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公开(公告)号:CN107574234B
公开(公告)日:2020-05-29
申请号:CN201711015960.5
申请日:2017-10-26
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6858 , C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛ACVR1基因单核苷酸多态性的方法及其应用。以包含ACVR1基因的待测黄牛全基因组DNA为模板,以引物对1F为引物,PCR扩增黄牛ACVR1基因,其包括在黄牛ACVR1基因第41793位为C或T的碱基多态性;用限制性内切酶消化PCR扩增产物之后,再对酶切后的扩增片段进行琼脂糖凝胶电泳;根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定黄牛ACVR1基因第41793位的单核苷酸多态性;由于该方法是一种在DNA水平上筛查和检测到与黄牛生产性状密切相关的分子遗传标记,因此,可以用于中国黄牛肉用生长性状的标记辅助选择,快速建立遗传资源优良的黄牛种群。
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公开(公告)号:CN109988847A
公开(公告)日:2019-07-09
申请号:CN201910308792.1
申请日:2019-04-17
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6851
Abstract: 本发明公开了一种检测茶卡羊SHE基因CNV标记的方法及其应用:基于实时荧光定量PCR技术,以茶卡羊的血液全基因组DNA为模板,扩增茶卡羊SHE基因的拷贝数变异区域,并以扩增的茶卡羊ANKRD1基因片段作为内参,然后利用2*2‑ΔCt的方法计算个体的拷贝数变异类型。通过对拷贝数变异与生长性状进行关联分析,本发明提供的检测茶卡羊SHE基因CNV标记的方法为建立茶卡羊SHE基因拷贝数变异与体长性状之间的关联奠定了基础,可用于加快茶卡羊体长性状的选育进程,该方法简单、快速,便于推广应用。
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公开(公告)号:CN107574234A
公开(公告)日:2018-01-12
申请号:CN201711015960.5
申请日:2017-10-26
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6858 , C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛ACVR1基因单核苷酸多态性的方法及其应用。以包含ACVR1基因的待测黄牛全基因组DNA为模板,以引物对1F为引物,PCR扩增黄牛ACVR1基因,其包括在黄牛ACVR1基因第41793位为C或T的碱基多态性;用限制性内切酶消化PCR扩增产物之后,再对酶切后的扩增片段进行琼脂糖凝胶电泳;根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定黄牛ACVR1基因第41793位的单核苷酸多态性;由于该方法是一种在DNA水平上筛查和检测到与黄牛生产性状密切相关的分子遗传标记,因此,可以用于中国黄牛肉用生长性状的标记辅助选择,快速建立遗传资源优良的黄牛种群。
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公开(公告)号:CN103243155B
公开(公告)日:2016-08-17
申请号:CN201310003906.4
申请日:2013-01-06
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛CIDEC基因5’调控区多个单核苷酸多态性的方法,以包含CIDEC基因的待测黄牛全基因组DNA为模板,以引物对P(P1、P2、P3)为引物,PCR扩增黄牛CIDEC基因;用限制性内切酶HaeIII、AccI、HaeIII分别消化PCR扩增产物之后,再对酶切后的扩增片段进行琼脂糖凝胶电泳,根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定黄牛CIDEC基因第?974位、第?956位、第?501位的单核苷酸多态性,因为完全连锁,第?956位的多态性也代表了第?841,?763,?727和?546位的多态性、第?501位的多态性也代表了第?643位的单核苷酸多态性,这样检测三个位点的多态性就可以得到九个位点的多态信息。本发明提供的检测方法为CIDEC基因的单核苷酸多态性与生长性状关系的建立奠定了基础,以便用于中国黄牛肉用生长性状的标记辅助选择(MAS),快速建立遗传资源优良的黄牛种群。
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公开(公告)号:CN110157810B
公开(公告)日:2022-08-19
申请号:CN201910398624.6
申请日:2019-05-14
