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公开(公告)号:CN112813175B
公开(公告)日:2023-07-07
申请号:CN202110342428.4
申请日:2021-03-30
Applicant: 西北农林科技大学
Inventor: 黄永震 , 丁晓婷 , 贺花 , 李欣淼 , 柴亚楠 , 刘贤 , 李克丽 , 杜雪儿 , 郑中华 , 乔小玉 , 郎利敏 , 张子敬 , 施巧婷 , 王二耀 , 茹宝瑞 , 胡沈荣 , 王建钦 , 雷初朝 , 陈宏
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6851
Abstract: 本发明公开了一种黄牛CHRDL1基因CNV标记快速辅助检测生长性状的方法及其应用:以牛血液全基因组DNA为模板,通过实时荧光定量PCR技术,用两对引物P1、P2分别对牛CHRDL1基因CNV区域、内参基因BTF3的一段区域进行扩增,根据2*2‑ΔΔCt确定个体CHRDL1基因的拷贝数变异类型为多拷贝型、缺失型或正常型。根据CHRDL1基因拷贝数变异与生长性状的关联分析结果,本发明可以在DNA水平上检测与牛生长性状密切相关的CNV标记,可用于牛生长性状的标记辅助选择,加速良种选育进程。
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公开(公告)号:CN116024354A
公开(公告)日:2023-04-28
申请号:CN202211154046.X
申请日:2022-09-21
Applicant: 西北农林科技大学 , 河南农业大学 , 泌阳县现代农业产业园服务中心
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及一种与黄牛生长性状相关的SNP分子标记、检测引物、试剂盒及育种方法。本发明的SNP分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,5’端起第96位碱基为T或G。该SNP位点能够作为黄牛品种遗传改良的分子标记,采用该分子标记对黄牛进行选育,有利于提高黄牛群体的体高性状,可应用于中国黄牛生长性状的标记辅助选择育种中,有利于性状优良的黄牛种群的遗传改良。本发明提供了检测FGF13基因SNP分子标记的引物、试剂盒,同时提供了基于FGF13基因SNP分子标记的黄牛生长性状改良育种方法,有利于缩短育种时间,加快育种进程。
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公开(公告)号:CN110564829B
公开(公告)日:2022-11-04
申请号:CN201910943149.6
申请日:2019-09-30
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6858 , C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种奶牛NCAM2基因CNV标记辅助检测泌乳性状的方法及其专用试剂盒:利用实时定量PCR技术,以中国荷斯坦奶牛基因组DNA为模板,分别用两对引物P1、P2对牛NCAM2基因的CNV标记位点和内参基因BTF3的一段区域进行扩增,最后利用2*2‑ΔΔCt的方法计算并判定个体的拷贝数变异类型,并将结果分为多拷贝型、缺失型和正常型。本发明可在DNA水平上检测与中国荷斯坦奶牛泌乳性状密切相关的CNV标记,可加快奶牛优良产乳性能的选育进程。该方法简单、快速,便于推广应用。
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公开(公告)号:CN110468218B
公开(公告)日:2022-09-02
申请号:CN201910878058.9
申请日:2019-09-17
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种山羊IGF2BP1基因插入/缺失标记的检测方法:以待测山羊全基因组DNA为模板,通过PCR扩增山羊IGF2BP1基因部分片段,再进行琼脂糖凝胶电泳,根据电泳结果鉴定山羊IGF2BP1基因15‑bp插入/缺失多态性位点和5‑bp插入/缺失多态性位点的基因型。所述山羊IGF2BP1基因的15‑bp和5‑bp插入/缺失多态性位点的不同基因型及两个位点的组合基因型与陕北白绒山羊的产羔数性状存在显著相关关系,可以作为提高山羊产羔数性状的DNA标记。本发明提供的检测山羊IGF2BP1基因插入/缺失标记的方法,可应用于山羊分子标记辅助选择育种中,加快建立优良山羊遗传资源群体。
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公开(公告)号:CN110144412B
公开(公告)日:2022-08-19
申请号:CN201910497680.5
申请日:2019-06-10
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种与南阳牛生长相关的CNV标记的检测方法及其应用:所述的CNV标记是指南阳牛SSTR2基因的拷贝数变异,该检测方法是以南阳牛基因组DNA为模板,通过实时荧光定量PCR分别扩增南阳牛SSTR2基因CNV区域和内参基因RPP30部分片段,根据2‑ΔΔCt将定量结果分为增加型、减少型和正常型,从而鉴定南阳牛SSTR2基因的拷贝数变异类型。本发明在DNA水平上检测与南阳牛生长性状密切相关的SSTR2基因的拷贝数变异,以便快速建立遗传资源优良的南阳牛种群。
