一种植物等位基因不平衡表达检测方法

    公开(公告)号:CN106755408A

    公开(公告)日:2017-05-31

    申请号:CN201611200502.4

    申请日:2016-12-22

    Abstract: 本发明提供了一种植物等位基因不平衡表达检测方法,包括以下步骤:1)比较候选基因序列,筛选标记等位基因的SNPs位点;2)根据筛选到的SNPs位点设计qPCR特异引物和简并引物;3)用qPCR特异引物和简并引物分别对待测样本的cDNA进行PCR扩增,获得扩增产物;4)若扩增产物的熔解曲线为单峰,根据PCR扩增的Ct值计算待测样本等位基因表达特异性;所述qPCR特异引物包括正向引物和反向引物,对引物3'末端与SNP位点3'末端互补的核苷酸进行LNA修饰。所述方法增加了检测结果的精确性和可靠性,并且简化了实验配套条件,显著地降低了实验成本。

    采用MSAP技术检测林木木质部DNA甲基化的方法及试剂盒

    公开(公告)号:CN104293893A

    公开(公告)日:2015-01-21

    申请号:CN201310298785.0

    申请日:2013-07-16

    CPC classification number: C12Q1/6858 C12Q2525/191 C12Q2521/301 C12Q2531/113

    Abstract: 本发明公开了一种采用MSAP技术检测林木木质部DNA甲基化的方法及试剂盒。其中,该方法包括以下步骤:S1,提取林木木质部DNA;S2,分别用EcoRI/HpaII、EcoRI/MspI两组酶对林木木质部DNA进行酶切;S3,分别对酶切得到的产物连接上限制性内切酶的接头;S4,以接头为模板设计的预扩增引物进行PCR预扩增,得PCR预扩增产物;S5,将PCR预扩增产物稀释后,加入带有选择性碱基的筛选引物进行PCR扩增;S6,电泳检测PCR扩增产物,统计并分析DNA条带。应用本发明的技术方案,能够为表观遗传变异研究提供有力的技术支持,为目标的林木分子标记辅助育种提供新的候选标记位点。

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