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公开(公告)号：CN113151560A
公开(公告)日：2021-07-23
申请号：CN202110497127.9
申请日：2021-05-07
Applicant: 北京林业大学
IPC: C12Q1/6895 , C12N15/113 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种筛选高气孔密度、高光合效率杨树的分子标记，所述分子标记为SNP分子标记组合，由SNP1和SNP2两个SNP位点组成，其中，所述SNP1位于杨树基因组ALMT12基因下游第1182位碱基，具有A/T多态性；所述SNP2位于杨树基因组WRKY32基因上游第94位碱基，具有A/C多态性，上述两个位点组成的分子标记组合，能够在杨树幼苗期精准高效地筛选高气孔密度以及高光合效率的树种，缩短杨树育种周期。本发明还公开了用于检测上述分子标记的引物组及其应用、标记的获得方法、预测杨树气孔密度和光合效率的方法及杨树遗传改良方法等，能够显著提高杨树优异种质资源的选育效率。
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公开(公告)号：CN113025741A
公开(公告)日：2021-06-25
申请号：CN202110255234.0
申请日：2021-03-09
Applicant: 北京林业大学
IPC: C12Q1/6895 , C12N15/11 , A01H1/04
Abstract: 本发明公开了一种改善杨树木材品质的单体型‑上位性位点聚合育种模块，所述聚合育种模块包括1个单体型分子标记和1个上位性分子标记，其中，所述单体型分子标记由标记1、标记2、标记3、标记4组合而成，均位于杨树ALG14基因内，所述上位性标记为SNP标记，位于杨树IRX15‑L基因上游第980位碱基处。本发明公开的改善杨树木材品质的单体型‑上位性位点聚合育种模块，可在杨树幼苗期实现优良品种的早期选育，显著促进杨树的育种进程。本发明还公开了用于检测上述标记的引物组、试剂盒及其应用、改善杨树木材品质的方法，能够在分子水平对杨树的4种木材重要品质性状做出精准评价，提高单位时间内育种群体的木材品质。
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公开(公告)号：CN113005214A
公开(公告)日：2021-06-22
申请号：CN202110064846.1
申请日：2021-01-18
Applicant: 北京林业大学
IPC: C12Q1/6895 , C12N15/11 , A01H1/04
Abstract: 本发明公开了与毛白杨抗旱性状相关的分子标记及其单倍型组合，所述分子标记选自SNP1、SNP2和SNP3中的一个，分子标记组合由SNP1、SNP2和SNP3三个标记组合而成，所述分子标记组合按SNP 1～SNP3依次为A、T、C纯合基因型，即为AA‑TT‑CC基因型组合时，对应的毛白杨具有最强的抗旱能力，利用上述分子标记及其组合，能够在分子水平对毛白杨的抗旱性状做出精准评价，在杨树幼苗期精准、高效地筛选出抗旱种质。本发明还公开了利用上述分子标记鉴定或筛选抗旱能力强的毛白杨的方法及对毛白杨进行遗传改良的方法等，为毛白杨分子标记辅助选择育种提供了有效手段。
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公开(公告)号：CN106521002B
公开(公告)日：2019-09-03
申请号：CN201611198895.X
申请日：2016-12-22
Applicant: 北京林业大学
IPC: C12Q1/6895 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及一组SNP位点在筛选光合作用强、生长快性状毛白杨中的应用及试剂盒，属于分子遗传技术领域。本发明提供了一组SNP位点在筛选光合作用强、生长快性状毛白杨中的应用，所述SNP位点为毛白杨PetC基因第2068位、第2347位和第2457位碱基。利用本发明的应用能够实现光合能力强和生长快的杨树的快速筛选，大大加速育种进程。
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公开(公告)号：CN106599607B
公开(公告)日：2018-12-04
申请号：CN201611143308.7
申请日：2016-12-13
Applicant: 北京林业大学
IPC: G06F19/12
Abstract: 本发明提供了一种光合通路基因调控网络的构建方法，包括以下步骤：1)获得物种的光合通路基因的SNP数据；2)对物种的表型性状测定，得到表型数据；3)利用所述步骤1)得到的SNP数据和所述步骤2)得到的表型数据进行基因位点间的上位性模式检测，确定两两基因间的相互作用关系；4)验证所述步骤3)得到基因间的相关性；5)以所述步骤3)得到具有相关性的基因为候选基因，构建基因调控网络；所述步骤1)和步骤2)之间没有时间顺序限制。本发明提供的构建方法综合考虑基因位点变异及生物群体表型，通过计算位点间上位性，更精确地构建基因调控网络，并且对光合作用机理的研究及其改良具有重要的理论意义和实用价值。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN108517367A
公开(公告)日：2018-09-11
申请号：CN201710230163.2
申请日：2017-04-10
Applicant: 北京林业大学
