P1和Sc‑P3，并针对Sc‑P1和Sc‑P3选取合适的基因编辑位点，利用基因工程技术分别对Sc‑P1和Sc‑P3进行定点敲除。在证明敲除Sc‑P1或Sc‑P3不影响植株花粉育性的基础上，分别以sc‑p1和sc‑p3突变系与粳稻杂交的杂种F1的花粉育性正常，即消除了Sci座位杂种不育的遗传效应。本发明提供的水稻杂种不育相关基因Sc‑P1和Sc‑P3，可有效地消除Sci座位介导的远缘杂种生殖障碍，对突破水稻远缘杂种优势利用瓶颈具有重要的应用价值。
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公开(公告)号：CN114524879B
公开(公告)日：2023-09-01
申请号：CN202111603075.5
申请日：2021-12-24
Applicant: 华南农业大学
Abstract: 本发明公开了一种高效的植物广靶向腺嘌呤单碱基编辑器及其构建与应用。所述腺嘌呤单碱基编辑器包含水稻密码子序列偏好性优化的核酸序列编码的SpCas9变体融合蛋白TadA8e‑DBD‑SpRY(hyABE8e‑SpRY)，从N端到C端，依次核定位信号bpNLS，脱氨酶TadA8e，DNA单链结合域DBD，SpCas9缺刻酶变体SpRYn，以及核定位信号bpNLS。相比现有植物腺嘌呤单碱基编辑器，本发明构建的腺嘌呤单碱基编辑器具有高效、广靶向识别几乎所有NNN‑PAM、更宽的编辑窗口、无靶序列偏好性、可检测的自靶向sgRNA效应、以及脱靶效率低的特点。
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公开(公告)号：CN114990144A
公开(公告)日：2022-09-02
申请号：CN202210521633.1
申请日：2022-05-13
Applicant: 华南农业大学
Abstract: 本发明公开了一种由特异核苷酸序列引导的缺刻酶介导的DNA组装载体及其应用。本发明所述DNA组装载体包含一个由特异核苷酸序列、具有筛选标记功能的基因表达盒和缺刻酶位点组成的一种由特异核苷酸序列引导的缺刻酶组装元件(UNiE)，可用于长片段DNA克隆和多基因片段的高效组装。本发明同时将UNiE元件与多基因叠加系统(TGSII)相结合，构建了一个组装效率更高的新型多基因叠加系统(TGSII‑UNiE)，实现了对多基因的高效组装，具有效率高、操作简便和成本低的特点。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN114736912A
公开(公告)日：2022-07-12
申请号：CN202210296049.0
申请日：2022-03-24
Applicant: 华南农业大学
Abstract: 本发明公开了经密码子优化的玉米rZmG2基因及其在提高植物遗传转化效率中的应用，并基于此提供了一种提高植物遗传转化效率的技术体系，包括含有所述优化rZmG2基因的重组载体、表达盒或重组菌在提高植物转化效率的应用。本发明同时提供了包含rZmG2基因的热激诱导的自删除载体结构，其为基于Cre/loxP的基因删除重组载体、表达盒或重组菌，用于删除转基因植株中的rZmG2基因和潮霉素筛选标记，或其他外源基因和筛选标记。本发明将优化的rZmG2基因通过植物表达载体以基因工程手段整合到植物染色体上，能显著提高植物的遗传转化效率。且利用本发明技术体系获得的转基因植株，可通过热激诱导的Cre/loxp基因删除系统自动删除rZmG2基因和筛选标记基因，从而避免转基因对植株后续生长发育的可能影响。
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公开(公告)号：CN114657179A
公开(公告)日：2022-06-24
申请号：CN202210181702.9
申请日：2022-02-25
Applicant: 华南农业大学
Abstract: 本发明提供了一种愈伤组织特异强启动子Pcsp，涉及植物生物技术及基因工程领域。本发明成功分离并克隆了一种愈伤组织特异强启动子Pcsp，克服了现有技术利用组成型启动子驱动标记基因，表达活性不高或特异性较低的不足。本发明还提供了在本启动子Pcsp的应用。该Pcsp启动子可以用来构建植物遗传转化和基因编辑载体，可以驱动标记基因、Cas核酸酶编码基因或特定功能基因在愈伤组织中特异高水平表达，表达水平约为组成型启动子P35S所驱动GUS的4倍；不影响转基因阳性植株正常生长的情况下，在植株组织器官中不表达，具有特异性，更安全，可解决生物安全方面的担忧；在基因编辑实验中周期短、成本低、灵敏度高，在植物遗传转化和基因工程领域具有很好的应用前景。
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公开(公告)号：CN114524879A
公开(公告)日：2022-05-24
申请号：CN202111603075.5
申请日：2021-12-24
Applicant: 华南农业大学
Abstract: 本发明公开了一种高效的植物广靶向腺嘌呤单碱基编辑器及其构建与应用。所述腺嘌呤单碱基编辑器包含水稻密码子序列偏好性优化的核酸序列编码的SpCas9变体融合蛋白TadA8e‑DBD‑SpRY(hyABE8e‑SpRY)，从N端到C端，依次核定位信号bpNLS，脱氨酶TadA8e，DNA单链结合域DBD，SpCas9缺刻酶变体SpRYn，以及核定位信号bpNLS。相比现有植物腺嘌呤单碱基编辑器，本发明构建的腺嘌呤单碱基编辑器具有高效、广靶向识别几乎所有NNN‑PAM、更宽的编辑窗口、无靶序列偏好性、可检测的自靶向sgRNA效应、以及脱靶效率低的特点。
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公开(公告)号：CN113832252A
公开(公告)日：2021-12-24
申请号：CN202111288746.3
申请日：2021-11-02
Applicant: 华南农业大学 , 广州瑞科基因科技有限公司
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6869 , C12Q1/6806 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种籼粳稻SNP位点基因型检测的方法，涉及生物技术领域。通过对水稻全基因组进行超低深度测序，获取核心SNP位点的基因型，经过近距离SNP的基因型组成分析，校正后，综合判定核心SNP位点的基因型。本发明提供的方法可以在超低的测序深度(2‑10倍)下实现高达90％的检测正确率。极大程度上降低了抽样数量，降低了工作量，优化了测试区域，使得检测结果更为准确。
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公开(公告)号：CN107641152B
公开(公告)日：2021-03-12
申请号：CN201710954813.8
申请日：2017-10-13
Applicant: 华南农业大学
IPC: C07K14/415 , C12N15/29 , C12N15/82 , A01H5/00 , A01H6/46
Abstract: 本发明公开了一种水稻mTERF转录终止因子基因V14，其籼稻型V14‑I的核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示，编码的氨基酸序列如SEQ ID NO：3所示；其粳稻型V14‑J的核苷酸序列如SEQ ID NO：2所示，编码的氨基酸序列如SEQ ID NO：4所示；V14基因的正常表达保证了水稻叶绿体发育，V14‑J和V14‑I均能回复v14突变体白化表型；另外，V14是一个新的水稻响应环境温度基因，该基因可以调控水稻耐冷能力，所述基因对培育耐冷植物新品种，特别是培育耐冷水稻新品种具有重要意义；为水稻育种及发育机制研究提供了新的基因资源，在调控水稻籼稻耐冷方面具有应用价值。
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