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公开(公告)号:CN114512186B
公开(公告)日:2025-02-11
申请号:CN202210145716.5
申请日:2022-02-17
Applicant: 南京大学
Abstract: 本发明公开了一种在植物基因组中检测体细胞突变的方法。所述方法包括(1)重测序数据的评估;(2)重测序数据的拼装;(3)突变位点的鉴定;(4)突变位点的评估;(5)突变位点的筛选;(6)候选突变位点的分类与标签化;(7)突变位点的人工检验。本发明提供的方法,可以在各种植物基因组中高效、全面的检测体细胞突变,包括单核苷酸变异位点(SNV)与插入缺失位点(INDEL),为评估植物体细胞突变率提供了有力分析工具,从而为研究体细胞突变对植物发育与进化的影响提供分子基础。
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公开(公告)号:CN113628687A
公开(公告)日:2021-11-09
申请号:CN202110931309.2
申请日:2021-08-13
Applicant: 南京大学
Abstract: 本发明公开了一种植物成对NLR抗性基因数据库的构建方法及其多物种成对NLR基因数据库。所述方法包括从JGI或Ensembl收集目的物种的基因组数据;通过Hmmscan和NLR‑parser工具鉴定NLR基因;结合基因注释信息筛选成簇NLR基因;通过Hmmscan和Blast工具分析NLR基因的特殊结构域;基于成对NLR基因的演化特征,通过Blast、Clustalw2、MEGA7.0等工具多轮检索目的物种的成对NLR基因;以成对NLR基因对应的特征值作为数据项标识建立成对NLR基因数据库。利用本发明提供的方法,可以对不同植物物种中的成对NLR抗性基因进行全基因组范围的检索和分析,为研究和改进作物的抗性育种提供了分子证据。
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公开(公告)号:CN104372011A
公开(公告)日:2015-02-25
申请号:CN201410462383.4
申请日:2014-09-11
Applicant: 南京大学
IPC: C12N15/29 , C07K14/415 , C12N15/113 , C12N15/84 , A01H5/00 , A01N47/44 , A01P3/00
Abstract: 本发明属于基因工程技术领域,具体涉及一种水稻稻瘟病抗性基因RMg41及其应用。本发明公开了水稻稻瘟病新抗性基因RMg41的核苷酸序列及其编码的氨基酸多肽序列。该基因属于NBS-LRR类型抗病基因家族的成员。本发明中的抗稻瘟病基因克隆自对稻瘟病菌表现出高抗的水稻品系,并将其转化至对稻瘟病菌感病的品种中,利用稻瘟病菌侵染的方法对其抗病能力进行评估,从而最终确定该基因对水稻稻瘟病具有抗性。
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公开(公告)号:CN102732531B
公开(公告)日:2013-10-09
申请号:CN201210182285.6
申请日:2012-06-05
Applicant: 南京大学
IPC: C12N15/29 , C07K14/415 , C12N15/113 , C12N15/63 , A01H5/00 , A01N47/44 , A01P3/00
Abstract: 本发明属于基因工程技术领域,具体涉及一种水稻稻瘟病抗性基因RMg7或RMg8或RMg9及其应用。本发明公开了水稻稻瘟病新抗性基因RMg7、RMg8和RMg9的核苷酸序列及其编码的氨基酸多肽序列。这三个基因都属于NBS-LRR类型抗病基因家族的成员。本发明中的三个抗稻瘟病基因均克隆至对稻瘟病菌表现出高抗的水稻品系,并将其转化至对稻瘟病菌感病的品种中,利用稻瘟病菌侵染的方法对其抗病能力进行评估,从而最终确定该三个基因对稻瘟病具有抗性。
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公开(公告)号:CN101904529A
公开(公告)日:2010-12-08
申请号:CN200910026929.0
申请日:2009-06-02
Applicant: 南京大学
Abstract: 本发明提供了一种天然玉米饮料的生产方法,其特征在于玉米经去杂处理后,进行浸泡,去皮去面筛分成颗粒,加添加剂1后浸泡12-16小时,再加添加剂2后浸泡8-12小时,过滤,加入适量水磨浆,再加添加剂3后加入从自然环境中选育的植物乳杆菌(Lactobacillus plantarum)发酵,使其pH值为3-4,添加各种风味鲜水果汁、乳化剂后均质成浆,加蔗糖,高温灭菌、冷却、包装。本发明方法简单,容易掌握,其生产的产品品质好,口感细腻,酸甜爽口,风味独特,且营养价值高,有食疗、食补的功效,符合绿色、保健、营养的现代生活饮食理念。
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