IPC: C12Q1/6895
Abstract: 本发明公开了确定林木次生生长过程中关键lncRNA及其功能的方法，其包括以下步骤：分别获得同一林木个体的维管形成层、未成熟木质部和成熟木质部的总RNA；分别针对所述维管形成层、未成熟木质部和成熟木质部的总RNA，进行cDNA文库构建及测序；基于测序结果进行lncRNA预测和注释；基于所述维管形成层、未成熟木质部和成熟木质部的lncRNA表达量，进行组织特异性表达分析，以便确定具有组织特异性的lncRNA；将所述具有组织特异性的lncRNA进行序列元件motif预测，以便确定具有组织特异性的lncRNA的motif；以及对具有组织特异性的lncRNA的motif进行功能分析。利用该方法能够有效确定林木次生生长过程中关键lncRNA及其功能，对于进一步挖掘lncRNA在林木次生生长过程中的调控作用意义重大。
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公开(公告)号：CN108504758A
公开(公告)日：2018-09-07
申请号：CN201710365480.5
申请日：2017-05-22
Applicant: 北京林业大学
IPC: C12Q1/6895
Abstract: 本发明提出了预测杨树的生物量和木材品质性状的方法、杨树选育方法、用于预测杨树的生物量和木材品质性状的试剂盒、用于预测杨树的生物量和木材品质性状的设备、杨树选育系统、预定位点的基因型在预测杨树的生物量和木材品质性状中的用途以及确定预定位点的方法。所述预测杨树的生物量和木材品质性状的方法包括：(1)确定所述杨树预定位点的基因型以及(2)基于所述预定位点的基因型，预测所述杨树的生物量和木材品质性状。由此，本发明的预测杨树的生物量和木材品质性状的方法能够预测出杨树的生物量和木材品质性状，选育出优质杨树，缩短育种周期。
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公开(公告)号：CN106599607A
公开(公告)日：2017-04-26
申请号：CN201611143308.7
申请日：2016-12-13
Applicant: 北京林业大学
IPC: G06F19/12
CPC classification number: G06F19/12
Abstract: 本发明提供了一种光合通路基因调控网络的构建方法，包括以下步骤：1)获得物种的光合通路基因的SNP数据；2)对物种的表型性状测定，得到表型数据；3)利用所述步骤1)得到的SNP数据和所述步骤2)得到的表型数据进行基因位点间的上位性模式检测，确定两两基因间的相互作用关系；4)验证所述步骤3)得到基因间的相关性；5)以所述步骤3)得到具有相关性的基因为候选基因，构建基因调控网络；所述步骤1)和步骤2)之间没有时间顺序限制。本发明提供的构建方法综合考虑基因位点变异及生物群体表型，通过计算位点间上位性，更精确地构建基因调控网络，并且对光合作用机理的研究及其改良具有重要的理论意义和实用价值。
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公开(公告)号：CN104293892A
公开(公告)日：2015-01-21
申请号：CN201310298676.9
申请日：2013-07-16
Applicant: 北京林业大学
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/6816 , C12Q2539/113
Abstract: 本发明公开了一种检测核基因组中与表型性状相关基因的方法。该方法包括以下步骤：S1，测量F1代杂交群体的目标表型性状，选取极端的目标表型性状；S2，提取极端的目标表型性状个体的RNA，采用BSA法分组后构建表达谱基因芯片；S3，根据表达谱基因芯片的信息找出表达有差异的基因，该基因即为核基因组中与目标表型性状相关基因。应用本发明的技术方案，通过多次测量筛选F1代杂交群体的目标表型性状，从中挑选具有稳定极端目标表型性状的个体，应用BSA法混合分组构建基因池，从而突出目标表型性状的差异，结合基因芯片技术使大量基因同时进行杂交，通过分析芯片结果筛选出与目标表型性状相关的差异表达基因。
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公开(公告)号：CN104293891A
公开(公告)日：2015-01-21
申请号：CN201310298649.1
申请日：2013-07-16
Applicant: 北京林业大学
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/6895 , C12Q2600/13 , C12Q2600/156
Abstract: 本发明公开了一种筛选杨树生长及材性性状的PtUXS1 SNP位点、筛选方法、试剂盒及应用。其中，该SNP位点为毛白杨尿苷二磷酸葡萄糖醛酸脱羧酶基因第463位碱基。本发明采用连锁-连锁不平衡作图策略获得杨树半纤维素合成相关基因PtUXS1内与木材品质性状（α-纤维素含量）显著关联的功能SNP标记，即毛白杨尿苷二磷酸葡萄糖醛酸脱羧酶基因第463位碱基，为开展林木全基因组水平的关联作图研究提供了重要的理论基础。本发明确定的功能SNP位点为早期筛选高纤维素含量的优异用材新种质，缩短林木育种选择周期提供了新的育种策略，对发展杨树速生丰产纸浆林、确保我国林业持续稳定地提供高得率工业纸浆原料具有重要的意义。
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