公开(公告)号：CN108220146A

公开(公告)日：2018-06-29

申请号：CN201711464744.9

申请日：2013-10-04

Applicant: 贝斯4创新公司

Inventor： 卡梅伦·亚历山大·弗雷林 ,  巴纳比·巴姆福思 ,  布鲁诺·弗拉维奥·诺盖拉·德·索萨·苏亚雷斯 ,  托马斯·亨利·艾萨克 ,  鲍里斯·布赖纳 ,  亚历山德拉·纳塔莱 ,  米歇尔·阿马西奥

IPC: C12M1/34 ,  C12Q1/6869

CPC classification number: C12Q1/6874 ,  C12Q1/6869 ,  C12Q2521/101 ,  C12Q2521/301 ,  C12Q2521/319 ,  C12Q2521/501 ,  C12Q2525/301 ,  C12Q2563/159 ,  C12Q2565/1015 ,  C12Q2565/629

Abstract: 本发明公开了用于核酸测序的微流体设备，其特征在于包括：第一区，分析物被包含在其中并且被逐步消化成作为其组成的单核苷酸的流；与第一区连接的一级微流体路径，其适于允许包含一级水性微滴的有序流的载体溶剂通过，一级水性微滴中的至少一些包含单核苷酸中的一种；第二区，其放置在一级微流体路径内，并且包含微滴注射器和/或聚结装置，所述聚结装置用于使来自二级微流体路径的二级水性微滴聚结成所述有序流中的一级水性微滴；存储区，其在第二区的下游与一级微流体路径连接，一级水性微滴被存储在所述存储区中；光源，其用于检测在一级微流体路径下游的一个或多个位置处的微滴，和光检测器，其用于检测来自所述位置处的一级水性小滴的荧光。

公开(公告)号：CN106460057A

公开(公告)日：2017-02-22

申请号：CN201580028894.8

申请日：2015-06-02

Applicant: 贝斯4创新公司

Inventor： 巴纳比·巴姆福思

IPC: C12Q1/68

CPC classification number: C12Q1/6827 ,  C12Q1/6811 ,  C12Q1/6858 ,  C12Q2521/501 ,  C12Q2535/131 ,  C12Q2561/125

Abstract: 态的可检测元件，并且(c)然后检测与现在可检提供一种表征DNA分析物的方法，所述DNA分 测元件相关的检测特性，由此鉴定Y变体以及因析物包含特征为核苷酸多态性位点的一种或多 此由其产生的等位基因的性质。还公开了第二镜种多核苷酸类型，每种所述多核苷酸类型包含具 像方法。还提供了可以在其中实施所述方法的囊有式-X-Y-Z-的靶标区，其中X和Z分别是第一和 泡。所述方法适用于一定范围的诊断筛查应用，第二特征性侧翼寡核苷酸区，并且Y是组成所述 包括与遗传病症和癌症相关的突变体等位基因位点的变体之一。所述方法的特征在于下述步 的检测。骤：(a)在连接酶的存在下，使包含来源于至少一种多核苷酸类型的靶标区的单链寡核苷酸与一组未使用的探针反应，所述未使用的探针包含：(i)一种单链第一适体，所述单链第一适体在其3’端以与–X或–X-Y的序列互补的序列终止，和(ii)一种或多种第二单链适体，所述第二单链适体在其5’端以与–Z-Y或–Z(当情形可能如此时)的序列互补的序列终止，并且用处在不可检测状态的可检测元件标记，从而产生包含所述寡核苷酸、第一适体、和第二适体中的一种的基本上双链的使用的探针；(b)使用外切核酸酶或表现出外切核酸酶活性的聚合酶将所述使用的探针在