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公开(公告)号:CN111321232B
公开(公告)日:2022-08-16
申请号:CN202010192466.1
申请日:2020-03-18
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6851
Abstract: 本发明公开了一种快速检测肉牛EIF4A2基因拷贝数变异的方法及其应用:基于实时定量PCR,以云岭牛基因组DNA为模板,利用一对引物扩增地方肉牛(例如,云岭牛)EIF4A2基因的拷贝数变异区域部分片段,同时利用另外一对引物扩增牛通用转录因子3基因部分片段作为内参,对定量结果进行计算,判定个体的拷贝数变异类型。本发明提供的方法建立在肉牛EIF4A2基因拷贝数变异与生长性状之间的关联基础之上,有利于加快肉牛分子标记辅助选择育种工作,该方法简单、快速,便于推广应用。
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公开(公告)号:CN110172516B
公开(公告)日:2022-05-17
申请号:CN201910218571.5
申请日:2019-03-21
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛lncFAM200B基因5'侧翼区单核苷酸多态性的方法及其应用,以中国地方黄牛全基因组DNA为模板,PCR扩增黄牛lncFAM200B基因5'侧翼区序列,再对PCR扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳和DNA测序;根据测序结果鉴定黄牛lncFAM200B基因5'侧翼区的2个单核苷酸变异;关联分析发现lncFAM200B基因5'侧翼区的这2个单核苷酸位点对生长性状具有重要调控,可作为分子标记。本发明提供的检测方法为建立lncFAM200B基因SNP与生长性状关系提供简单、快速的途径,检测结果可用于生长性状的标记辅助选择,加快建立遗传资源优良的黄牛种群。
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公开(公告)号:CN109880890B
公开(公告)日:2022-04-29
申请号:CN201910284640.2
申请日:2019-04-10
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6858 , C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种山羊HIAT1基因插入/缺失多态性的检测方法及其应用。以待测山羊全基因组DNA为模板,通过PCR扩增山羊HIAT1基因部分片段,再进行琼脂糖凝胶电泳,根据电泳结果鉴定山羊HIAT1基因NC_030810.1:g.7695‑7696位15‑bp插入/缺失多态性位点的基因型。相关分析结果发现,山羊HIAT1基因15‑bp插入/缺失多态性的不同基因型与陕北白绒山羊的生长性状存在显著相关关系,可作为提高山羊生长性状的DNA标记。本发明提供的检测山羊HIAT1基因插入/缺失多态性的方法,可应用于山羊分子标记辅助选择育种中,加快建立优良生长性状的山羊遗传资源群体。
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公开(公告)号:CN110863009B
公开(公告)日:2021-12-07
申请号:CN201911167804.X
申请日:2019-11-25
Applicant: 西北农林科技大学
Abstract: 本发明公开了一种牛KCNJ12基因真核过表达载体的构建与应用。针对秦川牛KCNJ12基因编码区设计引物,并扩增对应的牛KCNJ12基因;构建pcDNA3.1‑KCNJ12重组过表达载体,并转染细胞。本发明通过克隆牛KCNJ12基因并构建真核过表达载体,可应用于牛KCNJ12基因功能研究、鉴定和调控肌肉生长发育。
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公开(公告)号:CN112980969A
公开(公告)日:2021-06-18
申请号:CN202110374309.7
申请日:2021-04-07
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种山羊CMTM2基因CNV标记的检测方法与应用:以山羊基因组DNA为模板,以引物对P1和P2为引物,通过实时荧光定量PCR分别扩增山羊CMTM2基因CNV区域和内参基因MC1R的部分片段,根据2×2‑ΔΔCt将定量结果分为插入型、缺失型和正常型,从而鉴定山羊CMTM2基因候选区域Chr18:35601201bp‑35603200bp的CNV类型。根据CMTM2基因的CNV类型与山羊生长性状的关联分析结果,本发明可在DNA水平上检测与山羊生长性状密切相关的CNV标记,从而通过山羊生长性状的标记辅助选择,快速建立遗传资源优良的山羊种群。
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