一种棉花60K功能位点基因芯片及其应用

    公开(公告)号:CN117887888A

    公开(公告)日:2024-04-16

    申请号:CN202410106462.5

    申请日:2024-01-25

    Abstract: 本发明涉及一种棉花60K功能位点基因芯片及其应用。其通过对3653个棉花样本的数据进行采集分析,对不同类别遗传变异位点的特征权重进行定义,按照一定长度的滑动窗口分别统计每个窗口的连锁得分并标记得分最高的位点作为窗口的候选变异并设计为探针。相较于已有的基因芯片,所用到的种质资源更广泛,包含更多经过多维数据注释的功能遗传变异的功能位点,因此在不同棉花品种间检测准确度更高,此外还可应用于棉花育种以及全基因组关联分析中,可提高关键基因的挖掘效率,提升育种效率,实际应用范围更为广泛。

    一种棉花基因的编辑方法
    22.
    发明公开

    公开(公告)号:CN108203714A

    公开(公告)日:2018-06-26

    申请号:CN201611188402.4

    申请日:2016-12-20

    CPC classification number: C12N15/8205 C12N9/1247 C12N15/66 C12Y207/07006

    Abstract: 本发明属于植物基因工程技术领域,具体涉及一种棉花基因的编辑方法。公开了用于棉花基因组编辑的CRISPR‑Cas9系统及其构建方法。本发明克隆得到两个陆地棉U6启动子pGhU6‑7和pGhU6‑9,并突变了Bsa Ⅰ酶切位点。利用优化后的启动子构建了在棉花中具有编辑能力的CRISPR‑Cas9载体的两个载体pRGEB32‑GhU6.7‑NPT Ⅱ、pRGEB32‑GhU6.9‑NPT Ⅱ。选取1个棉花内源基因GhCLA为目标基因,设计四个靶向该基因的sgRNA,引导Cas9蛋白在GhCLA的特异位点进行切割。通过棉花的白化表型、酶切图、测序验证,表明pGhU6‑7I和pGhU6‑9I驱动的CRISPR‑Cas9基因编辑系统在棉花内具有编辑能力。

    一种纤维伸长期优势表达的启动子及制备方法和应用

    公开(公告)号:CN103589720B

    公开(公告)日:2015-09-30

    申请号:CN201210288775.4

    申请日:2012-08-14

    Abstract: 本发明公开了一种纤维伸长期优势表达的启动子及制备方法和应用,该启动子主要在伸长期优势表达,将这两个启动子PGhGLP2和PGbGLP3与GUS融合转化棉花,组织化学染色表明:启动子PGhGLP2和PGbGLP3都是除了在开花当天的胚珠上没有表达外,从1DPA开始都能在纤维上检测到GUS的表达,但在胚珠中是没有表达的。但这两个启动子的表达高峰是在棉花纤维伸长期。伸长期对于棉花纤维来说是一个非常关键的时期,在遗传改良中运用该启动子特异的表达某些对纤维高品质的形成非常关键的基因将会增加棉花的产量而不影响其他组织器官的生长。

    一种棉花Phytosulfokine前体基因GhPSKP及制备方法和应用

    公开(公告)号:CN103571850B

    公开(公告)日:2015-09-30

    申请号:CN201210260715.1

    申请日:2012-07-26

    Abstract: 本发明公开了一种棉花Phytosulfokine前体基因GhPSKP及制备方法和应用,从棉花纤维发育不同时期表达谱中分离出一条与其它植物PSKP基因高度同源的EST,生物信息学分析表明,该EST包含一个完整的ORF,将其命名为GhPSKP。该基因在纤维伸长各个时期高效表达,从陆地棉品种YZ1中提取10DPA纤维总RNA,利用反转录酶SuperscriptⅢ将其反转录合成cDNA,用引物GhPSKPF和GhPSKPR扩增出GhPSKP基因的全长cDNA。将扩增获得的PCR产物连入pGEM-T载体,筛选阳性克隆并测序,获得所需的基因全长cDNA。进一步证实该基因在棉花纤维快速伸长阶段优势表达。运用转基因手段在棉花体内超量表达该基因能够有效促进纤维的伸长。利用本发明可以有效促进棉花纤维的伸长,改良棉花纤维品质。

