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公开(公告)号：CN109988847B
公开(公告)日：2022-07-19
申请号：CN201910308792.1
申请日：2019-04-17
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6851
Abstract: 本发明公开了一种检测茶卡羊SHE基因CNV标记的方法及其应用：基于实时荧光定量PCR技术，以茶卡羊的血液全基因组DNA为模板，扩增茶卡羊SHE基因的拷贝数变异区域，并以扩增的茶卡羊ANKRD1基因片段作为内参，然后利用2*2‑ΔCt的方法计算个体的拷贝数变异类型。通过对拷贝数变异与生长性状进行关联分析，本发明提供的检测茶卡羊SHE基因CNV标记的方法为建立茶卡羊SHE基因拷贝数变异与体长性状之间的关联奠定了基础，可用于加快茶卡羊体长性状的选育进程，该方法简单、快速，便于推广应用。
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公开(公告)号：CN109355359B
公开(公告)日：2022-04-01
申请号：CN201811377400.9
申请日：2018-11-19
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6858 , C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种山羊MYLK4基因CNV标记的检测方法及其应用。该方法基于实时荧光定量PCR，以山羊基因组DNA为模板，扩增山羊MYLK4基因的拷贝数变异区域，接着运用‑ΔΔCt计算并根据结果判定个体的拷贝数变异类型。本发明利用个体的CNV类型与生长性状进行关联分析。本发明所提供的检测方法为MYLK4基因拷贝数变异与山羊生长性状关系的建立奠定了理论基础，该方法简单快捷，便于推广使用，有利于加快建立种质资源优良的山羊种群。
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公开(公告)号：CN113789395A
公开(公告)日：2021-12-14
申请号：CN202111277432.3
申请日：2021-10-29
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种利用Y染色体单核苷酸遗传标记鉴定瘤牛公牛来源的方法。本发明利用基因组重测序结果，对主要瘤牛群体的Y染色体DNA序列进行扫描，发现了东亚瘤牛、非洲瘤牛等瘤牛群体特有的Y染色体SNP位点，根据这些SNP位点可以在DNA水平上准确鉴别瘤牛公牛所属群体，能有效用于不同瘤牛群体的地方品种的引种及分子标记辅助育种，为快速建立遗传资源优良的瘤牛种群奠定基础。
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公开(公告)号：CN109161601B
公开(公告)日：2021-08-17
申请号：CN201811184564.X
申请日：2018-10-11
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种PLAGL1基因SNP标记辅助快速检测黄牛生长性状的方法及其应用。以黄牛基因组DNA为模板，通过PCR扩增获得黄牛PLAGL1基因部分片段；将PCR产物经限制性内切酶Nde1消化后，进行琼脂糖凝胶电泳；根据电泳结果鉴定黄牛PLAGL1基因第95141位的SNP。本发明所检测的黄牛PLAGL1基因的SNP位点的基因型，可作为与牛生长性状密切相关的分子遗传标记，用于黄牛的分子标记辅助选择，推动良种牛繁育进程。
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公开(公告)号：CN109055578B
公开(公告)日：2021-08-17
申请号：CN201811185702.6
申请日：2018-10-11
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858
Abstract: 本发明公开了一种PLAG1基因SNP标记辅助快速检测黄牛生长性状的方法及其应用：以待测黄牛全基因组DNA为模板，PCR扩增黄牛PLAG1基因的部分片段；对扩增片段酶切后进行琼脂糖凝胶电泳，实现对黄牛PLAG1基因第48308位为C>T的碱基多态性位点的检测；关联分析确定TC和CC基因型与黄牛生长性状密切相关，可作为分子遗传标记用于黄牛分子标记辅助选择育种中，从而加快建立遗传资源优良的黄牛种群。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN113151501A
公开(公告)日：2021-07-23
申请号：CN202110513334.9
申请日：2021-05-11
Applicant: 西北农林科技大学