公开(公告)号：CN106133150A

公开(公告)日：2016-11-16

申请号：CN201580015644.0

申请日：2015-02-13

Applicant: 贝斯4创新公司

Inventor： 巴纳比·巴姆福思 ,  安娜·路易莎·布拉斯·道斯·桑托斯·里贝罗·达·席尔瓦

IPC: C12Q1/68

Abstract: 确定给定的单一核苷酸是被甲基化的还是未被甲基化的方法，其特征在于下述步骤：(a)使所述单一核苷酸与一种或多种杂交探针类型接触，每种所述杂交探针类型在其未使用形式包含：(1)连接一个或多个处于基本不可检测状态的第一可检测元件的第一寡核苷酸，并且所述第一寡核苷酸还包含：(i)双链和单链区，和(ii)连接在所述双链区邻近所述单链区的末端的耐受核酸外切降解的区域，和(2)连接一个或多个也处在基本不可检测状态的第二可检测元件的第二单链寡核苷酸，并且改变所述第二单链寡核苷酸为至少部分是所述第一寡核苷酸的单链区的核苷酸序列互补物；(b)对于引起(i)所述单一核苷酸与所述耐受核酸外切降解的区域和所述单链区结合，和(ii)所述第二寡核苷酸与所述单一核苷酸和所述单链核苷酸区结合，以产生基本上双链的使用的探针的相关的探针类型；(c1)将所述使用的探针用甲基化依赖性限制性内切核酸酶在如果所述单一核苷酸被甲基化，则所述使用的探针在邻近耐受核酸外切降解的区域处被切割成两个双链寡核苷酸产物的条件下处理，或者(c2)将所述使用的探针用甲基化敏感性限制性内切核酸酶在如果所述单一核苷酸未被甲基化，则所述使用的探针在邻近耐受核酸外切降解的区域处被切割成两个双链寡核苷酸产物的条件下处理；并且，然后(d1)将步骤(c1)的产物用外切核酸酶或展现出外切核酸酶活性的聚合酶处理，使得如果所述单一核苷酸被甲基化，则仅释放处于可检测状态的第一可检测元件或释放处于可检测状态的第一和第二可检测元件二者，或如果所述单一核苷酸未被甲基化，则仅释放第二可检测元件，或者，(d2)将步骤(c2)的产物用外切核酸酶或展现出外切核酸酶活性的聚合酶处理，使得如果所述单一核苷酸未被甲基化，则仅释放处于可检测状态的第一可检测元件或释放处于可检测状态的第一和第二可检测元件二者，或如果所述单一核苷酸被甲基化，则仅释放第二可检测元件。

公开(公告)号：CN104903463A

公开(公告)日：2015-09-09

申请号：CN201380062971.2

申请日：2013-10-04

Applicant: 贝斯4创新公司

Inventor： 卡梅伦·亚历山大·弗雷林 ,  巴纳比·巴姆福思 ,  布鲁诺·弗拉维奥·诺盖拉·德·索萨·苏亚雷斯 ,  托马斯·亨利·艾萨克 ,  鲍里斯·布赖纳 ,  亚历山德拉·纳塔莱 ,  米歇尔·阿马西奥

IPC: C12Q1/68

CPC classification number: C12Q1/6874 ,  C12Q1/6869 ,  C12Q2521/101 ,  C12Q2521/301 ,  C12Q2521/319 ,  C12Q2521/501 ,  C12Q2525/301 ,  C12Q2563/159 ,  C12Q2565/1015 ,  C12Q2565/629

Abstract: 本发明公开了用于测序多核苷酸分析物的方法，所述方法包括：a.产生含有单核苷酸的小滴流，其中在所述小滴流中的单核苷酸的顺序与所述分析物中核苷酸的序列对应；b.向每个小滴中引入多个生物探针类型，每个类型包含处于不可检测状态的不同的标记且适于捕获不同的单核苷酸；c.使包含在所述小滴中的单核苷酸与其互补探针结合；d.使所述标记以可检测状态从已经结合单核苷酸的探针释放。所述探针是哑铃形状的探针，其包含荧光供体和猝灭剂标记和单核苷酸缺口。在通过聚合酶和连接酶修复缺口后，通过限制酶切割限制酶识别位点，然后进行外切核酸酶消化，以释放所述标记。