    一种纤维伸长期优势表达的启动子及制备方法和应用

    公开(公告)号:CN103589720A

    公开(公告)日:2014-02-19

    申请号:CN201210288775.4

    申请日:2012-08-14

    Abstract: 本发明公开了一种纤维伸长期优势表达的启动子及制备方法和应用,该启动子主要在伸长期优势表达,将这两个启动子PGhGLP2和PGbGLP3与GUS融合转化棉花,组织化学染色表明:启动子PGhGLP2和PGbGLP3都是除了在开花当天的胚珠上没有表达外,从1DPA开始都能在纤维上检测到GUS的表达,但在胚珠中是没有表达的。但这两个启动子的表达高峰是在棉花纤维伸长期。伸长期对于棉花纤维来说是一个非常关键的时期,在遗传改良中运用该启动子特异的表达某些对纤维高品质的形成非常关键的基因将会增加棉花的产量而不影响其他组织器官的生长。

    一种棉花纤维伸长期表达的启动子及制备方法和应用

    公开(公告)号:CN103571841A

    公开(公告)日:2014-02-12

    申请号:CN201210280595.1

    申请日:2012-08-08

    Abstract: 本发明公开了一种棉花纤维伸长期表达的启动子及制备方法和应用,把这个启动子同时转化了棉花和烟草,从烟草的染色结果中可以看出GUS染色主要集中在子房、花柱、株头、花药、苞叶、花柄基部、花瓣、种子等生殖器官,值得注意的是在叶片及叶片的表皮毛上染色尤其明显,表明GhFLA1在这些部位可能优势表达。棉花纤维从0天到20天纤维的染色情况来看所有的时期都能检测到GUS蛋白的表达。该启动子可以用于改良纤维品质育种。

    一种棉花酪蛋白激酶基因及其应用

    公开(公告)号:CN102925466A

    公开(公告)日:2013-02-13

    申请号:CN201110231724.3

    申请日:2011-08-12

    Abstract: 本发明公开了一种棉花酪蛋白激酶基因及应用,涉及一种从棉花花药表达谱中鉴定的控制花药发育的基因GhCKI的分离克隆、功能验证和应用。GhCKI基因编码的蛋白与拟南芥ATCKL2基因编码的蛋白有72%的同源性,GhCKI基因在花药中优势表达,具有控制花药发育的功能,通过遗传转化可应用于各种植物不育系的培育,同时可作为高温胁迫下植物花药育性稳定性的标记基因。

    利用棉花基因GbF3H改变花瓣颜色

    公开(公告)号:CN102485897A

    公开(公告)日:2012-06-06

    申请号:CN201010582448.0

    申请日:2010-12-06

    Abstract: 本发明属于植物基因工程技术领域。具体涉及一种分离、克隆的GbF3H基因,功能验证表明该基因是一种能够改变棉花花瓣颜色的功能基因,其核苷酸序列如序列表SEQ ID NO:1所示,它编码的氨基酸序列如SEQ ID NO:2所示,编码368个氨基酸。所述的基因GbF3H与植物类黄酮代谢及花青素的合成相关。通过RNAi抑制该基因的表达可以显著减少棉花花瓣的花青素含量,使花色变淡;而超量表达该基因可以提高棉花花瓣的花青素含量。利用本发明克隆的通过转化可能改变植物花瓣的颜色,也可以应用于花卉颜色的改良,同时有望开发出花色相关的分子标记。

    两个棉花纤维发育起始优势表达的强启动子及其应用

    公开(公告)号:CN102485893A

    公开(公告)日:2012-06-06

    申请号:CN201010582335.0

    申请日:2010-12-06

    Abstract: 本发明属于植物基因工程技术领域。公开了两个在棉花纤维起始期优势、高效表达的启动子PGbPDF1-1和PGbPDF1-2及其应用。这两个启动子的核酸序列如序列表SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2所示。所述启动子在棉花纤维发育起始阶段为表达高峰。通过一系列截短启动子序列与GUS融合,转基因棉花验证结果表明翻译起始密码子到其上游236bp的序列是这两个启动子的核心序列。本发明还公开了利用所述启动子所构建的表达盒的结构以及其在培育改良棉花中的应用。

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