Inventor： 黄永震 , 张家强 , 刘贤 , 张子敬 , 柴亚楠 , 李欣淼 , 杜蕾 , 李利娟 , 杨国杰 , 李志明 , 吕世杰 , 陈付英 , 施巧婷 , 王二耀 , 胡沈荣 , 茹宝瑞 , 雷初朝 , 陈宏
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种黄牛WBP1L基因CNV标记辅助检测生长性状的方法及其应用：基于实时荧光定量PCR技术，以黄牛个体基因组DNA为模板，以一对特异性引物扩增WBP1L基因拷贝数变异区域的部分片段，以另外一对特异性引物扩增BTF3基因的部分片段作为内参，最后利用‑ΔΔCt判定个体的拷贝数变异类型。本发明提供的方法基于WBP1L基因拷贝数变异与生长性状之间的关联，可用于快速建立遗传资源优势种群，有利于加快黄牛分子标记辅助选择育种工作，该方法简单、快速，便于推广应用。
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公开(公告)号：CN113005201A
公开(公告)日：2021-06-22
申请号：CN202110315036.9
申请日：2021-03-24
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/686 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种检测山羊FecB基因CNV标记的方法及其应用。基于实时荧光定量PCR技术，以山羊基因组DNA为模板，利用一对特异引物扩山羊FecB基因的拷贝数变异区域部分片段，利用另外一对特异引物扩增山羊MC1R基因部分片段作为参照，然后利用2*2‑ΔCt的方法计算个体的拷贝数变异类型，根据对拷贝数变异与山羊繁殖性状和生长性状的关联分析结果，本发明提供的方法为利用山羊FecB基因CNV标记建立优势性状种群奠定了基础，有利于加快山羊育种进程。
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公开(公告)号：CN111647649A
公开(公告)日：2020-09-11
申请号：CN202010612786.8
申请日：2020-06-30
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6858 , C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种基于CCDC39基因CNV检测辅助选择黄牛生长性状的方法：以黄牛基因组DNA为模板进行实时荧光定量PCR，利用一对特异性引物扩增CCDC39基因的拷贝数变异区域的部分片段，同时利用另外一对特异性引物扩增BTF3基因部分片段作为参考，根据2*2-ΔΔCt的方法计算并判定个体的拷贝数变异类型。与黄牛生长数据的关联分析显示，所检测的CCDC39基因拷贝数变异对黄牛的体重有显著影响，其中缺失型个体的体重显著高于正常型和多拷贝型个体。本发明提供的方法有利于加快黄牛分子标记辅助选择育种工作的进行。
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公开(公告)号：CN107523643B
公开(公告)日：2020-08-04
申请号：CN201710985278.2
申请日：2017-10-20
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种黄牛KCNJ12基因CNV标记辅助检测生长性状的方法及其专用试剂盒：基于实时荧光定量PCR技术，以郏县红牛的血液全基因组DNA为模板，利用特异引物P1扩增牛KCNJ12基因的拷贝数变异区域，同时利用另外一对特异性PCR引物R1扩增郏县红牛BTF3基因作为对照，然后利用2‑ΔΔCt的计算结果判定个体的拷贝数是否有缺失。本发明提供的方法建立在郏县红牛KCNJ12基因拷贝数缺失与生长性状之间的关联性基础之上，有利于加快黄牛分子标记辅助选择育种工作，方法简单、快速，便于推广应用。
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公开(公告)号：CN111394474A
公开(公告)日：2020-07-10
申请号：CN202010213959.9
申请日：2020-03-24
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛GAL3ST1基因拷贝数变异的方法及其应用：基于实时定量PCR，以黄牛(例如，秦川牛)基因组DNA为模板，利用一对特异性PCR引物扩增黄牛GAL3ST1基因的拷贝数变异区域的部分片段，利用另外一对特异性PCR引物扩增黄牛通用转录因子3基因部分片段作为内参，最后利用2*2-ΔΔCt的方法对定量结果进行计算并判定个体的拷贝数变异类型。本发明提供的方法建立在秦川牛GAL3ST1基因拷贝数变异与生长性状之间的关联基础之上，有利于加快黄牛分子标记辅助选择育种工作，该方法简单、快速，便于推广应用。
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