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公开(公告)号:CN112980969B
公开(公告)日:2023-05-16
申请号:CN202110374309.7
申请日:2021-04-07
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种山羊CMTM2基因CNV标记的检测方法与应用:以山羊基因组DNA为模板,以引物对P1和P2为引物,通过实时荧光定量PCR分别扩增山羊CMTM2基因CNV区域和内参基因MC1R的部分片段,根据2×2‑ΔΔCt将定量结果分为插入型、缺失型和正常型,从而鉴定山羊CMTM2基因候选区域Chr18:35601201bp‑35603200bp的CNV类型。根据CMTM2基因的CNV类型与山羊生长性状的关联分析结果,本发明可在DNA水平上检测与山羊生长性状密切相关的CNV标记,从而通过山羊生长性状的标记辅助选择,快速建立遗传资源优良的山羊种群。
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公开(公告)号:CN110904247B
公开(公告)日:2022-05-31
申请号:CN201911385215.9
申请日:2019-12-28
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858
Abstract: 本发明公开了一种山羊Sox9基因InDel标记的检测方法及其应用。该方法是通过PCR扩增、琼脂糖凝胶电泳鉴定山羊Sox9基因中的一个InDel位点的多态性,根据对InDel位点与山羊生长性状进行的关联性分析,发现该Sox9基因InDel位点的不同基因型与陕北白绒山羊胸围之间存在显著相关,提示所述InDel位点的基因型可作为提高山羊胸围的DNA标记,本发明的检测方法可以在山羊生长性状的标记辅助选择育种中应用,快速建立优良的山羊遗传资源群体。
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公开(公告)号:CN108441566B
公开(公告)日:2021-06-29
申请号:CN201810301992.X
申请日:2018-04-04
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858
Abstract: 本发明公开了一种山羊ATBF1基因插入/缺失多态性的检测方法及其应用。以待测山羊全基因组DNA为模板,以引物对P1和P2为引物,通过PCR技术扩增山羊ATBF1基因部分片段,再进行琼脂糖凝胶电泳,鉴定山羊ATBF1基因indel位点多态性。相关分析结果揭示,ATBF1基因的indel位点的不同基因型与陕北白绒山羊、关中奶山羊和海南黑山羊的体高、胸围存在显著相关,揭示ATBF1基因indel位点的基因型可作为提高山羊体高和胸围性状的DNA标记。本发明可应用在山羊标记辅助选择育种中,有利于快速建立优良体尺性状的山羊遗传资源群体。
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公开(公告)号:CN112980935A
公开(公告)日:2021-06-18
申请号:CN202110352715.3
申请日:2021-03-31
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6858 , C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种山羊PRNT基因单核苷酸多态性标记在性状早期选择中的应用。以山羊全基因组DNA为模板,通过PCR扩增山羊PRNT基因部分片段,通过测序鉴定该基因的g.149C>T突变位点在山羊群体中的多态性。根据关联分析结果,PRNT基因的这一单核苷酸多态性位点的基因型与山羊的胸围、胸宽极显著相关,可用于快速建立遗传资源优良的山羊群体,从而可以通过山羊性状的早期标记辅助选择加快育种进程。
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公开(公告)号:CN107164482B
公开(公告)日:2020-02-18
申请号:CN201710414058.4
申请日:2017-06-05
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种山羊CSN1S1基因插入/缺失的检测方法及其应用。该方法是以待测山羊全基因组DNA为模板,通过PCR技术扩增山羊CSN1S1基因,再进行琼脂糖凝胶电泳,鉴定山羊CSN1S1基因存在indel位点多态性。大样本(N>1000)相关分析结果揭示,CSN1S1基因indel的不同类型与陕北白绒山羊第一胎产羔性状之间存在显著相关,提示CSN1S1基因indel的不同类型可作为提高山羊第一胎产羔性状的DNA标记。本发明提供的快速检测山羊CSN1S1基因indel的方法,可在中国山羊繁殖性状的标记辅助选择育种中应用,有利于快速建立高产羔数性状的山羊遗传资源群体。
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公开(公告)号:CN110607373A
公开(公告)日:2019-12-24
申请号:CN201910877427.2