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种与夏南牛生长性状相关的CNV标记的检测方法及其应用:以夏南牛血液基因组DNA为模板,通过实时荧光定量PCR分别扩增夏南牛APOL3基因拷贝数变异区域和内参基因BTF3部分片段,根据2*2‑ΔΔCt将定量结果划分为增加型、减少型、正常型,从而鉴定夏南牛APOL3基因的拷贝数变异类型。本发明所检测的夏南牛APOL3基因的不同拷贝数类型与个体生长性状差异存在显著关联,通过在DNA水平上检测与夏南牛生长性状相关的CNV标记,可用于夏南牛生长性状的标记辅助选择,加快建立优质夏南牛资源群体。
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公开(公告)号:CN109988847B
公开(公告)日:2022-07-19
申请号:CN201910308792.1
申请日:2019-04-17
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6851
Abstract: 本发明公开了一种检测茶卡羊SHE基因CNV标记的方法及其应用:基于实时荧光定量PCR技术,以茶卡羊的血液全基因组DNA为模板,扩增茶卡羊SHE基因的拷贝数变异区域,并以扩增的茶卡羊ANKRD1基因片段作为内参,然后利用2*2‑ΔCt的方法计算个体的拷贝数变异类型。通过对拷贝数变异与生长性状进行关联分析,本发明提供的检测茶卡羊SHE基因CNV标记的方法为建立茶卡羊SHE基因拷贝数变异与体长性状之间的关联奠定了基础,可用于加快茶卡羊体长性状的选育进程,该方法简单、快速,便于推广应用。
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公开(公告)号:CN107523643B
公开(公告)日:2020-08-04
申请号:CN201710985278.2
申请日:2017-10-20
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种黄牛KCNJ12基因CNV标记辅助检测生长性状的方法及其专用试剂盒:基于实时荧光定量PCR技术,以郏县红牛的血液全基因组DNA为模板,利用特异引物P1扩增牛KCNJ12基因的拷贝数变异区域,同时利用另外一对特异性PCR引物R1扩增郏县红牛BTF3基因作为对照,然后利用2‑ΔΔCt的计算结果判定个体的拷贝数是否有缺失。本发明提供的方法建立在郏县红牛KCNJ12基因拷贝数缺失与生长性状之间的关联性基础之上,有利于加快黄牛分子标记辅助选择育种工作,方法简单、快速,便于推广应用。
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公开(公告)号:CN110079615A
公开(公告)日:2019-08-02
申请号:CN201910498477.X
申请日:2019-06-10
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/686 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种检测茶卡羊KMT2D基因CNV标记的方法及其应用:所述的CNV标记是指茶卡羊KMT2D基因候选区域Chr3:136830401-136832800内的拷贝数变异,以茶卡羊基因组DNA为模板,通过实时荧光定量PCR分别扩增茶卡羊KMT2D基因CNV区域和内参基因ANKRD1部分片段,根据2*2-ΔCt将定量结果分为增加型、减少型和正常型。本发明在DNA水平上检测与茶卡羊体长性状密切相关的CNV标记,可作为茶卡羊生长性状的标记辅助选择的重要候选分子标记,以便快速建立遗传资源优良的茶卡羊种群。
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公开(公告)号:CN107641657A
公开(公告)日:2018-01-30
申请号:CN201711014547.7
申请日:2017-10-26
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858
Abstract: 本发明公开了一种黄牛ACVR1基因插入/缺失的检测方法及其应用。以待测黄牛全基因组DNA为模板,以引物对P1为引物,通过PCR技术扩增ACVR1基因,再进行琼脂糖凝胶电泳,根据电泳结果鉴定ACVR1基因在AC_000159.1:g33007-33023位点存在不同的基因型。结果发现,ACVR1基因16-bp插入/缺失的不同类型与中国黄牛管围和胸围等生长发育性状之间存在显著相关,提示ACVR1基因16-bp插入/缺失可作为提高中国黄牛生长发育性状的DNA标记,有利于快速建立生长发育性状优良的黄牛遗传资源群体。
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公开(公告)号:CN107523643A
公开(公告)日:2017-12-29
申请号:CN201710985278.2
申请日:2017-10-20
Applicant: 西北农林科技大学
Abstract: 本发明公开了一种黄牛KCNJ12基因CNV标记辅助检测生长性状的方法及其专用试剂盒:基于实时荧光定量PCR技术,以郏县红牛的血液全基因组DNA为模板,利用特异引物P1扩增牛KCNJ12基因的拷贝数变异区域,同时利用另外一对特异性PCR引物R1扩增郏县红牛BTF3基因作为对照,然后利用2-ΔΔCt的计算结果判定个体的拷贝数是否有缺失。本发明提供的方法建立在郏县红牛KCNJ12基因拷贝数缺失与生长性状之间的关联性基础之上,有利于加快黄牛分子标记辅助选择育种工作,方法简单、快速,便于推广应用。
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