申请日:2019-09-17
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858
Abstract: 本发明公开了一种山羊DNAH1基因插入/缺失多态性的检测方法及其应用。以待测山羊全基因组DNA为模板,通过PCR扩增山羊DNAH1基因部分片段,再进行琼脂糖凝胶电泳,根据电泳结果鉴定山羊DNAH1基因NC_030829.1:g.48594103_48594129位27-bp插入/缺失多态性位点的基因型。相关分析结果发现,该山羊DNAH1基因的27-bp插入/缺失多态性的不同基因型与陕北白绒山羊的产羔数性状存在显著相关关系,存在提高山羊产羔数性状的DNA标记。本发明提供的检测山羊DNAH1基因插入/缺失多态性的方法,可应用于山羊分子标记辅助选择育种中,加快建立优良山羊遗传资源群体。
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公开(公告)号:CN108441566A
公开(公告)日:2018-08-24
申请号:CN201810301992.X
申请日:2018-04-04
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858
Abstract: 本发明公开了一种山羊ATBF1基因插入/缺失多态性的检测方法及其应用。以待测山羊全基因组DNA为模板,以引物对P1和P2为引物,通过PCR技术扩增山羊ATBF1基因部分片段,再进行琼脂糖凝胶电泳,鉴定山羊ATBF1基因indel位点多态性。相关分析结果揭示,ATBF1基因的indel位点的不同基因型与陕北白绒山羊、关中奶山羊和海南黑山羊的体高、胸围存在显著相关,揭示ATBF1基因indel位点的基因型可作为提高山羊体高和胸围性状的DNA标记。本发明可应用在山羊标记辅助选择育种中,有利于快速建立优良体尺性状的山羊遗传资源群体。
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公开(公告)号:CN117385059A
公开(公告)日:2024-01-12
申请号:CN202311627105.5
申请日:2023-11-30
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种预示绒山羊布病风险抗性的插入/缺失标记方法、检测试剂盒及其应用,属于生物技术与家畜育种技术领域。以待检测绒山羊全基因组为模板,设计引物以扩增绒山羊MBL2基因部分片段,再利用琼脂糖凝胶电泳和测序技术鉴定绒山羊MBL2基因第45046317_45046328位插入/缺失多态性位点的基因型,根据检测得到的不同基因型和等位基因在绒山羊病例和对照的分布,可认为MBL2基因第45046317_45046328位插入/缺失位点携带有插入型等位基因是绒山羊个体布病风险抗性基因,可起到预测绒山羊个体布病抗性的作用,因而该方法可应用在绒山羊分子标记辅助育种中,加快建立抗布病绒山羊优势遗传资源群体。
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公开(公告)号:CN112980935B
公开(公告)日:2023-10-13
申请号:CN202110352715.3
申请日:2021-03-31
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6858 , C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种山羊PRNT基因单核苷酸多态性标记在性状早期选择中的应用。以山羊全基因组DNA为模板,通过PCR扩增山羊PRNT基因部分片段,通过测序鉴定该基因的g.149C>T突变位点在山羊群体中的多态性。根据关联分析结果,PRNT基因的这一单核苷酸多态性位点的基因型与山羊的胸围、胸宽极显著相关,可用于快速建立遗传资源优良的山羊群体,从而可以通过山羊性状的早期标记辅助选择加快育种进程。
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公开(公告)号:CN116287315A
公开(公告)日:2023-06-23
申请号:CN202310336180.X
申请日:2023-03-31
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种绒山羊CTLA‑4基因插入/缺失标记的检测方法及其应用,以待检测绒山羊全基因组为模板,以设计的引物对P1和P2为扩增引物,通过PCR扩增绒山羊CTLA‑4基因部分片段,再利用琼脂糖凝胶电泳和测序技术鉴定绒山羊CTLA‑4基因NC_030809.1:rs655778058,g.43841952_43841968位和NC_030809.1:rs656541224,g.43843568_43843579位插入/缺失多态性位点的基因型。相关分析结果发现,绒山羊CTLA‑4基因两个InDel位点不同基因型与陕北白绒山羊布病抗性存在显著相关关系,可以作为陕北白绒山羊抗布病育种的有效DNA标记。本发明根据检测到的绒山羊CTLA‑4基因InDel位点插入/缺失的基因型,可作为绒山羊布病防治与抗布病遗传育种的有效DNA标记。
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